RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518059.5

UBXN8-204, Transcript of UBX domain protein 8, humanhuman

TSL 3

Gene UBXN8, Length 493 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8-204ENST00000518059 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 SDHAF3Q9NRP4 125 aa6.76□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 INIPQ9NRY2 104 aa6.76□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 SLC22A11Q9NSA0 550 aa6.76□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa6.76□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa6.76□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 HEATR5AQ86XA9 2040 aa6.76□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 A0A1W2PQM1 296 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 ANKRD61A6NGH8 418 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 A6NIZ1 184 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 VSTM2BA6NLU5 285 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 C9J4A7 227 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 E9PI62 339 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 FLRT2O43155 660 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 TMEM127O75204 238 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 ITGA10O75578 1167 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 ZNF432O94892 652 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 F13BP05160 661 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 PRKAR1AP10644 381 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 TDGF1P13385 188 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 SPNP16150 400 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 PRKCAP17252 672 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 RAB3BP20337 219 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 MST1P26927 711 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 MSX1P28360 303 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 SHC1P29353 583 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 CCKBRP32239 447 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 EVX1P49640 407 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 EFNA3P52797 238 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 RAP1BP61224 184 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 RAP1AP62834 184 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 EGR4Q05215 589 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 LTBQ06643 244 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 C17orf67Q0P5P2 114 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 RIN1Q13671 783 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 IL18Q14116 193 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 IL11RAQ14626 422 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 TAB1Q15750 504 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 COL28A1Q2UY09 1125 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 HSD17B12Q53GQ0 312 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 ZMAT1Q5H9K5 638 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 FAM205BPQ63HN1 556 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 SFXN4Q6P4A7 337 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 DNM1P34Q6PK57 102 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 GDPD3Q7L5L3 318 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 SSX6Q7RTT6 188 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 PXKQ7Z7A4 578 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 CADM3Q8N126 398 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 ZNF248Q8NDW4 579 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 ENKURQ8TC29 256 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 GPR119Q8TDV5 335 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 GHSRQ92847 366 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 HPS1Q92902 700 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 SLC25A36Q96CQ1 311 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 PGLYRP3Q96LB9 341 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 TSPAN32Q96QS1 320 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 INTS14Q96SY0 518 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 DDOQ99489 341 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 TIMP4Q99727 224 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 TTTY10Q9BZA0 68 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 SLITRK2Q9H156 845 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 SLC26A1Q9H2B4 701 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 ACOXLQ9NUZ1 547 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 NPAP1Q9NZP6 1156 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 KLRF1Q9NZS2 232 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 ABRACLQ9P1F3 81 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 EXTL2Q9UBQ6 330 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 LAMP5Q9UJQ1 280 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 TBC1D24Q9ULP9 559 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 RABL2BQ9UNT1 228 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 FKBP7Q9Y680 259 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 U3KQA8 63 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 ASXL3Q9C0F0 2248 aa6.74□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 RP1P56715 2156 aa6.74□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 TMEM72A0PK05 275 aa6.74□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 NOTOA8MTQ0 251 aa6.74□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 D6RAR5 112 aa6.74□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 C11orf98E9PRG8 122 aa6.74□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 ARHGEF9O43307 516 aa6.74□□□□□ -1.33
UBXN8-204ENST00000518059 IGHMP01871 453 aa6.74□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms