RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 HIST1H2ACQ93077 130 aa20.98■□□□□ 0.95
SMKR1-201ENST00000462322 TXNDC15Q96J42 360 aa20.98■□□□□ 0.95
SMKR1-201ENST00000462322 EMC6Q9BV81 110 aa20.98■□□□□ 0.95
SMKR1-201ENST00000462322 GSX2Q9BZM3 304 aa20.98■□□□□ 0.95
SMKR1-201ENST00000462322 ALG2Q9H553 416 aa20.98■□□□□ 0.95
SMKR1-201ENST00000462322 GPR35Q9HC97 309 aa20.98■□□□□ 0.95
SMKR1-201ENST00000462322 OBP2BQ9NPH6 170 aa20.98■□□□□ 0.95
SMKR1-201ENST00000462322 POU2F3Q9UKI9 436 aa20.98■□□□□ 0.95
SMKR1-201ENST00000462322 PLCE1Q9P212 2302 aa20.97■□□□□ 0.95
SMKR1-201ENST00000462322 A0A096LPE4 126 aa20.97■□□□□ 0.95
SMKR1-201ENST00000462322 A0A1W2PPZ6 126 aa20.97■□□□□ 0.95
SMKR1-201ENST00000462322 SLC35F4A4IF30 521 aa20.97■□□□□ 0.95
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF726A6NNF4 738 aa20.97■□□□□ 0.95
SMKR1-201ENST00000462322 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa20.97■□□□□ 0.95
SMKR1-201ENST00000462322 SOD3P08294 240 aa20.97■□□□□ 0.95
SMKR1-201ENST00000462322 DANCRP0C864 163 aa20.97■□□□□ 0.95
SMKR1-201ENST00000462322 UMPSP11172 480 aa20.97■□□□□ 0.95
SMKR1-201ENST00000462322 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
SMKR1-201ENST00000462322 PSME3P61289 254 aa20.97■□□□□ 0.95
SMKR1-201ENST00000462322 ARF1P84077 181 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
SMKR1-201ENST00000462322 SPOCK1Q08629 439 aa20.97■□□□□ 0.95
SMKR1-201ENST00000462322 ANKRD16Q6P6B7 361 aa20.97■□□□□ 0.95
SMKR1-201ENST00000462322 NKAIN4Q8IVV8 208 aa20.97■□□□□ 0.95
SMKR1-201ENST00000462322 DEPDC4Q8N2C3 294 aa20.97■□□□□ 0.95
SMKR1-201ENST00000462322 LRRC17Q8N6Y2 441 aa20.97■□□□□ 0.95
SMKR1-201ENST00000462322 CRLF2Q9HC73 371 aa20.97■□□□□ 0.95
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF229Q9UJW7 825 aa20.97■□□□□ 0.95
SMKR1-201ENST00000462322 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
SMKR1-201ENST00000462322 M0R3G1 203 aa20.96■□□□□ 0.95
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF682O95780 498 aa20.96■□□□□ 0.95
SMKR1-201ENST00000462322 RBM34P42696 430 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
SMKR1-201ENST00000462322 CEACAM16Q2WEN9 425 aa20.96■□□□□ 0.95
SMKR1-201ENST00000462322 NHLRC1Q6VVB1 395 aa20.96■□□□□ 0.95
SMKR1-201ENST00000462322 C20orf196Q8IYI0 205 aa20.96■□□□□ 0.95
SMKR1-201ENST00000462322 TMEM255BQ8WV15 326 aa20.96■□□□□ 0.95
SMKR1-201ENST00000462322 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
SMKR1-201ENST00000462322 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
SMKR1-201ENST00000462322 FAIMQ9NVQ4 179 aa20.96■□□□□ 0.95
SMKR1-201ENST00000462322 MT-ND1P03886 318 aa20.95■□□□□ 0.94
SMKR1-201ENST00000462322 THRBP10828 461 aa20.95■□□□□ 0.94
SMKR1-201ENST00000462322 PAX1P15863 534 aa20.95■□□□□ 0.94
SMKR1-201ENST00000462322 IFNA8P32881 189 aa20.95■□□□□ 0.94
SMKR1-201ENST00000462322 UGT2B15P54855 530 aa20.95■□□□□ 0.94
SMKR1-201ENST00000462322 CAMK2DQ13557 499 aa20.95■□□□□ 0.94
SMKR1-201ENST00000462322 PGGHGQ32M88 737 aa20.95■□□□□ 0.94
SMKR1-201ENST00000462322 PRSS57Q6UWY2 283 aa20.95■□□□□ 0.94
SMKR1-201ENST00000462322 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa20.95■□□□□ 0.94
SMKR1-201ENST00000462322 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
SMKR1-201ENST00000462322 VTCN1Q7Z7D3 282 aa20.95■□□□□ 0.94
SMKR1-201ENST00000462322 OR6N1Q8NGY5 312 aa20.95■□□□□ 0.94
SMKR1-201ENST00000462322 PFN4Q8NHR9 129 aa20.95■□□□□ 0.94
SMKR1-201ENST00000462322 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
SMKR1-201ENST00000462322 TMEM239Q8WW34 195 aa20.95■□□□□ 0.94
SMKR1-201ENST00000462322 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
SMKR1-201ENST00000462322 LRR1Q96L50 414 aa20.95■□□□□ 0.94
SMKR1-201ENST00000462322 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa20.95■□□□□ 0.94
SMKR1-201ENST00000462322 TAS2R5Q9NYW4 299 aa20.95■□□□□ 0.94
SMKR1-201ENST00000462322 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa20.95■□□□□ 0.94
SMKR1-201ENST00000462322 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa20.94■□□□□ 0.94
SMKR1-201ENST00000462322 RNF13O43567 381 aa20.94■□□□□ 0.94
SMKR1-201ENST00000462322 ASAH2BP0C7U1 165 aa20.94■□□□□ 0.94
SMKR1-201ENST00000462322 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
SMKR1-201ENST00000462322 IFNGR1P15260 489 aa20.94■□□□□ 0.94
SMKR1-201ENST00000462322 BIDP55957 195 aa20.94■□□□□ 0.94
SMKR1-201ENST00000462322 ATP5J2P56134 94 aa20.94■□□□□ 0.94
SMKR1-201ENST00000462322 TUBA1BP68363 451 aa20.94■□□□□ 0.94
SMKR1-201ENST00000462322 TUBA4AP68366 448 aa20.94■□□□□ 0.94
SMKR1-201ENST00000462322 ZP4Q12836 540 aa20.94■□□□□ 0.94
SMKR1-201ENST00000462322 PHYHD1Q5SRE7 291 aa20.94■□□□□ 0.94
SMKR1-201ENST00000462322 TUBA1AQ71U36 451 aa20.94■□□□□ 0.94
SMKR1-201ENST00000462322 SLC35D2Q76EJ3 337 aa20.94■□□□□ 0.94
SMKR1-201ENST00000462322 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa20.94■□□□□ 0.94
SMKR1-201ENST00000462322 FAM162AQ96A26 154 aa20.94■□□□□ 0.94
SMKR1-201ENST00000462322 PRRC1Q96M27 445 aa20.94■□□□□ 0.94
SMKR1-201ENST00000462322 HS6ST2Q96MM7 605 aa20.94■□□□□ 0.94
SMKR1-201ENST00000462322 NELFAQ9H3P2 528 aa20.94■□□□□ 0.94
SMKR1-201ENST00000462322 SPAG4Q9NPE6 437 aa20.94■□□□□ 0.94
SMKR1-201ENST00000462322 ABCD2Q9UBJ2 740 aa20.94■□□□□ 0.94
SMKR1-201ENST00000462322 VPS13CQ709C8 3753 aa20.93■□□□□ 0.94
SMKR1-201ENST00000462322 E7EQL1 145 aa20.93■□□□□ 0.94
SMKR1-201ENST00000462322 DYNC1I1O14576 645 aa20.93■□□□□ 0.94
SMKR1-201ENST00000462322 SERPINA1P01009 418 aa20.93■□□□□ 0.94
SMKR1-201ENST00000462322 IFNW1P05000 195 aa20.93■□□□□ 0.94
SMKR1-201ENST00000462322 PAX7P23759 505 aa20.93■□□□□ 0.94
SMKR1-201ENST00000462322 YAP1P46937 504 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
SMKR1-201ENST00000462322 ST3GAL3Q11203 375 aa20.93■□□□□ 0.94
SMKR1-201ENST00000462322 FKBP9P1Q75LS8 142 aa20.93■□□□□ 0.94
SMKR1-201ENST00000462322 CBLL1Q75N03 491 aa20.93■□□□□ 0.94
SMKR1-201ENST00000462322 PIGWQ7Z7B1 504 aa20.93■□□□□ 0.94
SMKR1-201ENST00000462322 WDFY1Q8IWB7 410 aa20.93■□□□□ 0.94
SMKR1-201ENST00000462322 SGTBQ96EQ0 304 aa20.93■□□□□ 0.94
SMKR1-201ENST00000462322 DLL4Q9NR61 685 aa20.93■□□□□ 0.94
SMKR1-201ENST00000462322 ADA2Q9NZK5 511 aa20.93■□□□□ 0.94
SMKR1-201ENST00000462322 A4GNTQ9UNA3 340 aa20.93■□□□□ 0.94
SMKR1-201ENST00000462322 MED31Q9Y3C7 131 aa20.93■□□□□ 0.94
SMKR1-201ENST00000462322 ATP23Q9Y6H3 246 aa20.93■□□□□ 0.94
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
SMKR1-201ENST00000462322 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.8 ms