RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469947.5

SH3BP1-206, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,612 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-206ENST00000469947 DUX4L7P0CJ90 424 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 GPR85P60893 370 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 GUCA2BQ16661 112 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF765Q7L2R6 523 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 TMEM17Q86X19 198 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 RAB42Q8N4Z0 105 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 PHYHIPQ92561 330 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 TMEM27Q9HBJ8 222 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF304Q9HCX3 659 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 DUX4Q9UBX2 424 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 CHRNA9Q9UGM1 479 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 CHD7Q9P2D1 2997 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 CTNSO60931 367 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 TMEM127O75204 238 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 MOSPD3O75425 235 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 RASGRP1O95267 797 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 THBS1P07996 1170 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 RAB40ALP0C0E4 278 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 EMDP50402 254 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP12.36□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 DEFB103AP81534 67 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 SCRN3Q0VDG4 424 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 DHCR24Q15392 516 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP12.36□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 OR51D1Q8NGF3 324 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 OR51A4Q8NGJ6 313 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 OR14A16Q8NHC5 309 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 RAB40AQ8WXH6 277 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 OR8D1Q8WZ84 308 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 LRRC3BQ96PB8 259 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 SLC19A3Q9BZV2 496 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 POFUT1Q9H488 388 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 TRAV18A0A075B6X5 111 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 PQLC2LA1A4F0 135 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 DISC1C4P0D8 188 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 UBBP0CG47 229 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 MGMTP16455 207 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 SPI1P17947 270 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 GABRA3P34903 492 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 P2RY2P41231 377 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 VASPP50552 380 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 UBA52P62987 128 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 CEBPEQ15744 281 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF77Q15935 545 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 ALG10BQ5I7T1 473 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 BIVMQ86UB2 503 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 OR4K14Q8NGD5 310 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 C2CD4CQ8TF44 421 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 FGF13Q92913 245 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 SEC22AQ96IW7 307 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 PTDSS2Q9BVG9 487 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 TMEM72A0PK05 275 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 PRSS44E7EML9 344 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 H7C417 338 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 M0QYG6 137 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 RAD1O60671 282 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 FAUP35544 74 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP12.35□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 LY6G6FQ5SQ64 297 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 ZFP82Q8N141 532 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 POMGNT2Q8NAT1 580 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 APMAPQ9HDC9 416 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 ASF1BQ9NVP2 202 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 MTFP1Q9UDX5 166 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 INSL6Q9Y581 213 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 NOTCH4Q99466 2003 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 COL4A6Q14031 1691 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 A0A0B4J2E0 115 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 A0A1B0GX12 115 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 RFPL4AA6NLU0 287 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 GPRIN2O60269 458 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 ATG12O94817 140 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 CSN2P05814 226 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 CISD3P0C7P0 127 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 CNR1P21554 472 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 DIO1P49895 249 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 LIN54Q6MZP7 749 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 OR2W3Q7Z3T1 314 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 VN1R4Q7Z5H5 301 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 BEST3Q8N1M1 668 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 LINC00469Q8N7U9 141 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 ASB13Q8WXK3 278 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 GRXCR1A8MXD5 290 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 RAB13P51153 203 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 LDLRAD3Q86YD5 345 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 OR1S2Q8NGQ3 325 aa12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms