RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469757.1

TRAPPC3-206, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC3, Length 221 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-206ENST00000469757 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 A0A1W2PPR1 153 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 SH3PXD2BA1X283 911 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 AQP12BA6NM10 295 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 ZNF587BE7ETH6 402 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 hCG_2039718K7EN88 272 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 CDC42EP2O14613 210 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 GYG2O15488 501 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 SLC43A1O75387 559 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 ATP5HO75947 161 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 IGHV3-9P01782 118 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 ADORA3P0DMS8 318 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 IFI30P13284 250 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 MAKP20794 623 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 YAP1P46937 504 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 OMPP47874 163 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 RASSF2P50749 326 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 DAP3P51398 398 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 NR1H2P55055 460 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 CLDN17P56750 224 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 SMIM11AP58511 58 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 MS4A2Q01362 244 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 TGFBR3Q03167 851 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 LGALS3BPQ08380 585 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 FAPQ12884 760 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 C1DQ13901 141 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 SEC23BQ15437 767 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 TAF11Q15544 211 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 TAB1Q15750 504 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 GABRA6Q16445 453 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 HIST3H3Q16695 136 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 BEX5Q5H9J7 111 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 ARMC4Q5T2S8 1044 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 NIPAL3Q6P499 406 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 PODNL1Q6PEZ8 512 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 CYP2R1Q6VVX0 501 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 ZNF730Q6ZMV8 503 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 WDFY1Q8IWB7 410 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 AQP12AQ8IXF9 295 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 C20orf196Q8IYI0 205 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 ADGRG5Q8IZF4 528 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 KDM8Q8N371 416 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 C10orf53Q8N6V4 93 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 LRRC75AQ8NAA5 344 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 OR4K5Q8NGD3 323 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 HSD17B8Q92506 261 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 MCUR1Q96AQ8 359 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 CLPTM1LQ96KA5 538 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 MUS81Q96NY9 551 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 ZNF347Q96SE7 839 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 NELFAQ9H3P2 528 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 MED29Q9NX70 200 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 RHCGQ9UBD6 479 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 SLC25A15Q9Y619 301 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 V9GYQ6 96 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 SLC35F4A4IF30 521 aa7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 CLOCKO15516 846 aa7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 UPK3AO75631 287 aa7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 RAD51DO75771 328 aa7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 HIST1H2ABP04908 130 aa7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 PGA4P0DJD7 388 aa7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 PGA3P0DJD8 388 aa7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 IFNGR1P15260 489 aa7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 FUT1P19526 365 aa7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 CBLP22681 906 aa7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 PAX7P23759 505 aa7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 FPR3P25089 353 aa7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 AQP2P41181 271 aa7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 HMGA2P52926 109 aa7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 KRTAP10-9P60411 292 aa7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 TSC22D1Q15714 1073 aa7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 NRN1LQ496H8 165 aa7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 FGD3Q5JSP0 725 aa7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 FAM205BPQ63HN1 556 aa7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 PAMR1Q6UXH9 720 aa7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 SLC35D2Q76EJ3 337 aa7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 UBE2J2Q8N2K1 259 aa7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 NOXO1Q8NFA2 376 aa7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 OR4C15Q8NGM1 316 aa7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 OR1K1Q8NGR3 316 aa7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 OR13C2Q8NGS9 318 aa7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 ZNF519Q8TB69 540 aa7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 ASB10Q8WXI3 467 aa7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 HIST1H2ACQ93077 130 aa7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms