RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318561.7

SFTPC-201, Transcript of surfactant protein C, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SFTPC, Length 997 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPC-201ENST00000318561 FBXW9Q5XUX1 488 aa14.95□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 STAC2Q6ZMT1 411 aa14.95□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 CCDC121Q6ZUS5 278 aa14.95□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 RRM2BQ7LG56 351 aa14.95□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa14.95□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 NRMQ8IXM6 262 aa14.95□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 UBE2J2Q8N2K1 259 aa14.95□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 LRRC17Q8N6Y2 441 aa14.95□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 FAM222BQ8WU58 562 aa14.95□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 DHRS1Q96LJ7 313 aa14.95□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 MAGIXQ9H6Y5 334 aa14.95□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 NDRG3Q9UGV2 375 aa14.95□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 NOX1Q9Y5S8 564 aa14.95□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 AQP12BA6NM10 295 aa14.94□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 C11orf98E9PRG8 122 aa14.94□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 IGHV3-9P01782 118 aa14.94□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 AHCYP23526 432 aa14.94□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 CCKARP32238 428 aa14.94□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 CLDN17P56750 224 aa14.94□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 CHRNB3Q05901 458 aa14.94□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 ZP4Q12836 540 aa14.94□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 FLOT2Q14254 428 aa14.94□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 P2RY6Q15077 328 aa14.94□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 NIPAL3Q6P499 406 aa14.94□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 PODNL1Q6PEZ8 512 aa14.94□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa14.94□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 PXKQ7Z7A4 578 aa14.94□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 AQP12AQ8IXF9 295 aa14.94□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 LINC01560Q8TB33 94 aa14.94□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 SLC7A13Q8TCU3 470 aa14.94□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 LIPHQ8WWY8 451 aa14.94□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 MBD6Q96DN6 1003 aa14.94□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 BPIFA2Q96DR5 249 aa14.94□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 ZNF347Q96SE7 839 aa14.94□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 HDHD5Q9BXW7 423 aa14.94□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 LRMDAQ9H2I8 198 aa14.94□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa14.94□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 CRIM1Q9NZV1 1036 aa14.94□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 UPB1Q9UBR1 384 aa14.94□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 RCE1Q9Y256 329 aa14.94□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 GPR52Q9Y2T5 361 aa14.94□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 TESMINQ9Y4I5 508 aa14.94□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 SH3D21A4FU49 640 aa14.93□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 OR6C65A6NJZ3 312 aa14.93□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 EBAG9O00559 213 aa14.93□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 GADD45GO95257 159 aa14.93□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 IL32P24001 234 aa14.93□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP14.93□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 PRKCDQ05655 676 aa14.93□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 ITGADQ13349 1161 aa14.93□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 SFRP5Q5T4F7 317 aa14.93□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 TBPL2Q6SJ96 375 aa14.93□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 CDK20Q8IZL9 346 aa14.93□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 POMGNT2Q8NAT1 580 aa14.93□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 ANKK1Q8NFD2 765 aa14.93□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 STEAP2Q8NFT2 490 aa14.93□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 OR52J3Q8NH60 311 aa14.93□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 DACH2Q96NX9 599 aa14.93□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 OR10A4Q9H209 315 aa14.93□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 SLC7A10Q9NS82 523 aa14.93□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 ASB6Q9NWX5 421 aa14.93□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 TAS2R5Q9NYW4 299 aa14.93□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 MALT1Q9UDY8 824 aa14.93□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 POMPQ9Y244 141 aa14.93□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 TMEM5Q9Y2B1 443 aa14.93□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa14.92□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa14.92□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 RNF13O43567 381 aa14.92□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 SERPINI2O75830 405 aa14.92□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 SAGP10523 405 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 EPXP11678 715 aa14.92□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 HLA-DOBP13765 273 aa14.92□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 PPP3CBP16298 524 aa14.92□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 COX5AP20674 150 aa14.92□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 MAKP20794 623 aa14.92□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 IGHV1-2P23083 117 aa14.92□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 HOXC12P31275 282 aa14.92□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 RRM2P31350 389 aa14.92□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 MAGEA2P43356 314 aa14.92□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 SELENOPP49908 381 aa14.92□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 FAPQ12884 760 aa14.92□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 TSPO2Q5TGU0 170 aa14.92□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 ANKRD34AQ69YU3 496 aa14.92□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 SPATA24Q86W54 205 aa14.92□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 MED18Q9BUE0 208 aa14.92□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 ACTR6Q9GZN1 396 aa14.92□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 SLC7A8Q9UHI5 535 aa14.92□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 FAM171A2A8MVW0 826 aa14.91□□□□□ -0.02
SFTPC-201ENST00000318561 EFCAB9A8MZ26 197 aa14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms