RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000200181.7

ITGB4-201, Transcript of integrin subunit beta 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ITGB4, Length 5,919 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4-201ENST00000200181 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa15.93■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 IL23AQ9NPF7 189 aa15.93■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 PRAMEF4O60810 478 aa15.93■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 ERV3-1Q14264 604 aa15.93■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 POFUT1Q9H488 388 aa15.93■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 P2RY10O00398 339 aa15.92■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 SLC31A2O15432 143 aa15.92■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 PAPLNO95428 1278 aa15.92■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 APEX1P27695 318 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 MFAP5Q13361 173 aa15.92■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 FAM173AQ9BQD7 235 aa15.92■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 TAF9BQ9HBM6 251 aa15.92■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 PPLO60437 1756 aa15.92■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 MYO5BQ9ULV0 1848 aa15.92■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 DOK2O60496 412 aa15.92■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 AIFM1O95831 613 aa15.92■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 C4orf17Q53FE4 359 aa15.92■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 FAM74A1Q5RGS3 127 aa15.92■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa15.92■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 SUMF1Q8NBK3 374 aa15.92■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 LFNGQ8NES3 379 aa15.92■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 OR1J2Q8NGS2 313 aa15.92■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa15.92■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 KPTNQ9Y664 436 aa15.92■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 PPP6CO00743 305 aa15.92■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 NXNL2Q5VZ03 156 aa15.92■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 AAED1Q7RTV5 226 aa15.92■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa15.92■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 TREX1Q9NSU2 369 aa15.92■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 GABRQQ9UN88 632 aa15.92■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 LALBAP00709 142 aa15.92■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 FCER1GP30273 86 aa15.92■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 KIAA1024LP59773 190 aa15.92■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 ZMAT1Q5H9K5 638 aa15.92■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 SPRED1Q7Z699 444 aa15.92■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 PRSS38A1L453 326 aa15.92■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 PVRP15151 417 aa15.92■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 TBPP20226 339 aa15.92■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 MAKP20794 623 aa15.92■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 OR2G3Q8NGZ4 309 aa15.92■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 ZNF480Q8WV37 535 aa15.92■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 EGLN2Q96KS0 407 aa15.92■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa15.92■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 FBXL4Q9UKA2 621 aa15.92■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 PRSS44E7EML9 344 aa15.91■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 DEFA4P12838 97 aa15.91■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 PAX6P26367 422 aa15.91■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 IL3RAP26951 378 aa15.91■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 CTSCP53634 463 aa15.91■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 PXDC1Q5TGL8 231 aa15.91■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 KCTD11Q693B1 232 aa15.91■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 CNTN4Q8IWV2 1026 aa15.91■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 OR10Z1Q8NGY1 313 aa15.91■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 SFT2D1Q8WV19 159 aa15.91■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 EMC9Q9Y3B6 208 aa15.91■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 RPA2P15927 270 aa15.91■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 MEP1BQ16820 701 aa15.91■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 C5orf46Q6UWT4 87 aa15.91■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 LINC00597Q9H2U6 94 aa15.91■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 SIAEQ9HAT2 523 aa15.91■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 NGBQ9NPG2 151 aa15.91■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 TM7SF3Q9NS93 570 aa15.91■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa15.91■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 TMEM235A6NFC5 223 aa15.91■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 CD46P15529 392 aa15.91■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 RBPJQ06330 500 aa15.91■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 MFSD9Q8NBP5 474 aa15.91■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 OR14A16Q8NHC5 309 aa15.91■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 V9GYS6 101 aa15.91■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 AQP7O14520 342 aa15.91■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 NXPH2O95156 264 aa15.91■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 JAG1P78504 1218 aa15.91■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa15.91■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa15.91■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 OR51A4Q8NGJ6 313 aa15.91■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 GNB4Q9HAV0 340 aa15.91■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 KIF1AQ12756 1690 aa15.91■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 RAB27BO00194 218 aa15.9■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 DRD1P21728 446 aa15.9■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 EMP3P54852 163 aa15.9■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 ELLP55199 621 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 PHLDA2Q53GA4 152 aa15.9■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 LGI3Q8N145 548 aa15.9■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 SEC22CQ9BRL7 303 aa15.9■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 DHRS4Q9BTZ2 278 aa15.9■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 UFSP2Q9NUQ7 469 aa15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms