RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511807.1

UBE2B-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 818 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-208ENST00000511807 CLCF1Q9UBD9 225 aa10.1□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF229Q9UJW7 825 aa10.1□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 POFUT2Q9Y2G5 429 aa10.1□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 CORINQ9Y5Q5 1042 aa10.1□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 A0A0J9YW62 118 aa10.09□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 A0A1W2PNR3 127 aa10.09□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 UNC119BA6NIH7 251 aa10.09□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 LIPT2A6NK58 231 aa10.09□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 SEC14L5O43304 696 aa10.09□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 DNPH1O43598 174 aa10.09□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP10.09□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 HPRP00739 348 aa10.09□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 BGLAPP02818 100 aa10.09□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 POU2F1P14859 743 aa10.09□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF708P17019 499 aa10.09□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 MAKP20794 623 aa10.09□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 CBLP22681 906 aa10.09□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 PEX2P28328 305 aa10.09□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 GPR4P46093 362 aa10.09□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 GSSP48637 474 aa10.09□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 DIO1P49895 249 aa10.09□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 LHX2P50458 406 aa10.09□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 DAPP51397 102 aa10.09□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 ALDH3A2P51648 485 aa10.09□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 RAD23AP54725 363 aa10.09□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 CLDN18P56856 261 aa10.09□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 OR2B6P58173 313 aa10.09□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 RAC3P60763 192 aa10.09□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 OR7A5Q15622 319 aa10.09□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 SGCBQ16585 318 aa10.09□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 RFX4Q33E94 735 aa10.09□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 KDM4DQ6B0I6 523 aa10.09□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 HBMQ6B0K9 141 aa10.09□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 Q71RC1 249 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 P4HA3Q7Z4N8 544 aa10.09□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa10.09□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 OAFQ86UD1 273 aa10.09□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 EPHX4Q8IUS5 362 aa10.09□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 UBQLNLQ8IYU4 475 aa10.09□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 OR2V1Q8NHB1 315 aa10.09□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 OSTF1Q92882 214 aa10.09□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 UCN2Q96RP3 112 aa10.09□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 PTDSS2Q9BVG9 487 aa10.09□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 SMURF2Q9HAU4 748 aa10.09□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 KRT84Q9NSB2 600 aa10.09□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 USE1Q9NZ43 259 aa10.09□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 NDRG3Q9UGV2 375 aa10.09□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 ITPR3Q14573 2671 aa10.09□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 A0A1W2PNV4 684 aa10.08□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 A0A1W2PPR1 153 aa10.08□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 A8MXE2 369 aa10.08□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 SOCS2O14508 198 aa10.08□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 EI24O14681 340 aa10.08□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 TNFSF11O14788 317 aa10.08□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 KLF4O43474 513 aa10.08□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 TNFSF13O75888 250 aa10.08□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 OR6A2O95222 327 aa10.08□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 SYNGR4O95473 234 aa10.08□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 TGM6O95932 706 aa10.08□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 ALPLP05186 524 aa10.08□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 IMPDH2P12268 514 aa10.08□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 CD53P19397 219 aa10.08□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 IGFBP5P24593 272 aa10.08□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 SHC1P29353 583 aa10.08□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 HOXC12P31275 282 aa10.08□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 VHLP40337 213 aa10.08□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 CLDN15P56746 228 aa10.08□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 CLDN20P56880 219 aa10.08□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 PRPS1P60891 318 aa10.08□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 PPP2R2BQ00005 443 aa10.08□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 IL1RL1Q01638 556 aa10.08□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 PMS2P3Q13401 168 aa10.08□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 ZBED5Q49AG3 693 aa10.08□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa10.08□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa10.08□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa10.08□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa10.08□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 BIVMQ86UB2 503 aa10.08□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 GGNQ86UU5 652 aa10.08□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 GALNT4Q8N4A0 578 aa10.08□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa10.08□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 SCAIQ8N9R8 606 aa10.08□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 OR5J2Q8NH18 312 aa10.08□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 C18orf12Q96KH6 178 aa10.08□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 SLC29A1Q99808 456 aa10.08□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 SMR3AQ99954 134 aa10.08□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa10.08□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa10.08□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.2 ms