RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 FBLIM1Q8WUP2 373 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 MPP4Q96JB8 637 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 HS6ST2Q96MM7 605 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 HTR3EA5X5Y0 456 aa21.52■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 CGAP01215 116 aa21.52■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 IL12BP29460 328 aa21.52■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 CD79BP40259 229 aa21.52■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 MYBPC1Q00872 1141 aa21.52■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 OR9Q2Q8NGE9 314 aa21.52■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 PIK3IP1Q96FE7 263 aa21.52■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 ADOQ96SZ5 270 aa21.52■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 APOL4Q9BPW4 351 aa21.52■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa21.52■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 HHATLQ9HCP6 504 aa21.52■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 SCOCQ9UIL1 159 aa21.52■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 LYPD3O95274 346 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 THY1P04216 161 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 CRHP06850 196 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 OSMP13725 252 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 PRG2P13727 222 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 HTR2AP28223 471 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 UGT2B15P54855 530 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 ISL1P61371 349 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 ZER1Q7Z7L7 766 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 GALNT5Q7Z7M9 940 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 PERPQ96FX8 193 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 SFXN2Q96NB2 322 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 LAT2Q9GZY6 243 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 UBTD1Q9HAC8 227 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 MYRFQ9Y2G1 1151 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 MXRA5Q9NR99 2828 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 SONP18583 2426 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 USF3Q68DE3 2245 aa21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 UGT2B10P36537 528 aa21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 RBM34P42696 430 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 CLK3P49761 638 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 KCTD21Q4G0X4 260 aa21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 OR5M10Q6IEU7 315 aa21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 RRM2BQ7LG56 351 aa21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 MISPQ8IVT2 679 aa21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 CCL19Q99731 98 aa21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 PRSS27Q9BQR3 290 aa21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 PRR14Q9BWN1 585 aa21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 RIBC2Q9H4K1 309 aa21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 REV1Q9UBZ9 1251 aa21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A0B4J2E0 115 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A1B0GX12 115 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 FADS1O60427 444 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 GKN3PP0CG01 181 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC6A8P48029 635 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 HOXC5Q00444 222 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 GUSBP1Q15486 140 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 BCL2A1Q16548 175 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 ULK3Q6PHR2 472 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 KLHL17Q6TDP4 642 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF730Q6ZMV8 503 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF614Q8N883 585 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 GSX2Q9BZM3 304 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 GMPPBQ9Y5P6 360 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 PCNX3Q9H6A9 2034 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 H0YC42 278 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF264O43296 627 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 CHP2O43745 196 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 UBL4AP11441 157 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 GSSP48637 474 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 CRISP1P54107 249 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 CXCR4P61073 352 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 TEKQ02763 1124 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 KRTAP1-1Q07627 177 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 TSPAN31Q12999 210 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 LINC00114Q6XXX2 140 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 PIGXQ8TBF5 258 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 TMCO6Q96DC7 493 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF426Q9BUY5 554 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF226Q9NYT6 803 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC7A7Q9UM01 511 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 PRR14LQ5THK1 2151 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 KLF4O43474 513 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 CLIC3O95833 236 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-216ENST00000628306 FPR3P25089 353 aa21.48■■□□□ 1.03
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