RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325599.12

SHQ1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SHQ1, Length 2,879 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-201ENST00000325599 EGR4Q05215 589 aa14.91□□□□□ -0.02
SHQ1-201ENST00000325599 AANATQ16613 207 aa14.91□□□□□ -0.02
SHQ1-201ENST00000325599 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP14.91□□□□□ -0.02
SHQ1-201ENST00000325599 LIX1LQ8IVB5 337 aa14.91□□□□□ -0.02
SHQ1-201ENST00000325599 SLITRK4Q8IW52 837 aa14.91□□□□□ -0.02
SHQ1-201ENST00000325599 OR8K3Q8NH51 312 aa14.91□□□□□ -0.02
SHQ1-201ENST00000325599 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa14.91□□□□□ -0.02
SHQ1-201ENST00000325599 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
SHQ1-201ENST00000325599 ST8SIA4Q92187 359 aa14.91□□□□□ -0.02
SHQ1-201ENST00000325599 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
SHQ1-201ENST00000325599 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
SHQ1-201ENST00000325599 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
SHQ1-201ENST00000325599 AUNIPQ9H7T9 357 aa14.91□□□□□ -0.02
SHQ1-201ENST00000325599 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF749O43361 778 aa14.9□□□□□ -0.02
SHQ1-201ENST00000325599 ZFPL1O95159 310 aa14.9□□□□□ -0.02
SHQ1-201ENST00000325599 UBL3O95164 117 aa14.9□□□□□ -0.02
SHQ1-201ENST00000325599 IGLV3-19P01714 112 aa14.9□□□□□ -0.02
SHQ1-201ENST00000325599 CAPZA2P47755 286 aa14.9□□□□□ -0.02
SHQ1-201ENST00000325599 OR1D4P47884 311 aa14.9□□□□□ -0.02
SHQ1-201ENST00000325599 HSD17B7P56937 341 aa14.9□□□□□ -0.02
SHQ1-201ENST00000325599 BTG1P62324 171 aa14.9□□□□□ -0.02
SHQ1-201ENST00000325599 MAB21L1Q13394 359 aa14.9□□□□□ -0.02
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF74Q16587 644 aa14.9□□□□□ -0.02
SHQ1-201ENST00000325599 STPG1Q5TH74 334 aa14.9□□□□□ -0.02
SHQ1-201ENST00000325599 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa14.9□□□□□ -0.02
SHQ1-201ENST00000325599 ABCA7Q8IZY2 2146 aa14.9□□□□□ -0.02
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
SHQ1-201ENST00000325599 LRFN5Q96NI6 719 aa14.9□□□□□ -0.02
SHQ1-201ENST00000325599 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
SHQ1-201ENST00000325599 ABRACLQ9P1F3 81 aa14.9□□□□□ -0.02
SHQ1-201ENST00000325599 TMEM72A0PK05 275 aa14.9□□□□□ -0.02
SHQ1-201ENST00000325599 CDC14CA4D256 554 aa14.9□□□□□ -0.02
SHQ1-201ENST00000325599 LINC00862A6NCI5 91 aa14.9□□□□□ -0.02
SHQ1-201ENST00000325599 MT-ND4P03905 459 aa14.9□□□□□ -0.02
SHQ1-201ENST00000325599 TCRBP04435 133 aa14.9□□□□□ -0.02
SHQ1-201ENST00000325599 RPS27P42677 84 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
SHQ1-201ENST00000325599 GRK6P43250 576 aa14.9□□□□□ -0.02
SHQ1-201ENST00000325599 SKP1P63208 163 aa14.9□□□□□ -0.02
SHQ1-201ENST00000325599 FNDC7Q5VTL7 733 aa14.9□□□□□ -0.02
SHQ1-201ENST00000325599 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
SHQ1-201ENST00000325599 SERPINA12Q8IW75 414 aa14.9□□□□□ -0.02
SHQ1-201ENST00000325599 CMTM4Q8IZR5 234 aa14.9□□□□□ -0.02
SHQ1-201ENST00000325599 RELTQ969Z4 430 aa14.9□□□□□ -0.02
SHQ1-201ENST00000325599 OR8D2Q9GZM6 311 aa14.9□□□□□ -0.02
SHQ1-201ENST00000325599 NANSQ9NR45 359 aa14.9□□□□□ -0.02
SHQ1-201ENST00000325599 A0A1B0GTH9 108 aa14.89□□□□□ -0.03
SHQ1-201ENST00000325599 GLCEO94923 617 aa14.89□□□□□ -0.03
SHQ1-201ENST00000325599 OR8G3PP0DMU2 310 aa14.89□□□□□ -0.03
SHQ1-201ENST00000325599 MMP15P51511 669 aa14.89□□□□□ -0.03
SHQ1-201ENST00000325599 CTXN1P60606 82 aa14.89□□□□□ -0.03
SHQ1-201ENST00000325599 SKP2Q13309 424 aa14.89□□□□□ -0.03
SHQ1-201ENST00000325599 OTPQ5XKR4 325 aa14.89□□□□□ -0.03
SHQ1-201ENST00000325599 BICRALQ6AI39 1079 aa14.89□□□□□ -0.03
SHQ1-201ENST00000325599 WBP2NLQ6ICG8 309 aa14.89□□□□□ -0.03
SHQ1-201ENST00000325599 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa14.89□□□□□ -0.03
SHQ1-201ENST00000325599 TSLPQ969D9 159 aa14.89□□□□□ -0.03
SHQ1-201ENST00000325599 PHF21AQ96BD5 680 aa14.89□□□□□ -0.03
SHQ1-201ENST00000325599 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
SHQ1-201ENST00000325599 NRSN2Q9GZP1 204 aa14.89□□□□□ -0.03
SHQ1-201ENST00000325599 GHITMQ9H3K2 345 aa14.89□□□□□ -0.03
SHQ1-201ENST00000325599 NIPAL2Q9H841 368 aa14.89□□□□□ -0.03
SHQ1-201ENST00000325599 IFT46Q9NQC8 304 aa14.89□□□□□ -0.03
SHQ1-201ENST00000325599 SPATA2Q9UM82 520 aa14.89□□□□□ -0.03
SHQ1-201ENST00000325599 PLCL2Q9UPR0 1127 aa14.89□□□□□ -0.03
SHQ1-201ENST00000325599 UNC13CQ8NB66 2214 aa14.89□□□□□ -0.03
SHQ1-201ENST00000325599 H3BSH0 61 aa14.89□□□□□ -0.03
SHQ1-201ENST00000325599 FABP7O15540 132 aa14.89□□□□□ -0.03
SHQ1-201ENST00000325599 GATBO75879 557 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
SHQ1-201ENST00000325599 WISP1O95388 367 aa14.89□□□□□ -0.03
SHQ1-201ENST00000325599 PRPS1P60891 318 aa14.89□□□□□ -0.03
SHQ1-201ENST00000325599 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
SHQ1-201ENST00000325599 ZSWIM7Q19AV6 140 aa14.89□□□□□ -0.03
SHQ1-201ENST00000325599 FAM209BQ5JX69 171 aa14.89□□□□□ -0.03
SHQ1-201ENST00000325599 POMZP3Q6PJE2 187 aa14.89□□□□□ -0.03
SHQ1-201ENST00000325599 OVCH1Q7RTY7 1134 aa14.89□□□□□ -0.03
SHQ1-201ENST00000325599 FAM122BQ7Z309 247 aa14.89□□□□□ -0.03
SHQ1-201ENST00000325599 FAM71CQ8NEG0 241 aa14.89□□□□□ -0.03
SHQ1-201ENST00000325599 OR11H7Q8NGC8 314 aa14.89□□□□□ -0.03
SHQ1-201ENST00000325599 MS4A3Q96HJ5 214 aa14.89□□□□□ -0.03
SHQ1-201ENST00000325599 ADOQ96SZ5 270 aa14.89□□□□□ -0.03
SHQ1-201ENST00000325599 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
SHQ1-201ENST00000325599 IER2Q9BTL4 223 aa14.89□□□□□ -0.03
SHQ1-201ENST00000325599 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
SHQ1-201ENST00000325599 DPAGT1Q9H3H5 408 aa14.89□□□□□ -0.03
SHQ1-201ENST00000325599 UBQLN4Q9NRR5 601 aa14.89□□□□□ -0.03
SHQ1-201ENST00000325599 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
SHQ1-201ENST00000325599 TVP23AA6NH52 213 aa14.88□□□□□ -0.03
SHQ1-201ENST00000325599 SDC3O75056 442 aa14.88□□□□□ -0.03
SHQ1-201ENST00000325599 FASLGP48023 281 aa14.88□□□□□ -0.03
SHQ1-201ENST00000325599 SLC37A1P57057 533 aa14.88□□□□□ -0.03
SHQ1-201ENST00000325599 DEFB133Q30KQ1 61 aa14.88□□□□□ -0.03
SHQ1-201ENST00000325599 ALG10Q5BKT4 473 aa14.88□□□□□ -0.03
SHQ1-201ENST00000325599 SLC35D3Q5M8T2 416 aa14.88□□□□□ -0.03
SHQ1-201ENST00000325599 LRRC75AQ8NAA5 344 aa14.88□□□□□ -0.03
SHQ1-201ENST00000325599 BEST4Q8NFU0 473 aa14.88□□□□□ -0.03
SHQ1-201ENST00000325599 OR52H1Q8NGJ2 320 aa14.88□□□□□ -0.03
SHQ1-201ENST00000325599 CACNG6Q9BXT2 260 aa14.88□□□□□ -0.03
SHQ1-201ENST00000325599 MED28Q9H204 178 aa14.88□□□□□ -0.03
SHQ1-201ENST00000325599 BEX1Q9HBH7 125 aa14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.9 ms