RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311008.15

SPNS1-201, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-201ENST00000311008 LIPNQ5VXI9 398 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 OR56B4Q8NH76 319 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 PHF21AQ96BD5 680 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 MAP6Q96JE9 813 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 WDR76Q9H967 626 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 LMAN1LQ9HAT1 526 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 UCKL1Q9NWZ5 548 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 LAMP5Q9UJQ1 280 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 XIRP2A4UGR9 3374 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 A8MUA0 341 aa17.77■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 H3BMH7 237 aa17.77■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 GABARAPH6UMI1 98 aa17.77■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 RAF1P04049 648 aa17.77■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 H2AFB2P0C5Z0 115 aa17.77■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 OR8G3PP0DMU2 310 aa17.77■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 CXCR1P25024 350 aa17.77■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 GDNFP39905 211 aa17.77■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 ARL4DP49703 201 aa17.77■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 HSD11B2P80365 405 aa17.77■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 HES5Q5TA89 166 aa17.77■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 FAM205BPQ63HN1 556 aa17.77■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF767PQ75MW2 155 aa17.77■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 THRSPQ92748 146 aa17.77■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 TSSK2Q96PF2 358 aa17.77■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 TSPAN32Q96QS1 320 aa17.77■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 GFI1Q99684 422 aa17.77■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 ETV7Q9Y603 341 aa17.77■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 MTCH2Q9Y6C9 303 aa17.77■□□□□ 0.44
SPNS1-201ENST00000311008 PRR32B1ATL7 298 aa17.76■□□□□ 0.43
SPNS1-201ENST00000311008 PSMD9O00233 223 aa17.76■□□□□ 0.43
SPNS1-201ENST00000311008 TO15178 435 aa17.76■□□□□ 0.43
SPNS1-201ENST00000311008 ICOSLGO75144 302 aa17.76■□□□□ 0.43
SPNS1-201ENST00000311008 ALX3O95076 343 aa17.76■□□□□ 0.43
SPNS1-201ENST00000311008 ABHD16AO95870 558 aa17.76■□□□□ 0.43
SPNS1-201ENST00000311008 ANXA3P12429 323 aa17.76■□□□□ 0.43
SPNS1-201ENST00000311008 MAOBP27338 520 aa17.76■□□□□ 0.43
SPNS1-201ENST00000311008 OR1D4P47884 311 aa17.76■□□□□ 0.43
SPNS1-201ENST00000311008 DEFB133Q30KQ1 61 aa17.76■□□□□ 0.43
SPNS1-201ENST00000311008 MESTQ5EB52 335 aa17.76■□□□□ 0.43
SPNS1-201ENST00000311008 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa17.76■□□□□ 0.43
SPNS1-201ENST00000311008 LRRN1Q6UXK5 716 aa17.76■□□□□ 0.43
SPNS1-201ENST00000311008 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa17.76■□□□□ 0.43
SPNS1-201ENST00000311008 LINGO2Q7L985 606 aa17.76■□□□□ 0.43
SPNS1-201ENST00000311008 TAAR8Q969N4 342 aa17.76■□□□□ 0.43
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF576Q9H609 170 aa17.76■□□□□ 0.43
SPNS1-201ENST00000311008 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa17.76■□□□□ 0.43
SPNS1-201ENST00000311008 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa17.76■□□□□ 0.43
SPNS1-201ENST00000311008 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa17.76■□□□□ 0.43
SPNS1-201ENST00000311008 HCRTR2O43614 444 aa17.76■□□□□ 0.43
SPNS1-201ENST00000311008 RPP14O95059 124 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
SPNS1-201ENST00000311008 MT-ATP6P00846 226 aa17.76■□□□□ 0.43
SPNS1-201ENST00000311008 PRKCAP17252 672 aa17.76■□□□□ 0.43
SPNS1-201ENST00000311008 PGCP20142 388 aa17.76■□□□□ 0.43
SPNS1-201ENST00000311008 SCAND1P57086 179 aa17.76■□□□□ 0.43
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF117Q03924 483 aa17.76■□□□□ 0.43
SPNS1-201ENST00000311008 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
SPNS1-201ENST00000311008 STAC2Q6ZMT1 411 aa17.76■□□□□ 0.43
SPNS1-201ENST00000311008 FGD2Q7Z6J4 655 aa17.76■□□□□ 0.43
SPNS1-201ENST00000311008 LUZP2Q86TE4 346 aa17.76■□□□□ 0.43
SPNS1-201ENST00000311008 TSLPQ969D9 159 aa17.76■□□□□ 0.43
SPNS1-201ENST00000311008 GAL3ST4Q96RP7 486 aa17.76■□□□□ 0.43
SPNS1-201ENST00000311008 COMMD4Q9H0A8 199 aa17.76■□□□□ 0.43
SPNS1-201ENST00000311008 SLC25A18Q9H1K4 315 aa17.76■□□□□ 0.43
SPNS1-201ENST00000311008 LIN7BQ9HAP6 207 aa17.76■□□□□ 0.43
SPNS1-201ENST00000311008 ANKRD10Q9NXR5 420 aa17.76■□□□□ 0.43
SPNS1-201ENST00000311008 FRRS1LQ9P0K9 344 aa17.76■□□□□ 0.43
SPNS1-201ENST00000311008 KLHL9Q9P2J3 617 aa17.76■□□□□ 0.43
SPNS1-201ENST00000311008 THADAQ6YHU6 1953 aa17.76■□□□□ 0.43
SPNS1-201ENST00000311008 ALG1L2C9J202 215 aa17.75■□□□□ 0.43
SPNS1-201ENST00000311008 FABP7O15540 132 aa17.75■□□□□ 0.43
SPNS1-201ENST00000311008 EBPQ15125 230 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
SPNS1-201ENST00000311008 GSG1Q2KHT4 349 aa17.75■□□□□ 0.43
SPNS1-201ENST00000311008 FCRLAQ7L513 359 aa17.75■□□□□ 0.43
SPNS1-201ENST00000311008 DEFB119Q8N690 84 aa17.75■□□□□ 0.43
SPNS1-201ENST00000311008 HSPB11Q9Y547 144 aa17.75■□□□□ 0.43
SPNS1-201ENST00000311008 SPTBP11277 2137 aa17.75■□□□□ 0.43
SPNS1-201ENST00000311008 TMEM212A6NML5 194 aa17.75■□□□□ 0.43
SPNS1-201ENST00000311008 NDUFB5O43674 189 aa17.75■□□□□ 0.43
SPNS1-201ENST00000311008 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
SPNS1-201ENST00000311008 ALOX5APP20292 161 aa17.75■□□□□ 0.43
SPNS1-201ENST00000311008 MNDAP41218 407 aa17.75■□□□□ 0.43
SPNS1-201ENST00000311008 CENPAP49450 140 aa17.75■□□□□ 0.43
SPNS1-201ENST00000311008 CCR9P51686 369 aa17.75■□□□□ 0.43
SPNS1-201ENST00000311008 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa17.75■□□□□ 0.43
SPNS1-201ENST00000311008 KCNAB1Q14722 419 aa17.75■□□□□ 0.43
SPNS1-201ENST00000311008 NKAIN2Q5VXU1 208 aa17.75■□□□□ 0.43
SPNS1-201ENST00000311008 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa17.75■□□□□ 0.43
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
SPNS1-201ENST00000311008 PRSS45Q7RTY3 260 aa17.75■□□□□ 0.43
SPNS1-201ENST00000311008 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
SPNS1-201ENST00000311008 OR6V1Q8N148 313 aa17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46 ms