Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
Ggta1P23336 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Ggta1P23336 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Ggta1P23336 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Ggta1P23336 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Ggta1P23336 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ggta1P23336 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ggta1P23336 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Ggta1P23336 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Ggta1P23336 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ggta1P23336 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ggta1P23336 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ggta1P23336 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ggta1P23336 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Ggta1P23336 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ggta1P23336 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Ggta1P23336 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Ggta1P23336 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ggta1P23336 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ggta1P23336 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ggta1P23336 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ggta1P23336 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ggta1P23336 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ggta1P23336 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ggta1P23336 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ggta1P23336 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ggta1P23336 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Ggta1P23336 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ggta1P23336 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Ggta1P23336 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ggta1P23336 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ggta1P23336 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ggta1P23336 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ggta1P23336 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ggta1P23336 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ggta1P23336 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ggta1P23336 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ggta1P23336 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ggta1P23336 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ggta1P23336 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Ggta1P23336 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ggta1P23336 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Ggta1P23336 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ggta1P23336 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ggta1P23336 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ggta1P23336 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ggta1P23336 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ggta1P23336 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ggta1P23336 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ggta1P23336 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ggta1P23336 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ggta1P23336 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ggta1P23336 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Ggta1P23336 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ggta1P23336 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ggta1P23336 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ggta1P23336 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ggta1P23336 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Ggta1P23336 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ggta1P23336 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ggta1P23336 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ggta1P23336 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ggta1P23336 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ggta1P23336 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ggta1P23336 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ggta1P23336 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ggta1P23336 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ggta1P23336 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ggta1P23336 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ggta1P23336 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ggta1P23336 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ggta1P23336 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ggta1P23336 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ggta1P23336 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ggta1P23336 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Ggta1P23336 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ggta1P23336 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Ggta1P23336 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ggta1P23336 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ggta1P23336 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ggta1P23336 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Ggta1P23336 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ggta1P23336 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ggta1P23336 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ggta1P23336 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Ggta1P23336 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ggta1P23336 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ggta1P23336 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ggta1P23336 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ggta1P23336 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ggta1P23336 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ggta1P23336 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ggta1P23336 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ggta1P23336 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ggta1P23336 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ggta1P23336 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ggta1P23336 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ggta1P23336 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ggta1P23336 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ggta1P23336 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 6.9 ms