RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463372.5

C9orf3-211, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 919 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-211ENST00000463372 ZNF75AQ96N20 296 aa11.06□□□□□ -0.64
C9orf3-211ENST00000463372 TXNDC16Q9P2K2 825 aa11.06□□□□□ -0.64
C9orf3-211ENST00000463372 SLC17A7Q9P2U7 560 aa11.06□□□□□ -0.64
C9orf3-211ENST00000463372 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
C9orf3-211ENST00000463372 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa11.05□□□□□ -0.64
C9orf3-211ENST00000463372 TOX4O94842 621 aa11.05□□□□□ -0.64
C9orf3-211ENST00000463372 CSTAP01040 98 aa11.05□□□□□ -0.64
C9orf3-211ENST00000463372 GPIP06744 558 aa11.05□□□□□ -0.64
C9orf3-211ENST00000463372 CHRM2P08172 466 aa11.05□□□□□ -0.64
C9orf3-211ENST00000463372 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
C9orf3-211ENST00000463372 HSD3B1P14060 373 aa11.05□□□□□ -0.64
C9orf3-211ENST00000463372 HSD3B2P26439 372 aa11.05□□□□□ -0.64
C9orf3-211ENST00000463372 ERVS71-1P61550 626 aa11.05□□□□□ -0.64
C9orf3-211ENST00000463372 RAB1AP62820 205 aa11.05□□□□□ -0.64
C9orf3-211ENST00000463372 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
C9orf3-211ENST00000463372 CAMK2DQ13557 499 aa11.05□□□□□ -0.64
C9orf3-211ENST00000463372 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
C9orf3-211ENST00000463372 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa11.05□□□□□ -0.64
C9orf3-211ENST00000463372 PDZK1Q5T2W1 519 aa11.05□□□□□ -0.64
C9orf3-211ENST00000463372 ZNF774Q6NX45 483 aa11.05□□□□□ -0.64
C9orf3-211ENST00000463372 RHEBL1Q8TAI7 183 aa11.05□□□□□ -0.64
C9orf3-211ENST00000463372 CLPTM1LQ96KA5 538 aa11.05□□□□□ -0.64
C9orf3-211ENST00000463372 MUC4Q99102 2169 aa11.05□□□□□ -0.64
C9orf3-211ENST00000463372 STACQ99469 402 aa11.05□□□□□ -0.64
C9orf3-211ENST00000463372 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
C9orf3-211ENST00000463372 DUSP22Q9NRW4 184 aa11.05□□□□□ -0.64
C9orf3-211ENST00000463372 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
C9orf3-211ENST00000463372 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa11.05□□□□□ -0.64
C9orf3-211ENST00000463372 URI1O94763 535 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
C9orf3-211ENST00000463372 VAMP5O95183 116 aa11.04□□□□□ -0.64
C9orf3-211ENST00000463372 IGHV3-13P01766 116 aa11.04□□□□□ -0.64
C9orf3-211ENST00000463372 EPHA3P29320 983 aa11.04□□□□□ -0.64
C9orf3-211ENST00000463372 CFHR2P36980 270 aa11.04□□□□□ -0.64
C9orf3-211ENST00000463372 FNTAP49354 379 aa11.04□□□□□ -0.64
C9orf3-211ENST00000463372 CEACAM7Q14002 265 aa11.04□□□□□ -0.64
C9orf3-211ENST00000463372 RAB39AQ14964 217 aa11.04□□□□□ -0.64
C9orf3-211ENST00000463372 OR7A5Q15622 319 aa11.04□□□□□ -0.64
C9orf3-211ENST00000463372 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa11.04□□□□□ -0.64
C9orf3-211ENST00000463372 COX20Q5RI15 118 aa11.04□□□□□ -0.64
C9orf3-211ENST00000463372 DCST2Q5T1A1 773 aa11.04□□□□□ -0.64
C9orf3-211ENST00000463372 COMTD1Q86VU5 262 aa11.04□□□□□ -0.64
C9orf3-211ENST00000463372 KLBQ86Z14 1044 aa11.04□□□□□ -0.64
C9orf3-211ENST00000463372 GATAD1Q8WUU5 269 aa11.04□□□□□ -0.64
C9orf3-211ENST00000463372 DCAKDQ8WVC6 231 aa11.04□□□□□ -0.64
C9orf3-211ENST00000463372 CCDC126Q96EE4 140 aa11.04□□□□□ -0.64
C9orf3-211ENST00000463372 GPR22Q99680 433 aa11.04□□□□□ -0.64
C9orf3-211ENST00000463372 EXD2Q9NVH0 621 aa11.04□□□□□ -0.64
C9orf3-211ENST00000463372 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
C9orf3-211ENST00000463372 MIOXQ9UGB7 285 aa11.04□□□□□ -0.64
C9orf3-211ENST00000463372 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa11.03□□□□□ -0.64
C9orf3-211ENST00000463372 NPIPB9F8W1W9 429 aa11.03□□□□□ -0.64
C9orf3-211ENST00000463372 ZNF208O43345 1280 aa11.03□□□□□ -0.64
C9orf3-211ENST00000463372 ENSAO43768 121 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
C9orf3-211ENST00000463372 CHRM4P08173 479 aa11.03□□□□□ -0.64
C9orf3-211ENST00000463372 FBP1P09467 338 aa11.03□□□□□ -0.64
C9orf3-211ENST00000463372 RYKP34925 604 aa11.03□□□□□ -0.64
C9orf3-211ENST00000463372 HTR3AP46098 478 aa11.03□□□□□ -0.64
C9orf3-211ENST00000463372 TTC27Q6P3X3 843 aa11.03□□□□□ -0.64
C9orf3-211ENST00000463372 RNF130Q86XS8 419 aa11.03□□□□□ -0.64
C9orf3-211ENST00000463372 EPHX4Q8IUS5 362 aa11.03□□□□□ -0.64
C9orf3-211ENST00000463372 PDIK1LQ8N165 341 aa11.03□□□□□ -0.64
C9orf3-211ENST00000463372 OR5R1Q8NH85 324 aa11.03□□□□□ -0.64
C9orf3-211ENST00000463372 ZFP28Q8NHY6 868 aa11.03□□□□□ -0.64
C9orf3-211ENST00000463372 LHX4Q969G2 390 aa11.03□□□□□ -0.64
C9orf3-211ENST00000463372 APIPQ96GX9 242 aa11.03□□□□□ -0.64
C9orf3-211ENST00000463372 GPR78Q96P69 363 aa11.03□□□□□ -0.64
C9orf3-211ENST00000463372 BCL2L14Q9BZR8 327 aa11.03□□□□□ -0.64
C9orf3-211ENST00000463372 PIGUQ9H490 435 aa11.03□□□□□ -0.64
C9orf3-211ENST00000463372 RCE1Q9Y256 329 aa11.03□□□□□ -0.64
C9orf3-211ENST00000463372 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
C9orf3-211ENST00000463372 TMED7Q9Y3B3 224 aa11.03□□□□□ -0.64
C9orf3-211ENST00000463372 TMEM72A0PK05 275 aa11.02□□□□□ -0.65
C9orf3-211ENST00000463372 PDPK1O15530 556 aa11.02□□□□□ -0.65
C9orf3-211ENST00000463372 PIAS1O75925 651 aa11.02□□□□□ -0.65
C9orf3-211ENST00000463372 UBL3O95164 117 aa11.02□□□□□ -0.65
C9orf3-211ENST00000463372 CHN1P15882 459 aa11.02□□□□□ -0.65
C9orf3-211ENST00000463372 FAHP16930 419 aa11.02□□□□□ -0.65
C9orf3-211ENST00000463372 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
C9orf3-211ENST00000463372 CLDN17P56750 224 aa11.02□□□□□ -0.65
C9orf3-211ENST00000463372 PMS2P3Q13401 168 aa11.02□□□□□ -0.65
C9orf3-211ENST00000463372 RASA2Q15283 850 aa11.02□□□□□ -0.65
C9orf3-211ENST00000463372 SLC27A4Q6P1M0 643 aa11.02□□□□□ -0.65
C9orf3-211ENST00000463372 ZNF813Q6ZN06 617 aa11.02□□□□□ -0.65
C9orf3-211ENST00000463372 NLRC3Q7RTR2 1065 aa11.02□□□□□ -0.65
C9orf3-211ENST00000463372 PTOV1Q86YD1 416 aa11.02□□□□□ -0.65
C9orf3-211ENST00000463372 ZNF283Q8N7M2 679 aa11.02□□□□□ -0.65
C9orf3-211ENST00000463372 DTX3Q8N9I9 347 aa11.02□□□□□ -0.65
C9orf3-211ENST00000463372 PPP1R35Q8TAP8 253 aa11.02□□□□□ -0.65
C9orf3-211ENST00000463372 NSMAFQ92636 917 aa11.02□□□□□ -0.65
C9orf3-211ENST00000463372 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
C9orf3-211ENST00000463372 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
C9orf3-211ENST00000463372 RNF121Q9H920 327 aa11.02□□□□□ -0.65
C9orf3-211ENST00000463372 CDH20Q9HBT6 801 aa11.02□□□□□ -0.65
C9orf3-211ENST00000463372 CYSLTR2Q9NS75 346 aa11.02□□□□□ -0.65
C9orf3-211ENST00000463372 ADPRHL2Q9NX46 363 aa11.02□□□□□ -0.65
C9orf3-211ENST00000463372 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
C9orf3-211ENST00000463372 ZNRD1Q9P1U0 126 aa11.02□□□□□ -0.65
C9orf3-211ENST00000463372 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa11.02□□□□□ -0.65
C9orf3-211ENST00000463372 A0A1W2PRX2 142 aa11.01□□□□□ -0.65
C9orf3-211ENST00000463372 LIPT2A6NK58 231 aa11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms