RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542324.6

CS-202, Transcript of citrate synthase, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CS, Length 1,893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-202ENST00000542324 SIGLEC6O43699 453 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 LDB3O75112 727 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 OR2F2O95006 317 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 NKX2-2O95096 273 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 ZFPL1O95159 310 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 APOC3P02656 99 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 MAOBP27338 520 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 ITPKBP27987 946 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 OR2F1Q13607 317 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 PDSS1Q5T2R2 415 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 ANKRD16Q6P6B7 361 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 ULK3Q6PHR2 472 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 SLC16A9Q7RTY1 509 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 KCNRGQ8N5I3 272 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 GRHL3Q8TE85 626 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 TM4SF19Q96DZ7 209 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 LRRC46Q96FV0 321 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 DMRTA2Q96SC8 542 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 SYNPO2LQ9H987 977 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 ADAP2Q9NPF8 381 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 HPF1Q9NWY4 346 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 STEAP1Q9UHE8 339 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 DAPP1Q9UN19 280 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 MOKQ9UQ07 419 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 IGLON5A6NGN9 336 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 GGT3PA6NGU5 568 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 MCIDASD6RGH6 385 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 DNAJB6O75190 326 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 ZNF254O75437 659 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 IGF2P01344 180 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 RLN1P04808 185 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 ITGB2P05107 769 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 SLC25A4P12235 298 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 ADRA2CP18825 462 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 AK4P27144 223 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 RORAP35398 523 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 CLDN12P56749 244 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 ACTBP60709 375 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 ACTG1P63261 375 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 S100A12P80511 92 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 ZNF234Q14588 700 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 C2orf68Q2NKX9 166 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 ALG10BQ5I7T1 473 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 CLVS2Q5SYC1 327 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 FAAP20Q6NZ36 180 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 SLAIN1Q8ND83 568 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 OR10K1Q8NGX5 313 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 OR5AK2Q8NH90 309 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 HMGB4Q8WW32 186 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 PIGMQ9H3S5 423 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 RXFP3Q9NSD7 469 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 SPHK1Q9NYA1 384 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 RAB19A4D1S5 217 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 NPIPA7E9PJI5 369 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 SIX6O95475 246 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 RLN2P04090 185 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 NGFRP08138 427 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 NPIPA8P0DM63 369 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 APEHP13798 732 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 RPS15P62841 145 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 SORDQ00796 357 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 TCEAL5Q5H9L2 206 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 LINC01590Q5TEZ4 76 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 DCAF12L2Q5VW00 463 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 ATRAIDQ6UW56 229 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 TMPRSS12Q86WS5 348 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 CCDC74AQ96AQ1 378 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 RSPRY1Q96DX4 576 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 SLC19A3Q9BZV2 496 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 SLC6A17Q9H1V8 727 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 FBXO34Q9NWN3 711 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 ATPIF1Q9UII2 106 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 ZNF337Q9Y3M9 751 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 SPACA6W5XKT8 324 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-202ENST00000542324 DNAH12Q6ZR08 3092 aa9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.9 ms