RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637003.1

ARID1B-222, Transcript of AT-rich interaction domain 1B, human

TSL 5 BASIC

Gene ARID1B, Length 1,290 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARID1B-222	ENST00000637003	TRAF3IP2	O43734	574 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	PRSS23	O95084	383 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	OR6A2	O95222	327 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	MT-ND1	P03886	318 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	ITGA5	P08648	1049 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	COX5A	P20674	150 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	CRYGS	P22914	178 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	IFNA8	P32881	189 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	VLDLR	P98155	873 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	POU3F1	Q03052	451 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	TAB1	Q15750	504 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	LINGO2	Q7L985	606 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	CDC20B	Q86Y33	519 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	OFCC1	Q8IZS5	231 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	SCAI	Q8N9R8	606 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	ADPRHL1	Q8NDY3	354 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	PYURF	Q96I23	114 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	ALKBH3	Q96Q83	286 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	HS3ST6	Q96QI5	342 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	HDHD5	Q9BXW7	423 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	SLCO5A1	Q9H2Y9	848 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	LIME1	Q9H400	295 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	FKRP	Q9H9S5	495 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	ZNF226	Q9NYT6	803 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	TAS2R5	Q9NYW4	299 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	NDUFAF4	Q9P032	175 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	MED31	Q9Y3C7	131 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	ENPP4	Q9Y6X5	453 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	LRBA	P50851	2863 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	BLOC1S5-TXNDC5	H3BN57	136 aa		13.35	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	KRT33A	O76009	404 aa		13.35	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	OR7A10	O76100	309 aa		13.35	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	MT-ATP6	P00846	226 aa		13.35	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	HIST1H2AB	P04908	130 aa		13.35	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	THRB	P10828	461 aa		13.35	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	IFI30	P13284	250 aa		13.35	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	RBM34	P42696	430 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	MS4A2	Q01362	244 aa		13.35	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	PUDP	Q08623	228 aa		13.35	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	TRAM2	Q15035	370 aa		13.35	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	HIST3H2A	Q7L7L0	130 aa		13.35	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	NRM	Q8IXM6	262 aa		13.35	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	HIST1H2AC	Q93077	130 aa		13.35	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	CCDC124	Q96CT7	223 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	C7orf34	Q96L11	122 aa		13.35	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	THTPA	Q9BU02	230 aa		13.35	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	SLC19A3	Q9BZV2	496 aa		13.35	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	NMNAT1	Q9HAN9	279 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	MALT1	Q9UDY8	824 aa		13.35	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003		A0A087WUU8	490 aa		13.34	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	SLC35F4	A4IF30	521 aa		13.34	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	PDLIM1	O00151	329 aa		13.34	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	KLF4	O43474	513 aa		13.34	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	RNF13	O43567	381 aa		13.34	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	ZNF432	O94892	652 aa		13.34	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	ASAH2B	P0C7U1	165 aa		13.34	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	PPP3CB	P16298	524 aa		13.34	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	MAK	P20794	623 aa		13.34	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	AQP2	P41181	271 aa		13.34	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	CAMK2D	Q13557	499 aa		13.34	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	MELK	Q14680	651 aa		13.34	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	PHYHD1	Q5SRE7	291 aa		13.34	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	NHLRC1	Q6VVB1	395 aa		13.34	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	NANOGNB	Q7Z5D8	188 aa		13.34	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	CYP4Z1	Q86W10	505 aa		13.34	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	PIK3C3	Q8NEB9	887 aa		13.34	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	OR52N5	Q8NH56	324 aa		13.34	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	OR52J3	Q8NH60	311 aa		13.34	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	MOSPD2	Q8NHP6	518 aa		13.34	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	HS6ST2	Q96MM7	605 aa		13.34	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	OR2M2	Q96R28	347 aa		13.34	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	SEPHS2	Q99611	448 aa		13.34	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	TAS2R16	Q9NYV7	291 aa		13.34	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	ZNF229	Q9UJW7	825 aa		13.34	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	FAM32A	Q9Y421	112 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	LOC102725191	A0A1B0GVB3	256 aa		13.33	□□□□□ -0.28
ARID1B-222	ENST00000637003	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
ARID1B-222	ENST00000637003		M0R3G1	203 aa		13.33	□□□□□ -0.28
ARID1B-222	ENST00000637003	SLC43A1	O75387	559 aa		13.33	□□□□□ -0.28
ARID1B-222	ENST00000637003	PLAU	P00749	431 aa		13.33	□□□□□ -0.28
ARID1B-222	ENST00000637003	SEMG1	P04279	462 aa		13.33	□□□□□ -0.28
ARID1B-222	ENST00000637003	F13B	P05160	661 aa		13.33	□□□□□ -0.28
ARID1B-222	ENST00000637003	H1F0	P07305	194 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
ARID1B-222	ENST00000637003	IFNGR1	P15260	489 aa		13.33	□□□□□ -0.28
ARID1B-222	ENST00000637003	LOX	P28300	417 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
ARID1B-222	ENST00000637003	LAPTM4A	Q15012	233 aa		13.33	□□□□□ -0.28
ARID1B-222	ENST00000637003	GABRA6	Q16445	453 aa		13.33	□□□□□ -0.28
ARID1B-222	ENST00000637003	IQCC	Q4KMZ1	466 aa		13.33	□□□□□ -0.28
ARID1B-222	ENST00000637003	FGD3	Q5JSP0	725 aa		13.33	□□□□□ -0.28
ARID1B-222	ENST00000637003	PODNL1	Q6PEZ8	512 aa		13.33	□□□□□ -0.28
ARID1B-222	ENST00000637003	ZNF730	Q6ZMV8	503 aa		13.33	□□□□□ -0.28
ARID1B-222	ENST00000637003	POMGNT2	Q8NAT1	580 aa		13.33	□□□□□ -0.28
ARID1B-222	ENST00000637003	SLC7A6OS	Q96CW6	309 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
ARID1B-222	ENST00000637003	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
ARID1B-222	ENST00000637003	PLPPR2	Q96GM1	343 aa		13.33	□□□□□ -0.28
ARID1B-222	ENST00000637003	C1QTNF6	Q9BXI9	259 aa		13.33	□□□□□ -0.28
ARID1B-222	ENST00000637003	OR10A4	Q9H209	315 aa		13.33	□□□□□ -0.28
ARID1B-222	ENST00000637003	ACTR3B	Q9P1U1	418 aa		13.33	□□□□□ -0.28
ARID1B-222	ENST00000637003	PRPF19	Q9UMS4	504 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.6 ms