RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364472.1

RNU4-38P-201, Transcript of RNA, U4 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU4-38P, Length 129 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU4-38P-201ENST00000364472 ESRRGP62508 458 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 RAP1AP62834 184 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 ERVK-25P63136 954 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 SLC35A1P78382 337 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 ADORA2A-AS1P86434 159 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 EFNB1P98172 346 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 CDK5Q00535 292 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 TEKQ02763 1124 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 TLE1Q04724 770 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 SRYQ05066 204 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 RBPJQ06330 500 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 RUNX1T1Q06455 604 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 PUDPQ08623 228 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 COX10Q12887 443 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 NFATC3Q12968 1075 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 NPRL3Q12980 569 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 ITGADQ13349 1161 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 PMS2P3Q13401 168 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 IL18R1Q13478 541 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 KEAP1Q14145 624 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 CRMP1Q14194 572 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 GGTLC2Q14390 218 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 GINS1Q14691 196 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 SLC17A1Q14916 467 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 PDK3Q15120 406 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 PON3Q15166 354 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 TAF11Q15544 211 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 TRIP10Q15642 601 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 STK11Q15831 433 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 SNCBQ16143 134 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 ACKR1Q16570 336 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 HIST3H3Q16695 136 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 PCK2Q16822 640 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 LRRC36Q1X8D7 754 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 PGGHGQ32M88 737 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 MS4A18Q3C1V0 323 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 SLC36A3Q495N2 470 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 NRN1LQ496H8 165 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 ZBED5Q49AG3 693 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 C4orf17Q53FE4 359 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 ALG10Q5BKT4 473 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 MESTQ5EB52 335 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 TMEM201Q5SNT2 666 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 PHYHD1Q5SRE7 291 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 SLC25A30Q5SVS4 291 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 C10orf128Q5T292 105 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 ARMC4Q5T2S8 1044 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 C1orf185Q5T7R7 199 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 WLSQ5T9L3 541 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 LINC01590Q5TEZ4 76 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 ZNF691Q5VV52 312 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 SLX4IPQ5VYV7 408 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 NXNL2Q5VZ03 156 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 TMEM236Q5W0B7 351 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 FAM205BPQ63HN1 556 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 C12orf73Q69YU5 71 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 GPR139Q6DWJ6 353 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 TMEM225Q6GV28 225 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 OR2A2Q6IF42 318 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 LAIR2Q6ISS4 152 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 ACSM5Q6NUN0 579 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 SLC27A4Q6P1M0 643 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 ZNF585AQ6P3V2 769 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 VWA1Q6PCB0 445 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 LRFN4Q6PJG9 635 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 SMARCD3Q6STE5 483 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 LYPD4Q6UWN0 246 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 PLXDC2Q6UX71 529 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 CLEC18BQ6UXF7 455 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 CASP12Q6UXS9 341 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 IZUMO2Q6UXV1 221 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 TFAP2EQ6VUC0 442 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 RPTNQ6XPR3 784 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 C3P1Q6ZMU1 363 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU4-38P-201ENST00000364472 Q6ZT83 130 aa0.89□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms