RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 NCKAP5O14513 1909 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
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PTPRC-210ENST00000462363 PLPP3O14495 311 aa5.09□□□□□ -1.59
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PTPRC-210ENST00000462363 ZNF208O43345 1280 aa5.09□□□□□ -1.59
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PTPRC-210ENST00000462363 ZFAND5O76080 213 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 AKR7A3O95154 331 aa5.09□□□□□ -1.59
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PTPRC-210ENST00000462363 F13BP05160 661 aa5.09□□□□□ -1.59
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PTPRC-210ENST00000462363 CD59P13987 128 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 HPGDP15428 266 aa5.09□□□□□ -1.59
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PTPRC-210ENST00000462363 ALOX5APP20292 161 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 CFL1P23528 166 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP5.09□□□□□ -1.591e-6■■■■□ 23
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PTPRC-210ENST00000462363 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
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PTPRC-210ENST00000462363 BCAP31P51572 246 aa5.09□□□□□ -1.59
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PTPRC-210ENST00000462363 MAP2K6P52564 334 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 HCCSP53701 268 aa5.09□□□□□ -1.59
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PTPRC-210ENST00000462363 CTXN1P60606 82 aa5.09□□□□□ -1.59
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PTPRC-210ENST00000462363 ACTG2P63267 376 aa5.09□□□□□ -1.59
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PTPRC-210ENST00000462363 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
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PTPRC-210ENST00000462363 PON3Q15166 354 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 PCK2Q16822 640 aa5.09□□□□□ -1.59
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PTPRC-210ENST00000462363 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
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PTPRC-210ENST00000462363 OR2Y1Q8NGV0 311 aa5.09□□□□□ -1.59
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PTPRC-210ENST00000462363 RNF217Q8TC41 542 aa5.09□□□□□ -1.59
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PTPRC-210ENST00000462363 PROK2Q9HC23 129 aa5.09□□□□□ -1.59
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PTPRC-210ENST00000462363 KLHL1Q9NR64 748 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 ETAA1Q9NY74 926 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 B3GAT1Q9P2W7 334 aa5.09□□□□□ -1.59
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