RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529757.5

PACS1-209, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS1, Length 1,688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-209ENST00000529757 FCGR1BQ92637 280 aa14.9□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 TEAD3Q99594 435 aa14.9□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 QPCTLQ9NXS2 382 aa14.9□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 CSAG2Q9Y5P2 127 aa14.9□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 NCKAP5O14513 1909 aa14.9□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa14.9□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 TRAV17A0A0B4J275 112 aa14.9□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 AQP7P3A6NL99 342 aa14.9□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 NPIPA5E9PKD4 350 aa14.9□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 ACOT7O00154 380 aa14.9□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 TNFSF11O14788 317 aa14.9□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 APOL3O95236 402 aa14.9□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 RENP00797 406 aa14.9□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 HLA-DOBP13765 273 aa14.9□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 ATP6V1E1P36543 226 aa14.9□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 P2RY4P51582 365 aa14.9□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 SLC25A1P53007 311 aa14.9□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 HSF1Q00613 529 aa14.9□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 UBE2UQ5VVX9 321 aa14.9□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 RNLSQ5VYX0 342 aa14.9□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 CRELD1Q96HD1 420 aa14.9□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 TAS2R16Q9NYV7 291 aa14.9□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 NPIPA1Q9UND3 350 aa14.9□□□□□ -0.02
PACS1-209ENST00000529757 A6NIZ1 184 aa14.89□□□□□ -0.03
PACS1-209ENST00000529757 RRP8O43159 456 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
PACS1-209ENST00000529757 SEC14L5O43304 696 aa14.89□□□□□ -0.03
PACS1-209ENST00000529757 ARHGEF9O43307 516 aa14.89□□□□□ -0.03
PACS1-209ENST00000529757 DNPH1O43598 174 aa14.89□□□□□ -0.03
PACS1-209ENST00000529757 SEC14L2O76054 403 aa14.89□□□□□ -0.03
PACS1-209ENST00000529757 INMTO95050 263 aa14.89□□□□□ -0.03
PACS1-209ENST00000529757 CELA3AP09093 270 aa14.89□□□□□ -0.03
PACS1-209ENST00000529757 IFNGR1P15260 489 aa14.89□□□□□ -0.03
PACS1-209ENST00000529757 SPI1P17947 270 aa14.89□□□□□ -0.03
PACS1-209ENST00000529757 MYL12AP19105 171 aa14.89□□□□□ -0.03
PACS1-209ENST00000529757 GSTT1P30711 240 aa14.89□□□□□ -0.03
PACS1-209ENST00000529757 CLDN20P56880 219 aa14.89□□□□□ -0.03
PACS1-209ENST00000529757 RAP1BP61224 184 aa14.89□□□□□ -0.03
PACS1-209ENST00000529757 RAP1AP62834 184 aa14.89□□□□□ -0.03
PACS1-209ENST00000529757 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
PACS1-209ENST00000529757 SLC35D3Q5M8T2 416 aa14.89□□□□□ -0.03
PACS1-209ENST00000529757 LCN1P1Q5VSP4 162 aa14.89□□□□□ -0.03
PACS1-209ENST00000529757 FOXB2Q5VYV0 432 aa14.89□□□□□ -0.03
PACS1-209ENST00000529757 BORAQ6PGQ7 559 aa14.89□□□□□ -0.03
PACS1-209ENST00000529757 B3GLCTQ6Y288 498 aa14.89□□□□□ -0.03
PACS1-209ENST00000529757 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa14.89□□□□□ -0.03
PACS1-209ENST00000529757 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa14.89□□□□□ -0.03
PACS1-209ENST00000529757 SLC35D2Q76EJ3 337 aa14.89□□□□□ -0.03
PACS1-209ENST00000529757 SHFQ7M4L6 423 aa14.89□□□□□ -0.03
PACS1-209ENST00000529757 GGNQ86UU5 652 aa14.89□□□□□ -0.03
PACS1-209ENST00000529757 OR4F15Q8NGB8 312 aa14.89□□□□□ -0.03
PACS1-209ENST00000529757 OR51G2Q8NGK0 314 aa14.89□□□□□ -0.03
PACS1-209ENST00000529757 OR13F1Q8NGS4 319 aa14.89□□□□□ -0.03
PACS1-209ENST00000529757 TM9SF4Q92544 642 aa14.89□□□□□ -0.03
PACS1-209ENST00000529757 SNX18Q96RF0 628 aa14.89□□□□□ -0.03
PACS1-209ENST00000529757 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
PACS1-209ENST00000529757 ASB6Q9NWX5 421 aa14.89□□□□□ -0.03
PACS1-209ENST00000529757 HAO2Q9NYQ3 351 aa14.89□□□□□ -0.03
PACS1-209ENST00000529757 B3GAT1Q9P2W7 334 aa14.89□□□□□ -0.03
PACS1-209ENST00000529757 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa14.89□□□□□ -0.03
PACS1-209ENST00000529757 ERGIC3Q9Y282 383 aa14.89□□□□□ -0.03
PACS1-209ENST00000529757 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
PACS1-209ENST00000529757 NOX1Q9Y5S8 564 aa14.89□□□□□ -0.03
PACS1-209ENST00000529757 ZFHX4Q86UP3 3567 aa14.88□□□□□ -0.03
PACS1-209ENST00000529757 H7C1C5 153 aa14.88□□□□□ -0.03
PACS1-209ENST00000529757 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
PACS1-209ENST00000529757 BCL10O95999 233 aa14.88□□□□□ -0.03
PACS1-209ENST00000529757 PTHP01270 115 aa14.88□□□□□ -0.03
PACS1-209ENST00000529757 LCKP06239 509 aa14.88□□□□□ -0.03
PACS1-209ENST00000529757 PSMB9P28065 219 aa14.88□□□□□ -0.03
PACS1-209ENST00000529757 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
PACS1-209ENST00000529757 LCN6P62502 163 aa14.88□□□□□ -0.03
PACS1-209ENST00000529757 H3F3AP84243 136 aa14.88□□□□□ -0.03
PACS1-209ENST00000529757 MELKQ14680 651 aa14.88□□□□□ -0.03
PACS1-209ENST00000529757 PON3Q15166 354 aa14.88□□□□□ -0.03
PACS1-209ENST00000529757 FAM205BPQ63HN1 556 aa14.88□□□□□ -0.03
PACS1-209ENST00000529757 TMEM225Q6GV28 225 aa14.88□□□□□ -0.03
PACS1-209ENST00000529757 UEVLDQ8IX04 471 aa14.88□□□□□ -0.03
PACS1-209ENST00000529757 FAM109AQ8N4B1 249 aa14.88□□□□□ -0.03
PACS1-209ENST00000529757 EXD3Q8N9H8 876 aa14.88□□□□□ -0.03
PACS1-209ENST00000529757 ASB10Q8WXI3 467 aa14.88□□□□□ -0.03
PACS1-209ENST00000529757 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa14.88□□□□□ -0.03
PACS1-209ENST00000529757 OXGR1Q96P68 337 aa14.88□□□□□ -0.03
PACS1-209ENST00000529757 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
PACS1-209ENST00000529757 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
PACS1-209ENST00000529757 RASD1Q9Y272 281 aa14.88□□□□□ -0.03
PACS1-209ENST00000529757 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
PACS1-209ENST00000529757 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa14.87□□□□□ -0.03
PACS1-209ENST00000529757 PRSS37A4D1T9 235 aa14.87□□□□□ -0.03
PACS1-209ENST00000529757 ZNF814B7Z6K7 855 aa14.87□□□□□ -0.03
PACS1-209ENST00000529757 STARP49675 285 aa14.87□□□□□ -0.03
PACS1-209ENST00000529757 GP2P55259 537 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
PACS1-209ENST00000529757 RAC3P60763 192 aa14.87□□□□□ -0.03
PACS1-209ENST00000529757 POU4F2Q12837 409 aa14.87□□□□□ -0.03
PACS1-209ENST00000529757 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7 ms