RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000044819.6

Gm28044-201, Transcript of Predicted gene, 28044, mousemouse

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene Gm28044, Length 551 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Opn4Q9QXZ9 521 aa3.6□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Hsf4Q9R0L1 492 aa3.6□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Akap8lQ9R0L7 642 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Ptges3Q9R0Q7 160 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Bmp10Q9R229 421 aa3.6□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Ramp2Q9WUP0 189 aa3.6□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Cdh20Q9Z0M3 801 aa3.6□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Rhox2dW4VSN9 191 aa3.6□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Unc13cQ8K0T7 2210 aa3.6□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Chd7A2AJK6 2986 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Zfhx2Q2MHN3 2562 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Mki67E9PVX6 3177 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Chil5A0A0G2JDS2 431 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Gm44973A0A140LJJ1 189 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Igkv12-44A0A140T8M2 115 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Lrrc72A0A1Y7VMI0 288 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Tbc1d25A1A5B6 742 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Rhox2bA2A447 191 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Zfp978A2A7I1 335 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Cd300ld4A2A7W1 245 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Gm5072A2AHM1 344 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Ppp1r3dA2AJW4 279 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Rhox2cA2AWL9 191 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Gm3752A6NAT4 150 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 D7Ertd443eD2J0Y4 644 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Mthfd2lD3YZG8 338 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Ccnb1ip1D3Z3K2 276 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Gm45711E0CXA2 391 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 PtprhE9Q0N2 971 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Gm21103E9Q2Q1 267 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Ccdc7bE9Q9Y3 381 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Zfp760E9QAF5 666 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Inpp5aE9QAS7 422 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Susd5G3UW60 619 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 TspearJ3S6Y1 670 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Vmn2r109K7N747 858 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Vmn1r16K7N775 303 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Olfr1121L7MTT1 314 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Gm20878L7N244 103 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Cx3cl1O35188 395 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Ccrl2O35457 360 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Lsm2O35900 95 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Nmur1O55040 428 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Nme6O88425 189 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Hcn1O88704 910 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 MscO88940 201 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 P01657 111 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 P01822 137 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Hoxb6P09023 224 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Rpl7P14148 270 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 TP20293 436 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Ggta1P23336 394 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Gabrg3P27681 467 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 DctP29812 517 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Olfr13P34984 310 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Foxa1P35582 468 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Cfl2P45591 166 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Gstm5P48774 224 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 RorcP51450 516 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 DbtP53395 482 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Fbxo40P62932 710 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Kcnab1P63143 401 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Rit1P70426 219 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Slc9a3r1P70441 355 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 NptnP97300 397 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Scgb1a1Q06318 96 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 B4galnt1Q09200 533 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 CtrcQ3SYP2 268 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Gm1604bQ3TRG0 118 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Lrrc28Q3TX51 367 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Lrcol1Q3URS3 161 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 P2rx5Q3UYI1 455 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Bbs1Q3V3N7 593 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Zfp235Q499D5 702 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Xkr7Q5GH64 580 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Zscan26Q5RJ54 466 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Olfr12Q60894 333 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Cd55Q61475 390 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Ckmt2Q6P8J7 419 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 RgmaQ6PCX7 454 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Cd300ld3Q6SJQ5 245 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Gm5346Q7M766 736 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Gpatch2Q7TQC7 527 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Olfr1133Q7TR44 313 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Ntf4Q80VU4 209 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Agfg2Q80WC7 479 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Mgat4bQ812F8 548 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Q8BHG2 160 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Clrn3Q8BHH8 226 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Lhfpl6Q8BM86 200 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Slc25a24Q8BMD8 475 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Timmdc1Q8BUY5 285 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Acaa2Q8BWT1 397 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Lrfn5Q8BXA0 719 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Lpcat2Q8BYI6 544 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Slc35f4Q8BZK4 485 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Gm9999Q8C5Y2 53 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Phf21bQ8C966 487 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Smco1Q8CEZ1 214 aa3.59□□□□□ -1.83
Gm28044-201ENSMUST00000044819 Cox10Q8CFY5 443 aa3.59□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 112 ms