RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 PERPQ96FX8 193 aa16.39■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 TPD52L3Q96J77 140 aa16.39■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 OR2M2Q96R28 347 aa16.39■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 ASPNQ9BXN1 380 aa16.39■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC17A5Q9NRA2 495 aa16.39■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 RCE1Q9Y256 329 aa16.39■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 GMNCA6NCL1 334 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF587BE7ETH6 402 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 M0R1B8 84 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 PIP5K1CO60331 668 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 SEC14L2O76054 403 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 CH25HO95992 272 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 SOD3P08294 240 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 TUBA1BP68363 451 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 TUBA4AP68366 448 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 PMS2P3Q13401 168 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 Q5PR19 223 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 CARD17Q5XLA6 110 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 HACD2Q6Y1H2 254 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 B3GLCTQ6Y288 498 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 TUBA1AQ71U36 451 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 P2RY8Q86VZ1 359 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 UEVLDQ8IX04 471 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 SCAIQ8N9R8 606 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 OR1K1Q8NGR3 316 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 EMC6Q9BV81 110 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 ALG2Q9H553 416 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 NGBQ9NPG2 151 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 ABCD2Q9UBJ2 740 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 BAG5Q9UL15 447 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 CORINQ9Y5Q5 1042 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 CR1P17927 2039 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 C11orf98E9PRG8 122 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 CXCR6O00574 342 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 PLPP3O14495 311 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 SMPD2O60906 423 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 KRT33AO76009 404 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 NCK1P16333 377 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 HOXC12P31275 282 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 CDH11P55287 796 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 TAS2R41P59536 307 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 PUDPQ08623 228 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 C1DQ13901 141 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 TBRG1Q3YBR2 411 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 OR7E24Q6IFN5 339 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 NHLRC1Q6VVB1 395 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 CPLX4Q7Z7G2 160 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 C17orf78Q8N4C9 275 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF611Q8N823 705 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 OR5J2Q8NH18 312 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 FBXW5Q969U6 566 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 TXNDC15Q96J42 360 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 PIP5K1AQ99755 562 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 TMUB1Q9BVT8 246 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 LINC00470Q9BZP3 86 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 C20orf141Q9NUB4 165 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 LAMP3Q9UQV4 416 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 SNX13Q9Y5W8 968 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A096LPE4 126 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A1W2PPZ6 126 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC43A1O75387 559 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 DANCRP0C864 163 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 CD40P25942 277 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 PSME3P61289 254 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP16.36■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 MFSD13AQ14CX5 517 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 PGGHGQ32M88 737 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 PIGTQ969N2 578 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 SEC61A2Q9H9S3 476 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 EFCAB1Q9HAE3 211 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 GPR35Q9HC97 309 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 A4GNTQ9UNA3 340 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 AMDHD2Q9Y303 409 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 J3KTA2 159 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 OR5F1O95221 314 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 MT-ATP6P00846 226 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 ADORA3P0DMS8 318 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 AHCYP23526 432 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 YAP1P46937 504 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 PTH2RP49190 550 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 SELENOWP63302 87 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 MELKQ14680 651 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 CEACAM16Q2WEN9 425 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 RNF148Q8N7C7 305 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 MPP4Q96JB8 637 aa16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms