RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000222305.7

USF2-201, Transcript of upstream transcription factor 2, c-fos interacting, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USF2, Length 1,634 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2-201ENST00000222305 CLCA1A8K7I4 914 aa20.5■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 SYNGR4O95473 234 aa20.5■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 IGHMP01871 453 aa20.5■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 RPL27P61353 136 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 PDK3Q15120 406 aa20.5■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 SLC35D2Q76EJ3 337 aa20.5■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 WDFY1Q8IWB7 410 aa20.5■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 PM20D2Q8IYS1 436 aa20.5■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 SDR9C7Q8NEX9 313 aa20.5■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 OR52E2Q8NGJ4 325 aa20.5■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 ABHD3Q8WU67 409 aa20.5■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 TXNDC15Q96J42 360 aa20.5■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 SLX1AQ9BQ83 275 aa20.5■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 CMC2Q9NRP2 79 aa20.5■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 PNPLA3Q9NST1 481 aa20.5■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 NOX1Q9Y5S8 564 aa20.5■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 APEHP13798 732 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 ZNF43P17038 809 aa20.49■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 GABRB1P18505 474 aa20.49■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 PTGS2P35354 604 aa20.49■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 C1DQ13901 141 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 SLC17A1Q14916 467 aa20.49■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 MESTQ5EB52 335 aa20.49■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 NHLRC1Q6VVB1 395 aa20.49■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 APH1BQ8WW43 257 aa20.49■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa20.49■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 DOCK7Q96N67 2140 aa20.49■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 FAM183AA6NL82 134 aa20.49■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 ZNF716A6NP11 495 aa20.49■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 TTLL8A6PVC2 850 aa20.49■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 IMPA2O14732 288 aa20.49■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 IDH3BO43837 385 aa20.49■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 CYTIPO60759 359 aa20.49■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 AQP8O94778 261 aa20.49■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 VAMP5O95183 116 aa20.49■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 TXNDC12O95881 172 aa20.49■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 ACVR1BP36896 505 aa20.49■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 EFNB1P98172 346 aa20.49■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP20.49■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa20.49■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 CYB561A3Q8NBI2 242 aa20.49■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 OR9K2Q8NGE7 335 aa20.49■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 OR8J1Q8NGP2 316 aa20.49■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 RHOXF1Q8NHV9 184 aa20.49■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 ZNF519Q8TB69 540 aa20.49■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 RNF128Q8TEB7 428 aa20.49■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 ASB10Q8WXI3 467 aa20.49■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 EMC6Q9BV81 110 aa20.49■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 PRRG4Q9BZD6 226 aa20.49■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 SPTA1P02549 2419 aa20.49■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 SHANK1Q9Y566 2161 aa20.48■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa20.48■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 RIIAD1A6NNX1 92 aa20.48■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 H7C1C5 153 aa20.48■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 DAP3P51398 398 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 LCN6P62502 163 aa20.48■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa20.48■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 CRMP1Q14194 572 aa20.48■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 POU4F3Q15319 338 aa20.48■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 GPR139Q6DWJ6 353 aa20.48■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 CREB3L2Q70SY1 520 aa20.48■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa20.48■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 SLC37A3Q8NCC5 494 aa20.48■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 TMEM163Q8TC26 289 aa20.48■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 ZPLD1Q8TCW7 415 aa20.48■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 OTULINQ96BN8 352 aa20.48■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 NMNAT3Q96T66 252 aa20.48■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 WBP4O75554 376 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 BCL10O95999 233 aa20.47■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 IFNGP01579 166 aa20.47■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 ZNF3P17036 446 aa20.47■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 BIDP55957 195 aa20.47■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 RUNX1T1Q06455 604 aa20.47■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 NFATC3Q12968 1075 aa20.47■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 CDK5R2Q13319 367 aa20.47■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 ARMC4Q5T2S8 1044 aa20.47■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 LAIR2Q6ISS4 152 aa20.47■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 ZNF585AQ6P3V2 769 aa20.47■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 LEG1Q6P5S2 330 aa20.47■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 JAZF1Q86VZ6 243 aa20.47■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 FBLIM1Q8WUP2 373 aa20.47■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 TRIB1Q96RU8 372 aa20.47■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 FN3KQ9H479 309 aa20.47■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 MED20Q9H944 212 aa20.47■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa20.47■□□□□ 0.87
USF2-201ENST00000222305 KLHL21Q9UJP4 597 aa20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.2 ms