RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 MGARPQ8TDB4 240 aa16.41■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 SLC35A5Q9BS91 424 aa16.41■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 DSPPQ9NZW4 1301 aa16.41■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa16.4■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 CDHR4A6H8M9 788 aa16.4■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 ALDH3A1P30838 453 aa16.4■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 RPS5P46782 204 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 GIPRP48546 466 aa16.4■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 RAB1AP62820 205 aa16.4■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 C1DQ13901 141 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 CARD17Q5XLA6 110 aa16.4■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 LEG1Q6P5S2 330 aa16.4■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 RNF130Q86XS8 419 aa16.4■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 VRK2Q86Y07 508 aa16.4■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 WDFY1Q8IWB7 410 aa16.4■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 CNPY4Q8N129 248 aa16.4■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 STK35Q8TDR2 534 aa16.4■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 MID2Q9UJV3 735 aa16.4■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 NUP50Q9UKX7 468 aa16.4■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa16.39■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 CLDN25C9JDP6 229 aa16.39■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 GCH1P30793 250 aa16.39■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 ARRB2P32121 409 aa16.39■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 COPZ1P61923 177 aa16.39■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 EMX2Q04743 252 aa16.39■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 EGR4Q05215 589 aa16.39■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 RAB39AQ14964 217 aa16.39■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF813Q6ZN06 617 aa16.39■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF836Q6ZNA1 936 aa16.39■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 USP51Q70EK9 711 aa16.39■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 RETREG3Q86VR2 466 aa16.39■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 C4orf33Q8N1A6 199 aa16.39■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 SYT14Q8NB59 555 aa16.39■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 GPA33Q99795 319 aa16.39■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 PKP2Q99959 881 aa16.39■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 MECRQ9BV79 373 aa16.39■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 SLC7A8Q9UHI5 535 aa16.39■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 NOTCH1P46531 2555 aa16.38■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 KRT4P19013 534 aa16.38■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 TEKQ02763 1124 aa16.38■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 CASP8Q14790 479 aa16.38■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 MFSD13AQ14CX5 517 aa16.38■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 MMEL1Q495T6 779 aa16.38■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM154Q6P9G4 183 aa16.38■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 TREML1Q86YW5 311 aa16.38■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF584Q8IVC4 421 aa16.38■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 C20orf196Q8IYI0 205 aa16.38■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 EMC6Q9BV81 110 aa16.38■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 ASIC5Q9NY37 505 aa16.38■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa16.38■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 PLEK2Q9NYT0 353 aa16.38■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa16.37■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 A0A096LPI6 279 aa16.37■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 RAB36O95755 333 aa16.37■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 FAM153BP0C7A2 387 aa16.37■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 PATE4P0C8F1 98 aa16.37■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 FAM157BP0CG42 384 aa16.37■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 NR2F1P10589 423 aa16.37■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 B4GALT1P15291 398 aa16.37■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 OMGP23515 440 aa16.37■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 SLC9A3R2Q15599 337 aa16.37■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 MAPK11Q15759 364 aa16.37■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 PCGF3Q3KNV8 242 aa16.37■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 ARMCX4Q5H9R4 360 aa16.37■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 ANXA8L1Q5VT79 327 aa16.37■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF627Q7L945 461 aa16.37■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 PEX5LQ8IYB4 626 aa16.37■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 CLIP4Q8N3C7 705 aa16.37■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 DEFB108BQ8NET1 73 aa16.37■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 OR52P1PQ8NH57 321 aa16.37■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 FGFBP3Q8TAT2 258 aa16.37■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 RAB1CQ92928 201 aa16.37■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 SLC25A28Q96A46 364 aa16.37■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 GAL3ST1Q99999 423 aa16.37■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 MMP26Q9NRE1 261 aa16.37■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 PRDM4Q9UKN5 801 aa16.37■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 POFUT2Q9Y2G5 429 aa16.37■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 M0R082 166 aa16.36■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 HLA-DOBP13765 273 aa16.36■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 CBLP22681 906 aa16.36■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 ERVS71-1P61550 626 aa16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 516 ms