RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384085.1

RNU6-38P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-38P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-38P-201ENST00000384085 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP1.46□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 PELI1Q96FA3 418 aa1.46□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 OMDQ99983 421 aa1.46□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 GIN1Q9NXP7 522 aa1.46□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 SPATA7Q9P0W8 599 aa1.46□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 XCL2Q9UBD3 114 aa1.46□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 MMP17Q9ULZ9 603 aa1.46□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 A0A1B0GVX0 72 aa1.45□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 CCDC182A6NF36 153 aa1.45□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 A8MUI8 341 aa1.45□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 CCER2I3L3R5 266 aa1.45□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 BTN3A3O00478 584 aa1.45□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP1.45□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 MPZL1O95297 269 aa1.45□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 AK1P00568 194 aa1.45□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 POLR2MP0CAP2 368 aa1.45□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 SMIM10L1P0DMW3 83 aa1.45□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 PNMTP11086 282 aa1.45□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 AQP6Q13520 282 aa1.45□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 MESDQ14696 234 aa1.45□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 USH1GQ495M9 461 aa1.45□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 VAX1Q5SQQ9 334 aa1.45□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF684Q5T5D7 378 aa1.45□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 CNIH2Q6PI25 160 aa1.45□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 TRIM69Q86WT6 500 aa1.45□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF619Q8N2I2 560 aa1.45□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZADH2Q8N4Q0 377 aa1.45□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 VN1R2Q8NFZ6 395 aa1.45□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR52H1Q8NGJ2 320 aa1.45□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR4D5Q8NGN0 318 aa1.45□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP1.45□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP1.45□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 OSTF1Q92882 214 aa1.45□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 UFD1Q92890 307 aa1.45□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 FGF14Q92915 247 aa1.45□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 SMIM10Q96HG1 83 aa1.45□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 OXGR1Q96P68 337 aa1.45□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP1.45□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 PCSK1NQ9UHG2 260 aa1.45□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 RPH3ALQ9UNE2 315 aa1.45□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 U3KQV3 271 aa1.45□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP1.45□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 BRWD3Q6RI45 1802 aa1.45□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP1.44□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 LINC00869P0C866 280 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 CYB561P49447 251 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 CASP4P49662 377 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 ERVK-25P63136 954 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 PLD1Q13393 1074 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 SELPLGQ14242 412 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 DUSP7Q16829 419 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP1.44□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 DMRTC1Q5HYR2 192 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 HES5Q5TA89 166 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 PYHIN1Q6K0P9 492 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 LINC00173Q6ZV60 143 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 UTS2BQ765I0 119 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 CCDC80Q76M96 950 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 STRADAQ7RTN6 431 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 TICAM2Q86XR7 235 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF573Q86YE8 665 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 RIMKLAQ8IXN7 391 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 MREGQ8N565 214 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 SYT14Q8NB59 555 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR10G4Q8NGN3 311 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR10T2Q8NGX3 314 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 LRRC58Q96CX6 371 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 TSSK3Q96PN8 268 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 RNF157Q96PX1 679 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 CLCC1Q96S66 551 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP1.44□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 GABARAPL3Q9BY60 117 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP1.44□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP1.44□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNRD1Q9P1U0 126 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 H0YHG0 523 aa1.43□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 KMOO15229 486 aa1.43□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP1.43□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 DIRAS3O95661 229 aa1.43□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLC2A5P22732 501 aa1.43□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 GNA11P29992 359 aa1.43□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 SOX6P35712 828 aa1.43□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLC7A9P82251 487 aa1.43□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 IL1RL1Q01638 556 aa1.43□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 SYCNQ0VAF6 134 aa1.43□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 ERCC8Q13216 396 aa1.43□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 C1orf61Q13536 156 aa1.43□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 DPYSL2Q16555 572 aa1.43□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 C10orf120Q5SQS8 335 aa1.43□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 CNSTQ6PJW8 725 aa1.43□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP1.43□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 BIVMQ86UB2 503 aa1.43□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 OSR2Q8N2R0 312 aa1.43□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 LINC00304Q8N9R0 145 aa1.43□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 CCDC110Q8TBZ0 833 aa1.43□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 SDR42E1Q8WUS8 393 aa1.43□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.1 ms