RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561817.5

CAPN3-210, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPN3, Length 915 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-210ENST00000561817 KLK13Q9UKR3 277 aa5.91□□□□□ -1.46
CAPN3-210ENST00000561817 TCFL5Q9UL49 500 aa5.91□□□□□ -1.46
CAPN3-210ENST00000561817 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
CAPN3-210ENST00000561817 ZNF337Q9Y3M9 751 aa5.91□□□□□ -1.46
CAPN3-210ENST00000561817 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
CAPN3-210ENST00000561817 PIEZO1Q92508 2521 aa5.9□□□□□ -1.46
CAPN3-210ENST00000561817 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa5.9□□□□□ -1.46
CAPN3-210ENST00000561817 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa5.9□□□□□ -1.46
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CAPN3-210ENST00000561817 CCDC160A6NGH7 325 aa5.9□□□□□ -1.46
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CAPN3-210ENST00000561817 RAB36O95755 333 aa5.9□□□□□ -1.46
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CAPN3-210ENST00000561817 FBXL4Q9UKA2 621 aa5.9□□□□□ -1.46
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CAPN3-210ENST00000561817 A8MVM7 634 aa5.89□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 C21orf140B9A014 251 aa5.89□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 J3QW42 95 aa5.89□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 IMPA2O14732 288 aa5.89□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 ITGA10O75578 1167 aa5.89□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 APOL3O95236 402 aa5.89□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 HPP00738 406 aa5.89□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 SCG5P05408 212 aa5.89□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 CD14P08571 375 aa5.89□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 INHBBP09529 407 aa5.89□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 CLUP10909 449 aa5.89□□□□□ -1.47
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