RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284273.5

UBASH3B-201, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBASH3B, Length 6,912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-201ENST00000284273 F8W036 122 aa10.96□□□□□ -0.65
UBASH3B-201ENST00000284273 NUDT1P36639 197 aa10.96□□□□□ -0.65
UBASH3B-201ENST00000284273 ALDH3B2P48448 385 aa10.96□□□□□ -0.65
UBASH3B-201ENST00000284273 HLCSP50747 726 aa10.96□□□□□ -0.65
UBASH3B-201ENST00000284273 BLOC1S1P78537 153 aa10.96□□□□□ -0.65
UBASH3B-201ENST00000284273 OR2G6Q5TZ20 316 aa10.96□□□□□ -0.65
UBASH3B-201ENST00000284273 DTWD1Q8N5C7 304 aa10.96□□□□□ -0.65
UBASH3B-201ENST00000284273 RNF170Q96K19 258 aa10.96□□□□□ -0.65
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
UBASH3B-201ENST00000284273 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
UBASH3B-201ENST00000284273 SLAMF8Q9P0V8 285 aa10.96□□□□□ -0.65
UBASH3B-201ENST00000284273 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
UBASH3B-201ENST00000284273 TYROBPO43914 113 aa10.96□□□□□ -0.65
UBASH3B-201ENST00000284273 AKAIN1P0CW23 69 aa10.96□□□□□ -0.65
UBASH3B-201ENST00000284273 PCGF2P35227 344 aa10.96□□□□□ -0.65
UBASH3B-201ENST00000284273 SERPINF1P36955 418 aa10.96□□□□□ -0.65
UBASH3B-201ENST00000284273 COX20Q5RI15 118 aa10.96□□□□□ -0.65
UBASH3B-201ENST00000284273 RANBP10Q6VN20 620 aa10.96□□□□□ -0.65
UBASH3B-201ENST00000284273 DCXRQ7Z4W1 244 aa10.96□□□□□ -0.65
UBASH3B-201ENST00000284273 FBXO27Q8NI29 283 aa10.96□□□□□ -0.65
UBASH3B-201ENST00000284273 ZFP90Q8TF47 636 aa10.96□□□□□ -0.65
UBASH3B-201ENST00000284273 TSLPQ969D9 159 aa10.96□□□□□ -0.65
UBASH3B-201ENST00000284273 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa10.96□□□□□ -0.65
UBASH3B-201ENST00000284273 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa10.96□□□□□ -0.65
UBASH3B-201ENST00000284273 SLC38A1Q9H2H9 487 aa10.96□□□□□ -0.65
UBASH3B-201ENST00000284273 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
UBASH3B-201ENST00000284273 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
UBASH3B-201ENST00000284273 G3V2L1 256 aa10.96□□□□□ -0.66
UBASH3B-201ENST00000284273 DUSP6Q16828 381 aa10.96□□□□□ -0.66
UBASH3B-201ENST00000284273 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.66
UBASH3B-201ENST00000284273 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.66
UBASH3B-201ENST00000284273 MYH4Q9Y623 1939 aa10.96□□□□□ -0.66
UBASH3B-201ENST00000284273 OR6C65A6NJZ3 312 aa10.96□□□□□ -0.66
UBASH3B-201ENST00000284273 KCNK5O95279 499 aa10.96□□□□□ -0.66
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF728P0DKX0 622 aa10.96□□□□□ -0.66
UBASH3B-201ENST00000284273 GFERP55789 205 aa10.96□□□□□ -0.66
UBASH3B-201ENST00000284273 IL10RAQ13651 578 aa10.96□□□□□ -0.66
UBASH3B-201ENST00000284273 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa10.96□□□□□ -0.66
UBASH3B-201ENST00000284273 SLCO2A1Q92959 643 aa10.96□□□□□ -0.66
UBASH3B-201ENST00000284273 NT5C3BQ969T7 300 aa10.96□□□□□ -0.66
UBASH3B-201ENST00000284273 TMEM45AQ9NWC5 275 aa10.96□□□□□ -0.66
UBASH3B-201ENST00000284273 HHLA2Q9UM44 414 aa10.96□□□□□ -0.66
UBASH3B-201ENST00000284273 RASD1Q9Y272 281 aa10.96□□□□□ -0.66
UBASH3B-201ENST00000284273 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
UBASH3B-201ENST00000284273 OR8U8P0C7N1 319 aa10.95□□□□□ -0.66
UBASH3B-201ENST00000284273 HTR2AP28223 471 aa10.95□□□□□ -0.66
UBASH3B-201ENST00000284273 CLINT1Q14677 625 aa10.95□□□□□ -0.66
UBASH3B-201ENST00000284273 TMEM244Q5VVB8 128 aa10.95□□□□□ -0.66
UBASH3B-201ENST00000284273 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
UBASH3B-201ENST00000284273 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
UBASH3B-201ENST00000284273 FUNDC2Q9BWH2 189 aa10.95□□□□□ -0.66
UBASH3B-201ENST00000284273 NMES1Q9C002 83 aa10.95□□□□□ -0.66
UBASH3B-201ENST00000284273 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
UBASH3B-201ENST00000284273 V9GY05 133 aa10.95□□□□□ -0.66
UBASH3B-201ENST00000284273 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
UBASH3B-201ENST00000284273 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa10.95□□□□□ -0.66
UBASH3B-201ENST00000284273 SLC5A12Q1EHB4 618 aa10.95□□□□□ -0.66
UBASH3B-201ENST00000284273 PLPP7Q8NBV4 271 aa10.95□□□□□ -0.66
UBASH3B-201ENST00000284273 NTNG1Q9Y2I2 539 aa10.95□□□□□ -0.66
UBASH3B-201ENST00000284273 SLC5A10A0PJK1 596 aa10.95□□□□□ -0.66
UBASH3B-201ENST00000284273 PPIHO43447 177 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
UBASH3B-201ENST00000284273 LGI1O95970 557 aa10.95□□□□□ -0.66
UBASH3B-201ENST00000284273 ADRA1AP35348 466 aa10.95□□□□□ -0.66
UBASH3B-201ENST00000284273 WNT4P56705 351 aa10.95□□□□□ -0.66
UBASH3B-201ENST00000284273 SERPINA11Q86U17 422 aa10.95□□□□□ -0.66
UBASH3B-201ENST00000284273 RDH10Q8IZV5 341 aa10.95□□□□□ -0.66
UBASH3B-201ENST00000284273 SLC35G3Q8N808 338 aa10.95□□□□□ -0.66
UBASH3B-201ENST00000284273 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
UBASH3B-201ENST00000284273 FGF22Q9HCT0 170 aa10.95□□□□□ -0.66
UBASH3B-201ENST00000284273 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
UBASH3B-201ENST00000284273 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
UBASH3B-201ENST00000284273 NOTOA8MTQ0 251 aa10.95□□□□□ -0.66
UBASH3B-201ENST00000284273 IL3RAP26951 378 aa10.95□□□□□ -0.66
UBASH3B-201ENST00000284273 GIPRP48546 466 aa10.95□□□□□ -0.66
UBASH3B-201ENST00000284273 RAB13P51153 203 aa10.95□□□□□ -0.66
UBASH3B-201ENST00000284273 EXT1Q16394 746 aa10.95□□□□□ -0.66
UBASH3B-201ENST00000284273 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
UBASH3B-201ENST00000284273 WDR31Q8NA23 367 aa10.95□□□□□ -0.66
UBASH3B-201ENST00000284273 OR51H1Q8NH63 302 aa10.95□□□□□ -0.66
UBASH3B-201ENST00000284273 SEC22AQ96IW7 307 aa10.95□□□□□ -0.66
UBASH3B-201ENST00000284273 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
UBASH3B-201ENST00000284273 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
UBASH3B-201ENST00000284273 LPAR2Q9HBW0 351 aa10.95□□□□□ -0.66
UBASH3B-201ENST00000284273 C1GALT1Q9NS00 363 aa10.95□□□□□ -0.66
UBASH3B-201ENST00000284273 ATPIF1Q9UII2 106 aa10.95□□□□□ -0.66
UBASH3B-201ENST00000284273 SLC5A6Q9Y289 635 aa10.95□□□□□ -0.66
UBASH3B-201ENST00000284273 HRO43593 1189 aa10.95□□□□□ -0.66
UBASH3B-201ENST00000284273 GASTP01350 101 aa10.95□□□□□ -0.66
UBASH3B-201ENST00000284273 PCSK6P29122 969 aa10.95□□□□□ -0.66
UBASH3B-201ENST00000284273 SSTR2P30874 369 aa10.95□□□□□ -0.66
UBASH3B-201ENST00000284273 EVI2BP34910 448 aa10.95□□□□□ -0.66
UBASH3B-201ENST00000284273 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
UBASH3B-201ENST00000284273 NUDT8Q8WV74 236 aa10.95□□□□□ -0.66
UBASH3B-201ENST00000284273 SAMD10Q9BYL1 202 aa10.95□□□□□ -0.66
UBASH3B-201ENST00000284273 CHST6Q9GZX3 395 aa10.95□□□□□ -0.66
UBASH3B-201ENST00000284273 ENPP5Q9UJA9 477 aa10.95□□□□□ -0.66
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
UBASH3B-201ENST00000284273 YKT6O15498 198 aa10.94□□□□□ -0.66
UBASH3B-201ENST00000284273 KLKB1P03952 638 aa10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.3 ms