RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411265.1

RNU6-1001P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1001, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1001P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1001P-201ENST00000411265 GATSQ8NAP1 163 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 MAIP1Q8WWC4 291 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP1□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ESR2Q92731 530 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 FGF14Q92915 247 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP1□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP1□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 L3HYPDHQ96EM0 354 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TSSK3Q96PN8 268 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TMEM237Q96Q45 408 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 RNF2Q99496 336 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 OMDQ99983 421 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 HSD3B7Q9H2F3 369 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 HMG20AQ9NP66 347 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP1□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 GIN1Q9NXP7 522 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CALYQ9NYX4 217 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP1□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 KDRP35968 1356 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 A0A087WZY1 265 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 A0A1B0GVX0 72 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 KRT87PA6NCN2 255 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ZNF850A8MQ14 1090 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 NEBLO76041 1014 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CDRT1O95170 752 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 HSMCR30P0CW71 290 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PRPS2P11908 318 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 MMP11P24347 488 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ATP6V1E1P36543 226 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ESRRGP62508 458 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PITPNAQ00169 270 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 VGLL4Q14135 290 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 FZD2Q14332 565 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PRPSAP1Q14558 356 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 OXA1LQ15070 435 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SLC15A2Q16348 729 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CARD16Q5EG05 197 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ZNF684Q5T5D7 378 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 HES5Q5TA89 166 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 UTS2BQ765I0 119 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CCDC80Q76M96 950 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 WDR86Q86TI4 376 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 MREGQ8N565 214 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SYT14Q8NB59 555 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CNNM3Q8NE01 707 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 OR1F12Q8NHA8 337 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 UFD1Q92890 307 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ZNF382Q96SR6 550 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 DOK1Q99704 481 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 FOXC2Q99958 501 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CHAC1Q9BUX1 264 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CAPS2Q9BXY5 557 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 KRT23Q9C075 422 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 C1orf21Q9H246 121 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 MEAF6Q9HAF1 191 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 EXD2Q9NVH0 621 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ZNF586Q9NXT0 402 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 HOXC10Q9NYD6 342 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SPATA7Q9P0W8 599 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PCSK1NQ9UHG2 260 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 MMP17Q9ULZ9 603 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 RPH3ALQ9UNE2 315 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 OR10H1Q9Y4A9 318 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 S4R3C0 116 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 GPR179Q6PRD1 2367 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CIB4A0PJX0 185 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 LRP5LA4QPB2 252 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 A8MUI8 341 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 H0YHG0 523 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 BTN3A3O00478 584 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP0.98□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 MED7O43513 233 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TM7SF2O76062 418 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP0.98□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CCDC130P13994 396 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP0.98□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PCMT1P22061 227 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 DDOSTP39656 456 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 GSSP48637 474 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CASP4P49662 377 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP0.98□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP0.98□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ARG2P78540 354 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP0.98□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP0.98□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 GINS1Q14691 196 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 GANABQ14697 944 aaKnown RBP0.98□□□□□ -2.25
RNU6-1001P-201ENST00000411265 GGTA1PQ4G0N0 100 aa0.98□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms