RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523288.5

FAM49B-225, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, human

TSL 2

Gene FAM49B, Length 4,552 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM49B-225	ENST00000523288	ELL3	Q9HB65	397 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	PARP11	Q9NR21	331 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	UPB1	Q9UBR1	384 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	ANGPT4	Q9Y264	503 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	SPIN1	Q9Y657	262 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	EDDM13	A0A1B0GTR0	161 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288		H3BN98	237 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	GABRD	O14764	452 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	PLPP2	O43688	288 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	DNAJB6	O75190	326 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	LY86	O95711	162 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	CCKBR	P32239	447 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	CXCL12	P48061	93 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	DVL1P1	P54792	670 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	CDH11	P55287	796 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	POU4F2	Q12837	409 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	RSU1	Q15404	277 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	MED22	Q15528	200 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	SYPL1	Q16563	259 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	FAM187B	Q17R55	369 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	MST1L	Q2TV78	715 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	BSX	Q3C1V8	233 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	ZNF805	Q5CZA5	627 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	SFRP5	Q5T4F7	317 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	ZDHHC20	Q5W0Z9	365 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	ZNF385C	Q66K41	422 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	ANKRD34A	Q69YU3	496 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	RPL22L1	Q6P5R6	122 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	IL20RB	Q6UXL0	311 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	SLC35D2	Q76EJ3	337 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	LAPTM4B	Q86VI4	370 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	AMZ2	Q86W34	360 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	NUDT13	Q86X67	352 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	BAP18	Q8IXM2	172 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	APCDD1	Q8J025	514 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	OR52P1P	Q8NH57	321 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	JOSD2	Q8TAC2	188 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	UBTD2	Q8WUN7	234 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	SMARCD2	Q92925	531 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	MVB12A	Q96EY5	273 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	TMEM19	Q96HH6	336 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	SUSD3	Q96L08	255 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	ZIC5	Q96T25	663 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	CDC6	Q99741	560 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	AARSD1	Q9BTE6	412 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	NDC1	Q9BTX1	674 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	MAGEH1	Q9H213	219 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	IRAK3	Q9Y616	596 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	COL4A2	P08572	1712 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	DNAH7	Q8WXX0	4024 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288		A0A1W2PPE3	182 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	ANKRD20A5P	A0PJZ0	165 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	TLR4	O00206	839 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	LEFTY2	O00292	366 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	KCNAB3	O43448	404 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	KHDRBS3	O75525	346 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	CLDN9	O95484	217 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	NR2C1	P13056	603 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	ZNF37A	P17032	561 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	PRKACG	P22612	351 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	BDKRB2	P30411	391 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	ADRA1A	P35348	466 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	BUD31	P41223	144 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	GSK3A	P49840	483 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	PPT1	P50897	306 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	CRISP1	P54107	249 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	RAN	P62826	216 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	VLDLR	P98155	873 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	DOC2B	Q14184	412 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	ACTBL2	Q562R1	376 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	ZNF770	Q6IQ21	691 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	ZNF529	Q6P280	563 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	DEF8	Q6ZN54	512 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	SIAH3	Q8IW03	269 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	TDH	Q8IZJ6	230 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	PTGR2	Q8N8N7	351 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	POGLUT1	Q8NBL1	392 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	OR4K5	Q8NGD3	323 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	OR10AD1	Q8NGE0	317 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	TRMT10A	Q8TBZ6	339 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	NUS1	Q96E22	293 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	LINGO1	Q96FE5	620 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	TAAR6	Q96RI8	345 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	SULT4A1	Q9BR01	284 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	CACNG6	Q9BXT2	260 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	SLC25A31	Q9H0C2	315 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	SLAMF7	Q9NQ25	335 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	LHX9	Q9NQ69	397 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	INPP5E	Q9NRR6	644 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	IL36A	Q9UHA7	158 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	EIF2B4	Q9UI10	523 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	SCN8A	Q9UQD0	1980 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	YJEFN3	A6XGL0	299 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-225	ENST00000523288	VSTM5	A8MXK1	200 aa		3.55	□□□□□ -1.84

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