RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543658.5

DDB1-223, Transcript of damage specific DNA binding protein 1, human

TSL 4

Gene DDB1, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDB1-223	ENST00000543658	PXK	Q7Z7A4	578 aa		10.62	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	IGFN1	Q86VF2	1251 aa		10.62	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	ATCAY	Q86WG3	371 aa		10.62	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	CCDC103	Q8IW40	242 aa		10.62	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	OR2T33	Q8NG76	320 aa		10.62	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	MOSPD2	Q8NHP6	518 aa		10.62	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	RNF128	Q8TEB7	428 aa		10.62	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	ABHD3	Q8WU67	409 aa		10.62	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	NRG4	Q8WWG1	115 aa		10.62	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	CYGB	Q8WWM9	190 aa		10.62	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	WNT2B	Q93097	391 aa		10.62	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	PLEKHA8	Q96JA3	519 aa		10.62	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	TM9SF2	Q99805	663 aa		10.62	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	GABARAPL3	Q9BY60	117 aa		10.62	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	GLRX2	Q9NS18	164 aa		10.62	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	IL20	Q9NYY1	176 aa		10.62	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	CLCF1	Q9UBD9	225 aa		10.62	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		10.62	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	IL20RA	Q9UHF4	553 aa		10.62	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	TMEFF2	Q9UIK5	374 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	SPTA1	P02549	2419 aa		10.62	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	ATRX	P46100	2492 aa		10.61	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	CD8B2	A6NJW9	211 aa		10.61	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658		B8ZZF3	427 aa		10.61	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	XKRY	O14609	159 aa		10.61	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	PTP4A3	O75365	173 aa		10.61	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	PPP1R3D	O95685	299 aa		10.61	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	SNAP29	O95721	258 aa		10.61	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	BCL10	O95999	233 aa		10.61	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	IL2RA	P01589	272 aa		10.61	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	CD14	P08571	375 aa		10.61	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF26	P17031	533 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	AQP4	P55087	323 aa		10.61	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	H3F3A	P84243	136 aa		10.61	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	TLE1	Q04724	770 aa		10.61	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	POU4F3	Q15319	338 aa		10.61	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	EIF2S3L	Q2VIR3	472 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	CASP12	Q6UXS9	341 aa		10.61	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	RPTN	Q6XPR3	784 aa		10.61	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658		Q6ZPB1	254 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	SLC35D2	Q76EJ3	337 aa		10.61	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	JAZF1	Q86VZ6	243 aa		10.61	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	KIF18B	Q86Y91	864 aa		10.61	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	CHERP	Q8IWX8	916 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	KDM8	Q8N371	416 aa		10.61	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	DHRSX	Q8N5I4	330 aa		10.61	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	OR9K2	Q8NGE7	335 aa		10.61	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	ZFP3	Q96NJ6	502 aa		10.61	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	ERMAP	Q96PL5	475 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	SLC38A2	Q96QD8	506 aa		10.61	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	GPX7	Q96SL4	187 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	KATNB1	Q9BVA0	655 aa		10.61	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	PLA2G12A	Q9BZM1	189 aa		10.61	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	TOR3A	Q9H497	397 aa		10.61	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	TAS2R5	Q9NYW4	299 aa		10.61	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	REV1	Q9UBZ9	1251 aa		10.61	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	TINAG	Q9UJW2	476 aa		10.61	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF835	Q9Y2P0	537 aa		10.61	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	EMC9	Q9Y3B6	208 aa		10.61	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	ITPR1	Q14643	2758 aa		10.61	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	BOD1L1	Q8NFC6	3051 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658		A6NIZ1	184 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF726	A6NNF4	738 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF814	B7Z6K7	855 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	MS4A18	H0YCH9	400 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658		H0YJX3	145 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	AQP8	O94778	261 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	IFNG	P01579	166 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	PRB1	P04280	392 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	TSPAN19	P0C672	248 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	NR2C1	P13056	603 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	KLK2	P20151	261 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	GRK5	P34947	590 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	P2RY4	P51582	365 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	CLDN17	P56750	224 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	CDC42	P60953	191 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	RAP1B	P61224	184 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	RPL27	P61353	136 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	RAP1A	P62834	184 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	ERVK-25	P63136	954 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	MYBPC1	Q00872	1141 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	MELK	Q14680	651 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	GINS1	Q14691	196 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	SLC17A1	Q14916	467 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	PDK3	Q15120	406 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	PTGES3	Q15185	160 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	PGGHG	Q32M88	737 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	MS4A18	Q3C1V0	323 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	TTC23	Q5W5X9	447 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	GPR139	Q6DWJ6	353 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	TMEM211	Q6ICI0	200 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	PLXDC2	Q6UX71	529 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	THSD4	Q6ZMP0	1018 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	ADGRE4P	Q86SQ3	457 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	GMPPA	Q96IJ6	420 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	TXNIP	Q9H3M7	391 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658		Q9H521	79 aa		10.6	□□□□□ -0.71

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