RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365375.1

RNU6-728P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 728, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-728P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-728P-201ENST00000365375 UVRAGQ9P2Y5 699 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 FOXJ3Q9UPW0 622 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 DOCK10Q96BY6 2186 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 KIAA1671Q9BY89 1806 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 C5orf63A6NC05 138 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 A8MUI8 341 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 BPY2O14599 106 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 RS1O15537 224 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 UGT1A9O60656 530 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 YIF1AO95070 293 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 APCSP02743 223 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 ZNF806P0C7X5 589 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 ZNF735P0CB33 412 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 PGCP20142 388 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 YWHABP31946 246 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 COPB2P35606 906 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 PTGFRP43088 359 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 CSNK1A1P48729 337 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 CDH4P55283 916 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 RALBP1Q15311 655 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 ZBED5Q49AG3 693 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 DEFB134Q4QY38 66 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 WDR59Q6PJI9 974 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 AFTPHQ6ULP2 937 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 Q6ZSA8 131 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 ZNF546Q86UE3 836 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 NT5DC3Q86UY8 548 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 VSTM4Q8IW00 320 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 BATF2Q8N1L9 274 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 OR2L3Q8NG85 312 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 OR8U1Q8NH10 309 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 HTR3CQ8WXA8 447 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 TM4SF18Q96CE8 201 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 EEF2KMTQ96G04 330 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 HPDLQ96IR7 371 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 SEC22AQ96IW7 307 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 ADPGKQ9BRR6 497 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 WDR76Q9H967 626 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 GRPEL1Q9HAV7 217 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 UGT1A7Q9HAW7 530 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 UGT1A10Q9HAW8 530 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 UGT1A8Q9HAW9 530 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 NEK6Q9HC98 313 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 CYP39A1Q9NYL5 469 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 KCNN3Q9UGI6 736 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 TBK1Q9UHD2 729 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 TMEM120BA0PK00 339 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 C4orf51C9J302 202 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 G3V4G9 280 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 GABARAPO95166 117 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 KLHL2O95198 593 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 GNAO1P09471 354 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 TCP1P17987 556 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 COX5AP20674 150 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 TBXA2RP21731 343 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 DCKP27707 260 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 FUT5Q11128 374 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 PON3Q15166 354 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 MAPK6Q16659 721 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 SMU1Q2TAY7 513 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 SMUG1Q53HV7 270 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 TMEM205Q6UW68 189 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 CASP12Q6UXS9 341 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 ZSCAN30Q86W11 494 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 CBWD2Q8IUF1 395 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 OR2L13Q8N349 312 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 NOXO1Q8NFA2 376 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 OR4K5Q8NGD3 323 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 OR52E1Q8NGJ3 308 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 OR13G1Q8NGZ3 307 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 LILRB4Q8NHJ6 448 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 EXOC6Q8TAG9 804 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 ABHD3Q8WU67 409 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 SLC25A46Q96AG3 418 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 C12orf66Q96MD2 445 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 ZNF681Q96N22 645 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 GABARAPL3Q9BY60 117 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 TMEM231Q9H6L2 316 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 LY9Q9HBG7 655 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 ISYNA1Q9NPH2 558 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 RDH8Q9NYR8 311 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 CALYQ9NYX4 217 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 KCNIP1Q9NZI2 227 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 AIPL1Q9NZN9 384 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 SEC14L3Q9UDX4 400 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 ZNF639Q9UID6 485 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-728P-201ENST00000365375 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa0.04□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms