RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	TLCD2	A6NGC4	264 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	WISP1	O95388	367 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	SYP	P08247	313 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	ANKRD34C	P0C6C1	535 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	ERP29	P30040	261 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	RPL18	Q07020	188 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	MAB21L1	Q13394	359 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	TCTE1	Q5JU00	501 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	DPAGT1	Q9H3H5	408 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	SYNDIG1	Q9H7V2	258 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	NKIRAS2	Q9NYR9	191 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	ABRACL	Q9P1F3	81 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	IKZF2	Q9UKS7	526 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	BLACE	A4D250	179 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	RHPN2P1	A8MT19	583 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF879	B4DU55	563 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	C11orf98	E9PRG8	122 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	GATB	O75879	557 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	TCRB	P04435	133 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	PNMT	P11086	282 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	OR1D5	P58170	312 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	BTBD16	Q32M84	506 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	FNDC7	Q5VTL7	733 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	C1orf189	Q5VU69	101 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	LIPN	Q5VXI9	398 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	LINGO2	Q7L985	606 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	FAM122B	Q7Z309	247 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	RGP1	Q92546	391 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	TAAR8	Q969N4	342 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	GFI1	Q99684	422 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	CACNG6	Q9BXT2	260 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	MED28	Q9H204	178 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	SPATA2	Q9UM82	520 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	PRELID1	Q9Y255	219 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	HIF3A	Q9Y2N7	669 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF281	Q9Y2X9	895 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	HSPB11	Q9Y547	144 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152		H0YIG0	161 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	IL33	O95760	270 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	DHFR	P00374	187 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	PLG	P00747	810 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	C1QB	P02746	253 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	PTHLH	P12272	177 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	RORA	P35398	523 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	PPIC	P45877	212 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	ARL4D	P49703	201 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	EFNA3	P52797	238 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	CCDC58	Q4VC31	144 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	SLC35D3	Q5M8T2	416 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	FCRLA	Q7L513	359 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	KANSL1	Q7Z3B3	1105 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	MARCH3	Q86UD3	253 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	FAM71C	Q8NEG0	241 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	OR6N2	Q8NGY6	317 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	SLC25A36	Q96CQ1	311 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF285	Q96NJ3	590 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	SLC19A3	Q9BZV2	496 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	SYT4	Q9H2B2	425 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	FKRP	Q9H9S5	495 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF222	Q9UK12	451 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	MTCH2	Q9Y6C9	303 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	LILRA5	A6NI73	299 aa		11.9	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	SDHA	P31040	664 aa		11.9	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	MMP15	P51511	669 aa		11.9	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	NR0B1	P51843	470 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	STPG1	Q5TH74	334 aa		11.9	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	SHISA6	Q6ZSJ9	500 aa		11.9	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	OVCH1	Q7RTY7	1134 aa		11.9	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	DPY19L4	Q7Z388	723 aa		11.9	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	OR6V1	Q8N148	313 aa		11.9	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	DNAAF1	Q8NEP3	725 aa		11.9	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	ZFAND1	Q8TCF1	268 aa		11.9	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		11.9	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	LCOR	Q96JN0	433 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	WDR76	Q9H967	626 aa		11.9	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	LIN7B	Q9HAP6	207 aa		11.9	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	ANKRD10	Q9NXR5	420 aa		11.9	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	COL4A2	P08572	1712 aa		11.9	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	FABP7	O15540	132 aa		11.9	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	ARHGEF9	O43307	516 aa		11.9	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	SCO2	O43819	266 aa		11.9	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	TSC22D2	O75157	780 aa		11.9	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	TRIM3	O75382	744 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	ASAH2B	P0C7U1	165 aa		11.9	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	CD27	P26842	260 aa		11.9	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	CSNK1E	P49674	416 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	PITPNA	Q00169	270 aa		11.9	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF117	Q03924	483 aa		11.9	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	SNTB2	Q13425	540 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		11.9	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	NSDHL	Q15738	373 aa		11.9	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	MEST	Q5EB52	335 aa		11.9	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	TIGD3	Q6B0B8	471 aa		11.9	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	TIGD4	Q8IY51	512 aa		11.9	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	OR8K3	Q8NH51	312 aa		11.9	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	MRPL48	Q96GC5	212 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	TSPAN32	Q96QS1	320 aa		11.9	□□□□□ -0.5

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