RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630572.2

ZEB2-231, Transcript of zinc finger E-box binding homeobox 2, human

TSL 5

Gene ZEB2, Length 468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZEB2-231	ENST00000630572	BARD1	Q99728	777 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
ZEB2-231	ENST00000630572	HES7	Q9BYE0	225 aa		12.35	□□□□□ -0.43
ZEB2-231	ENST00000630572	TTTY12	Q9BZ98	90 aa		12.35	□□□□□ -0.43
ZEB2-231	ENST00000630572	C6orf62	Q9GZU0	229 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
ZEB2-231	ENST00000630572	PRORY	Q9H606	182 aa		12.35	□□□□□ -0.43
ZEB2-231	ENST00000630572	ZNF703	Q9H7S9	590 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
ZEB2-231	ENST00000630572	KLHL1	Q9NR64	748 aa		12.35	□□□□□ -0.43
ZEB2-231	ENST00000630572	SSR3	Q9UNL2	185 aa		12.35	□□□□□ -0.43
ZEB2-231	ENST00000630572	VDAC3	Q9Y277	283 aa		12.35	□□□□□ -0.43
ZEB2-231	ENST00000630572	ANKRD11	Q6UB99	2663 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
ZEB2-231	ENST00000630572	PCNX3	Q9H6A9	2034 aa		12.34	□□□□□ -0.43
ZEB2-231	ENST00000630572	IGKV1D-42	A0A075B6H8	117 aa		12.34	□□□□□ -0.43
ZEB2-231	ENST00000630572	TRAV36DV7	A0A075B6V5	113 aa		12.34	□□□□□ -0.43
ZEB2-231	ENST00000630572	IQCM	A0A1B0GVH7	501 aa		12.34	□□□□□ -0.43
ZEB2-231	ENST00000630572	SLC35F4	A4IF30	521 aa		12.34	□□□□□ -0.43
ZEB2-231	ENST00000630572	GJE1	A6NN92	205 aa		12.34	□□□□□ -0.43
ZEB2-231	ENST00000630572		M0R082	166 aa		12.34	□□□□□ -0.43
ZEB2-231	ENST00000630572	SUSD5	O60279	629 aa		12.34	□□□□□ -0.43
ZEB2-231	ENST00000630572	MT-ATP6	P00846	226 aa		12.34	□□□□□ -0.43
ZEB2-231	ENST00000630572	IL1A	P01583	271 aa		12.34	□□□□□ -0.43
ZEB2-231	ENST00000630572	GDF1	P27539	372 aa		12.34	□□□□□ -0.43
ZEB2-231	ENST00000630572	LIPA	P38571	399 aa		12.34	□□□□□ -0.43
ZEB2-231	ENST00000630572	SLC9A3	P48764	834 aa		12.34	□□□□□ -0.43
ZEB2-231	ENST00000630572	RORC	P51449	518 aa		12.34	□□□□□ -0.43
ZEB2-231	ENST00000630572	RAC1	P63000	192 aa		12.34	□□□□□ -0.43
ZEB2-231	ENST00000630572	PLGLB1	Q02325	96 aa		12.34	□□□□□ -0.43
ZEB2-231	ENST00000630572	C3orf33	Q6P1S2	294 aa		12.34	□□□□□ -0.43
ZEB2-231	ENST00000630572	PRICKLE2	Q7Z3G6	844 aa		12.34	□□□□□ -0.43
ZEB2-231	ENST00000630572	PNPLA5	Q7Z6Z6	429 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
ZEB2-231	ENST00000630572	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		12.34	□□□□□ -0.43
ZEB2-231	ENST00000630572	CLDN22	Q8N7P3	220 aa		12.34	□□□□□ -0.43
ZEB2-231	ENST00000630572	OR9Q2	Q8NGE9	314 aa		12.34	□□□□□ -0.43
ZEB2-231	ENST00000630572	EXTL1	Q92935	676 aa		12.34	□□□□□ -0.43
ZEB2-231	ENST00000630572	DDIT4L	Q96D03	193 aa		12.34	□□□□□ -0.43
ZEB2-231	ENST00000630572	BPIFA2	Q96DR5	249 aa		12.34	□□□□□ -0.43
ZEB2-231	ENST00000630572	SGTB	Q96EQ0	304 aa		12.34	□□□□□ -0.43
ZEB2-231	ENST00000630572	SLC30A2	Q9BRI3	323 aa		12.34	□□□□□ -0.43
ZEB2-231	ENST00000630572	POLDIP3	Q9BY77	421 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
ZEB2-231	ENST00000630572	MEPE	Q9NQ76	525 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
ZEB2-231	ENST00000630572	ZNF226	Q9NYT6	803 aa		12.34	□□□□□ -0.43
ZEB2-231	ENST00000630572	CACNA1G	O43497	2377 aa		12.34	□□□□□ -0.43
ZEB2-231	ENST00000630572	TMEM72	A0PK05	275 aa		12.33	□□□□□ -0.44
ZEB2-231	ENST00000630572	OR2M5	A3KFT3	312 aa		12.33	□□□□□ -0.44
ZEB2-231	ENST00000630572	MYL12B	O14950	172 aa		12.33	□□□□□ -0.44
ZEB2-231	ENST00000630572	GMFG	O60234	142 aa		12.33	□□□□□ -0.44
ZEB2-231	ENST00000630572	RFPL3S	P0C7P2	107 aa		12.33	□□□□□ -0.44
ZEB2-231	ENST00000630572	SFTPC	P11686	197 aa		12.33	□□□□□ -0.44
ZEB2-231	ENST00000630572	IFI30	P13284	250 aa		12.33	□□□□□ -0.44
ZEB2-231	ENST00000630572	MYL12A	P19105	171 aa		12.33	□□□□□ -0.44
ZEB2-231	ENST00000630572	GAL	P22466	123 aa		12.33	□□□□□ -0.44
ZEB2-231	ENST00000630572	RPS5	P46782	204 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
ZEB2-231	ENST00000630572	B3GALT5-AS1	P59052	145 aa		12.33	□□□□□ -0.44
ZEB2-231	ENST00000630572	PPIA	P62937	165 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
ZEB2-231	ENST00000630572	EGR4	Q05215	589 aa		12.33	□□□□□ -0.44
ZEB2-231	ENST00000630572	SLC10A1	Q14973	349 aa		12.33	□□□□□ -0.44
ZEB2-231	ENST00000630572	LAPTM4A	Q15012	233 aa		12.33	□□□□□ -0.44
ZEB2-231	ENST00000630572	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
ZEB2-231	ENST00000630572	FAM69A	Q5T7M9	428 aa		12.33	□□□□□ -0.44
ZEB2-231	ENST00000630572	C1orf140	Q5VVS0	124 aa		12.33	□□□□□ -0.44
ZEB2-231	ENST00000630572	C12orf73	Q69YU5	71 aa		12.33	□□□□□ -0.44
ZEB2-231	ENST00000630572	RPL13AP3	Q6NVV1	102 aa		12.33	□□□□□ -0.44
ZEB2-231	ENST00000630572	RASSF6	Q6ZTQ3	369 aa		12.33	□□□□□ -0.44
ZEB2-231	ENST00000630572	CCDC190	Q86UF4	302 aa		12.33	□□□□□ -0.44
ZEB2-231	ENST00000630572	CADM3	Q8N126	398 aa		12.33	□□□□□ -0.44
ZEB2-231	ENST00000630572	FAM26E	Q8N5C1	309 aa		12.33	□□□□□ -0.44
ZEB2-231	ENST00000630572	TMEM251	Q8N6I4	163 aa		12.33	□□□□□ -0.44
ZEB2-231	ENST00000630572	RBMXL3	Q8N7X1	1067 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
ZEB2-231	ENST00000630572	FAM83F	Q8NEG4	500 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
ZEB2-231	ENST00000630572	MED18	Q9BUE0	208 aa		12.33	□□□□□ -0.44
ZEB2-231	ENST00000630572	TAPBPL	Q9BX59	468 aa		12.33	□□□□□ -0.44
ZEB2-231	ENST00000630572	ZDHHC11	Q9H8X9	412 aa		12.33	□□□□□ -0.44
ZEB2-231	ENST00000630572	FKRP	Q9H9S5	495 aa		12.33	□□□□□ -0.44
ZEB2-231	ENST00000630572	SLC25A19	Q9HC21	320 aa		12.33	□□□□□ -0.44
ZEB2-231	ENST00000630572	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		12.33	□□□□□ -0.44
ZEB2-231	ENST00000630572	HDGFL3	Q9Y3E1	203 aa		12.33	□□□□□ -0.44
ZEB2-231	ENST00000630572	PMF1-BGLAP	U3KQ54	211 aa		12.33	□□□□□ -0.44
ZEB2-231	ENST00000630572	DNPH1	O43598	174 aa		12.32	□□□□□ -0.44
ZEB2-231	ENST00000630572	EFNA2	O43921	213 aa		12.32	□□□□□ -0.44
ZEB2-231	ENST00000630572	HCN1	O60741	890 aa		12.32	□□□□□ -0.44
ZEB2-231	ENST00000630572	OR7A10	O76100	309 aa		12.32	□□□□□ -0.44
ZEB2-231	ENST00000630572	AHSA1	O95433	338 aa		12.32	□□□□□ -0.44
ZEB2-231	ENST00000630572	PDGFA	P04085	211 aa		12.32	□□□□□ -0.44
ZEB2-231	ENST00000630572	KRT8	P05787	483 aa		12.32	□□□□□ -0.44
ZEB2-231	ENST00000630572	STS	P08842	583 aa		12.32	□□□□□ -0.44
ZEB2-231	ENST00000630572	DBT	P11182	482 aa	Known RBP	12.32	□□□□□ -0.44
ZEB2-231	ENST00000630572	NR4A1	P22736	598 aa		12.32	□□□□□ -0.44
ZEB2-231	ENST00000630572	SMS	P52788	366 aa		12.32	□□□□□ -0.44
ZEB2-231	ENST00000630572	GFRA1	P56159	465 aa		12.32	□□□□□ -0.44
ZEB2-231	ENST00000630572	LSM3	P62310	102 aa	Known RBP	12.32	□□□□□ -0.44
ZEB2-231	ENST00000630572	CRYZ	Q08257	329 aa	Known RBP	12.32	□□□□□ -0.44
ZEB2-231	ENST00000630572	SPHAR	Q15513	63 aa		12.32	□□□□□ -0.44
ZEB2-231	ENST00000630572	MED22	Q15528	200 aa		12.32	□□□□□ -0.44
ZEB2-231	ENST00000630572	BCL2A1	Q16548	175 aa		12.32	□□□□□ -0.44
ZEB2-231	ENST00000630572	LINC00303	Q3SY05	128 aa		12.32	□□□□□ -0.44
ZEB2-231	ENST00000630572	RAET1L	Q5VY80	246 aa		12.32	□□□□□ -0.44
ZEB2-231	ENST00000630572	TMEM236	Q5W0B7	351 aa		12.32	□□□□□ -0.44
ZEB2-231	ENST00000630572	ANKRD34A	Q69YU3	496 aa		12.32	□□□□□ -0.44
ZEB2-231	ENST00000630572	METAP1D	Q6UB28	335 aa	Predicted RBP	12.32	□□□□□ -0.44
ZEB2-231	ENST00000630572	ASB18	Q6ZVZ8	466 aa		12.32	□□□□□ -0.44
ZEB2-231	ENST00000630572	OR14L1P	Q8NHC6	308 aa		12.32	□□□□□ -0.44

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms