RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-208ENST00000504294 FAM86B1Q8N7N1 296 aa12.86□□□□□ -0.35
SH3BP2-208ENST00000504294 ZIC4Q8N9L1 334 aa12.86□□□□□ -0.35
SH3BP2-208ENST00000504294 OR6X1Q8NH79 312 aa12.86□□□□□ -0.35
SH3BP2-208ENST00000504294 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
SH3BP2-208ENST00000504294 ALPK1Q96QP1 1244 aa12.86□□□□□ -0.35
SH3BP2-208ENST00000504294 ACTR6Q9GZN1 396 aa12.86□□□□□ -0.35
SH3BP2-208ENST00000504294 OBP2BQ9NPH6 170 aa12.86□□□□□ -0.35
SH3BP2-208ENST00000504294 TAS2R5Q9NYW4 299 aa12.86□□□□□ -0.35
SH3BP2-208ENST00000504294 B3GAT1Q9P2W7 334 aa12.86□□□□□ -0.35
SH3BP2-208ENST00000504294 TESMINQ9Y4I5 508 aa12.86□□□□□ -0.35
SH3BP2-208ENST00000504294 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP2-208ENST00000504294 SH3PXD2BA1X283 911 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP2-208ENST00000504294 C11orf98E9PRG8 122 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP2-208ENST00000504294 TNFRSF11BO00300 401 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP2-208ENST00000504294 TSPAN19P0C672 248 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP2-208ENST00000504294 COL8A1P27658 744 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP2-208ENST00000504294 NR1H2P55055 460 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP2-208ENST00000504294 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
SH3BP2-208ENST00000504294 ZBED5Q49AG3 693 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP2-208ENST00000504294 IQCCQ4KMZ1 466 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP2-208ENST00000504294 ALG10Q5BKT4 473 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP2-208ENST00000504294 C1orf146Q5VVC0 180 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP2-208ENST00000504294 OR2T5Q6IEZ7 315 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP2-208ENST00000504294 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP2-208ENST00000504294 KLHL24Q6TFL4 600 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP2-208ENST00000504294 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
SH3BP2-208ENST00000504294 KDM8Q8N371 416 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP2-208ENST00000504294 OR4K5Q8NGD3 323 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP2-208ENST00000504294 OR6N1Q8NGY5 312 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP2-208ENST00000504294 OR2T29Q8NH02 315 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF566Q969W8 418 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
SH3BP2-208ENST00000504294 BOD1Q96IK1 185 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP2-208ENST00000504294 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
SH3BP2-208ENST00000504294 CRIM1Q9NZV1 1036 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC7A8Q9UHI5 535 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP2-208ENST00000504294 PRSS50Q9UI38 385 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP2-208ENST00000504294 MAST4O15021 2626 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP2-208ENST00000504294 COL12A1Q99715 3063 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP2-208ENST00000504294 A6NIZ1 184 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP2-208ENST00000504294 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP2-208ENST00000504294 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
SH3BP2-208ENST00000504294 OR10H3O60404 316 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF432O94892 652 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP2-208ENST00000504294 WNT11O96014 354 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP2-208ENST00000504294 CST1P01037 141 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP2-208ENST00000504294 IGHG1P01857 330 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP2-208ENST00000504294 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
SH3BP2-208ENST00000504294 RAP1BP61224 184 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP2-208ENST00000504294 RAP1AP62834 184 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP2-208ENST00000504294 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
SH3BP2-208ENST00000504294 TSPO2Q5TGU0 170 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP2-208ENST00000504294 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
SH3BP2-208ENST00000504294 LRRC17Q8N6Y2 441 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
SH3BP2-208ENST00000504294 OR52J3Q8NH60 311 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP2-208ENST00000504294 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP2-208ENST00000504294 MUS81Q96NY9 551 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP2-208ENST00000504294 OR2M2Q96R28 347 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP2-208ENST00000504294 CHID1Q9BWS9 393 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC7A10Q9NS82 523 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP2-208ENST00000504294 C20orf141Q9NUB4 165 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP2-208ENST00000504294 AMDHD2Q9Y303 409 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP2-208ENST00000504294 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa12.83□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC35F4A4IF30 521 aa12.83□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 A6NNC1 897 aa12.83□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 LRRN3E7EW58 273 aa12.83□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 CLOCKO15516 846 aa12.83□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 AHCYL1O43865 530 aa12.83□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 DIRAS1O95057 198 aa12.83□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 CCNB2O95067 398 aa12.83□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 NDUFB2O95178 105 aa12.83□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 FCGR1AP12314 374 aa12.83□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 IFNGR1P15260 489 aa12.83□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 PTNP21246 168 aa12.83□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 GSTM3P21266 225 aa12.83□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 CRYGSP22914 178 aa12.83□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 IGHV1-2P23083 117 aa12.83□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 RPL4P36578 427 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 AQP2P41181 271 aa12.83□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 OMPP47874 163 aa12.83□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 CSNK1A1P48729 337 aa12.83□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 SELENOPP49908 381 aa12.83□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 BEX5Q5H9J7 111 aa12.83□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 GPR139Q6DWJ6 353 aa12.83□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 KLHL17Q6TDP4 642 aa12.83□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 ASRGL1Q7L266 308 aa12.83□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 C20orf196Q8IYI0 205 aa12.83□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 ADGRG5Q8IZF4 528 aa12.83□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 LINC01560Q8TB33 94 aa12.83□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 CANT1Q8WVQ1 401 aa12.83□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa12.83□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 ULBP2Q9BZM5 246 aa12.83□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 TXNIPQ9H3M7 391 aa12.83□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.2 ms