RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243108.4

HOXC6-201, Transcript of homeobox C6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC6, Length 1,733 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC6-201ENST00000243108 SLC24A3Q9HC58 644 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 CHST11Q9NPF2 352 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 IL20RAQ9UHF4 553 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 POLQO75417 2590 aa15.61■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 ANKRD33BA6NCL7 494 aa15.61■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 OR14I1A6ND48 311 aa15.61■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 ALG1L2C9J202 215 aa15.61■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 SUSD5O60279 629 aa15.61■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 IGF2P01344 180 aa15.61■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 MTNR1AP48039 350 aa15.61■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 PMPCAQ10713 525 aa15.61■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 NXNL2Q5VZ03 156 aa15.61■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 LURAP1LQ8IV03 231 aa15.61■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 NANOGP1Q8N7R0 232 aa15.61■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 PROKR2Q8NFJ6 384 aa15.61■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 RNFT2Q96EX2 444 aa15.61■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 MGLLQ99685 303 aa15.61■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 MND1Q9BWT6 205 aa15.61■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 CLEC2DQ9UHP7 191 aa15.61■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 ERGIC3Q9Y282 383 aa15.61■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 CARD8Q9Y2G2 431 aa15.61■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 AKAP9Q99996 3911 aa15.61■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 HTR3EA5X5Y0 456 aa15.6■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 SLC2A10O95528 541 aa15.6■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 CASP3P42574 277 aa15.6■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 RGS6P49758 472 aa15.6■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 DOC2BQ14184 412 aa15.6■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 CBLN3Q6UW01 205 aa15.6■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 OAFQ86UD1 273 aa15.6■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa15.6■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 TBC1D15Q8TC07 691 aa15.6■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 TAPBPLQ9BX59 468 aa15.6■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 ANGPTL4Q9BY76 406 aa15.6■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 BAIAP2Q9UQB8 552 aa15.6■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa15.6■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 TRAV27A0A087WT01 109 aa15.6■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa15.6■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 TP53I11O14683 189 aa15.6■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 PPM1BO75688 479 aa15.6■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 PNMTP11086 282 aa15.6■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 HTR1FP30939 366 aa15.6■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 SLC6A8P48029 635 aa15.6■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 SLC9A3P48764 834 aa15.6■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 CDH11P55287 796 aa15.6■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 MED22Q15528 200 aa15.6■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF585AQ6P3V2 769 aa15.6■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 ACBD4Q8NC06 268 aa15.6■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa15.6■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 HGDQ93099 445 aa15.6■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 SGTBQ96EQ0 304 aa15.6■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 GNRHR2Q96P88 292 aa15.6■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 OPALINQ96PE5 141 aa15.6■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 TMEM43Q9BTV4 400 aa15.6■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 RTN4RQ9BZR6 473 aa15.6■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 LDAHQ9H6V9 325 aa15.6■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 C12orf10Q9HB07 376 aa15.6■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 MCCC2Q9HCC0 563 aa15.6■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 CMC2Q9NRP2 79 aa15.6■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa15.59■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 OR6C70A6NIJ9 312 aa15.59■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 AIREO43918 545 aa15.59■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 SCG5P05408 212 aa15.59■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 GADD45AP24522 165 aa15.59■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 PTGDSP41222 190 aa15.59■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 NRG3P56975 720 aa15.59■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 VBP1P61758 197 aa15.59■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 NCS1P62166 190 aa15.59■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 SPHARQ15513 63 aa15.59■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 GID4Q8IVV7 300 aa15.59■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 NDNFQ8TB73 568 aa15.59■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa15.59■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 ACKR4Q9NPB9 350 aa15.59■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 NKX2-6A6NCS4 301 aa15.58■□□□□ 0.08
HOXC6-201ENST00000243108 FADS1O60427 444 aa15.58■□□□□ 0.08
HOXC6-201ENST00000243108 CLPXO76031 633 aa15.58■□□□□ 0.08
HOXC6-201ENST00000243108 GLI4P10075 376 aa15.58■□□□□ 0.08
HOXC6-201ENST00000243108 SLC6A6P31641 620 aa15.58■□□□□ 0.08
HOXC6-201ENST00000243108 ETV1P50549 477 aa15.58■□□□□ 0.08
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF117Q03924 483 aa15.58■□□□□ 0.08
HOXC6-201ENST00000243108 TFF3Q07654 80 aa15.58■□□□□ 0.08
HOXC6-201ENST00000243108 TMEM211Q6ICI0 200 aa15.58■□□□□ 0.08
HOXC6-201ENST00000243108 CPOQ8IVL8 374 aa15.58■□□□□ 0.08
HOXC6-201ENST00000243108 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa15.58■□□□□ 0.08
HOXC6-201ENST00000243108 BBS1Q8NFJ9 593 aa15.58■□□□□ 0.08
HOXC6-201ENST00000243108 OR51A7Q8NH64 312 aa15.58■□□□□ 0.08
HOXC6-201ENST00000243108 NEIL3Q8TAT5 605 aa15.58■□□□□ 0.08
HOXC6-201ENST00000243108 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa15.58■□□□□ 0.08
HOXC6-201ENST00000243108 RND1Q92730 232 aa15.58■□□□□ 0.08
HOXC6-201ENST00000243108 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms