RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261890.6

RAB11A-201, Transcript of RAB11A, member RAS oncogene family, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB11A, Length 4,930 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11A-201ENST00000261890 ARRDC5A6NEK1 342 aa7.13□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 SLC22A20A6NK97 555 aa7.13□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 PRH1P02810 166 aa7.13□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 IGHV4-34P06331 123 aa7.13□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 TFPTP0C1Z6 253 aa7.13□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 SP9P0CG40 484 aa7.13□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 MYF5P13349 255 aa7.13□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 ACER2Q5QJU3 275 aa7.13□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 KIF18BQ86Y91 864 aa7.13□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 OR2L13Q8N349 312 aa7.13□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 LRRC18Q8N456 261 aa7.13□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 DNAJC22Q8N4W6 341 aa7.13□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 ZNF709Q8N972 641 aa7.13□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 GDPD1Q8N9F7 314 aa7.13□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 LINC01555Q8NAE3 123 aa7.13□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 ABHD5Q8WTS1 349 aa7.13□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 TRIB1Q96RU8 372 aa7.13□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 NUDT9Q9BW91 350 aa7.13□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 UBQLN3Q9H347 655 aa7.13□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 SIRT5Q9NXA8 310 aa7.13□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 KCNN3Q9UGI6 736 aa7.13□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 M0R082 166 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 CTSVO60911 334 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 ARSBP15848 533 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 BDH1Q02338 343 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 ZIC1Q15915 447 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 HACD4Q5VWC8 232 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 ZFP41Q8N8Y5 198 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 NUBPLQ8TB37 319 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 CHPT1Q8WUD6 406 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 DNASE2BQ8WZ79 361 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 HPS1Q92902 700 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 MUL1Q969V5 352 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 PPP1R14BQ96C90 147 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 EID2BQ96D98 161 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 FUNDC2Q9BWH2 189 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 NUDT15Q9NV35 164 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 NEU3Q9UQ49 428 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 DCDC2BA2VCK2 349 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 NKX6-3A6NJ46 265 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 AKR7A3O95154 331 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 CRYAAP02489 173 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 RAB40ALP0C0E4 278 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 NKG7Q16617 165 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 SYT14P1Q58G82 188 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 C9orf135Q5VTT2 229 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 PGBD2Q6P3X8 592 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 NPSR1Q6W5P4 371 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 Q8N402 240 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 TBC1D15Q8TC07 691 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 RAB40AQ8WXH6 277 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 TEX37Q96LM6 180 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 RAB33BQ9H082 229 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 ZNF236Q9UL36 1845 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 ACOT8O14734 319 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 SLC16A6O15403 523 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 PEX14O75381 377 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 ETHE1O95571 254 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 UBBP0CG47 229 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 RGS6P49758 472 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 CLDN15P56746 228 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 TAS2R31P59538 309 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 ERVK-16P61578 105 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 PIGFQ07326 219 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 SPRED2Q7Z698 418 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 SLC37A3Q8NCC5 494 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 NMNAT3Q96T66 252 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 SPIN2AQ99865 258 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 SYT4Q9H2B2 425 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 FBXO8Q9NRD0 319 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 TRAV18A0A075B6X5 111 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 FAM183AA6NL82 134 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 OR2AT4A6NND4 320 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 SGCEO43556 437 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 GYPBP06028 91 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 CSF1P09603 554 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 SBK3P0C264 359 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 ZNF44P15621 663 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 SDHAP31040 664 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 TEKQ02763 1124 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 CRMP1Q14194 572 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 MEF2DQ14814 521 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB11A-201ENST00000261890 ZNF554Q86TJ5 538 aa7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms