RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559259.1

MFGE8-210, Transcript of milk fat globule-EGF factor 8 protein, humanhuman

TSL 2

Gene MFGE8, Length 611 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFGE8-210ENST00000559259 ACSM5Q6NUN0 579 aa16.24■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 FAM122BQ7Z309 247 aa16.24■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 PM20D2Q8IYS1 436 aa16.24■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 OR10D3Q8NH80 312 aa16.24■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 MOSPD2Q8NHP6 518 aa16.24■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 SMPDL3BQ92485 455 aa16.24■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 SARAFQ96BY9 339 aa16.24■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 SNX18Q96RF0 628 aa16.24■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 TIMP4Q99727 224 aa16.24■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 ENKD1Q9H0I2 346 aa16.24■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 PNPLA3Q9NST1 481 aa16.24■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 KLHL21Q9UJP4 597 aa16.24■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 NOX1Q9Y5S8 564 aa16.24■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 LIPGQ9Y5X9 500 aa16.24■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa16.24■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 MCIDASD6RGH6 385 aa16.23■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 MS4A18H0YCH9 400 aa16.23■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 TNFSF11O14788 317 aa16.23■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 SURF4O15260 269 aa16.23■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 IFNGP01579 166 aa16.23■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 GABRB1P18505 474 aa16.23■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 SDHAP31040 664 aa16.23■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 CLDN15P56746 228 aa16.23■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 CSNK2BP67870 215 aa16.23■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 PDK3Q15120 406 aa16.23■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 MS4A18Q3C1V0 323 aa16.23■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 NADK2Q4G0N4 442 aa16.23■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 TMEM201Q5SNT2 666 aa16.23■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 MEDAGQ5VYS4 303 aa16.23■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 TMEM236Q5W0B7 351 aa16.23■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 HDDC2Q7Z4H3 204 aa16.23■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 ENTHD1Q8IYW4 607 aa16.23■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 FAM26EQ8N5C1 309 aa16.23■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 Q8NA96 180 aa16.23■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 CNBD2Q96M20 576 aa16.23■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 GPR137Q96N19 417 aa16.23■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 OXGR1Q96P68 337 aa16.23■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 KATNB1Q9BVA0 655 aa16.23■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 EXO5Q9H790 373 aa16.23■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 SPRR3Q9UBC9 169 aa16.23■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 RELNP78509 3460 aa16.22■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 NCKAP5O14513 1909 aa16.22■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 A0A1W2PRG6 482 aa16.22■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 RNF13O43567 381 aa16.22■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 AHCYL1O43865 530 aa16.22■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 AKR7A3O95154 331 aa16.22■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 PPP1R3DO95685 299 aa16.22■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 CLIC3O95833 236 aa16.22■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 ENPP1P22413 925 aa16.22■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 STARP49675 285 aa16.22■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 DAP3P51398 398 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 CTXN1P60606 82 aa16.22■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 IL5RAQ01344 420 aa16.22■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 CD47Q08722 323 aa16.22■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 IGFBP7Q16270 282 aa16.22■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 OCLNQ16625 522 aa16.22■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 NHLRC1Q6VVB1 395 aa16.22■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 ADCK1Q86TW2 530 aa16.22■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 GHDCQ8N2G8 530 aa16.22■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 IQCF1Q8N6M8 205 aa16.22■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 TMEM99Q8N816 258 aa16.22■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 TMEM163Q8TC26 289 aa16.22■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 WDYHV1Q96HA8 205 aa16.22■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 Q96MT0 163 aa16.22■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 TXNIPQ9H3M7 391 aa16.22■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 B3GAT1Q9P2W7 334 aa16.22■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 RNF6Q9Y252 685 aa16.22■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 ZNF175Q9Y473 711 aa16.22■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 SH3D21A4FU49 640 aa16.21■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 A6NIZ1 184 aa16.21■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 RIIAD1A6NNX1 92 aa16.21■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 CENPBD1B2RD01 187 aa16.21■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 OPN1LWP04000 364 aa16.21■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 NOS3P29474 1203 aa16.21■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 SLC16A1P53985 500 aa16.21■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 RAP1BP61224 184 aa16.21■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 RPL27P61353 136 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 RAP1AP62834 184 aa16.21■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 HSF1Q00613 529 aa16.21■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP16.21■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 SNAPC1Q16533 368 aa16.21■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 TMEM225Q6GV28 225 aa16.21■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa16.21■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 PTCHD4Q6ZW05 846 aa16.21■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 TEX19Q8NA77 164 aa16.21■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 ZPLD1Q8TCW7 415 aa16.21■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 ZNF566Q969W8 418 aa16.21■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 PLEKHA8Q96JA3 519 aa16.21■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 UCN2Q96RP3 112 aa16.21■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 SRXN1Q9BYN0 137 aa16.21■□□□□ 0.19
MFGE8-210ENST00000559259 RNF122Q9H9V4 155 aa16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.4 ms