RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495615.5

CBWD5-231, Transcript of COBW domain containing 5, human

TSL 3

Gene CBWD5, Length 993 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CBWD5-231	ENST00000495615	CHRNA9	Q9UGM1	479 aa		2.78	□□□□□ -1.96
CBWD5-231	ENST00000495615	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		2.77	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		2.77	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	METTL21EP	A6NDL7	271 aa		2.77	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	TCP11X1	B4DZS4	312 aa		2.77	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		2.77	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615		K7EQM0	130 aa		2.77	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	SUPT3H	O75486	399 aa		2.77	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	ALDOB	P05062	364 aa		2.77	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	DBT	P11182	482 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	DES	P17661	470 aa		2.77	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	IGFBP3	P17936	291 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	PCMT1	P22061	227 aa		2.77	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	CXCL5	P42830	114 aa		2.77	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	OR5I1	Q13606	314 aa		2.77	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	DUSP7	Q16829	419 aa		2.77	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	DMRTC1	Q5HYR2	192 aa		2.77	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	TMEM123	Q8N131	208 aa		2.77	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	ZNF561	Q8N587	486 aa		2.77	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	IPMK	Q8NFU5	416 aa		2.77	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	DTNBP1	Q96EV8	351 aa		2.77	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	RBM14	Q96PK6	669 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	ZNF607	Q96SK3	696 aa		2.77	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	RMND5A	Q9H871	391 aa		2.77	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	POLDIP2	Q9Y2S7	368 aa		2.77	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615		A0A0G2JLM5	398 aa		2.76	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	PRRG1	O14668	218 aa		2.76	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	ARPC3	O15145	178 aa		2.76	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	CSF3	P09919	207 aa		2.76	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	HNF1A	P20823	631 aa		2.76	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	QARS	P47897	775 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	CASP4	P49662	377 aa		2.76	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	CRISP3	P54108	245 aa		2.76	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	KRTAP10-10	P60014	251 aa		2.76	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	ACTA2	P62736	377 aa		2.76	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	ACTC1	P68032	377 aa		2.76	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	HMGCS1	Q01581	520 aa		2.76	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	ENPEP	Q07075	957 aa		2.76	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	KLRB1	Q12918	225 aa		2.76	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		2.76	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		2.76	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	RPRD1A	Q96P16	312 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	RAB33B	Q9H082	229 aa		2.76	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	EXD2	Q9NVH0	621 aa		2.76	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	MEMO1	Q9Y316	297 aa		2.76	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	PRSS37	A4D1T9	235 aa		2.75	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	TMEM150B	A6NC51	233 aa		2.75	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	SERPINE3	A8MV23	424 aa		2.75	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	GOLGA8S	H3BPF8	625 aa		2.75	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	BET1	O15155	118 aa		2.75	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	MAGEB3	O15480	346 aa		2.75	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	ANGPTL7	O43827	346 aa		2.75	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	ZDHHC11B	P0C7U3	371 aa		2.75	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	GKN3P	P0CG01	181 aa		2.75	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	CCR1	P32246	355 aa		2.75	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	GSS	P48637	474 aa		2.75	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	ZBED5	Q49AG3	693 aa		2.75	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	CES3	Q6UWW8	571 aa		2.75	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	C19orf35	Q6ZS72	473 aa		2.75	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	ABHD12B	Q7Z5M8	362 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	NUDCD3	Q8IVD9	361 aa		2.75	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		2.75	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		2.75	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		2.75	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	OR52H1	Q8NGJ2	320 aa		2.75	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	CD300LF	Q8TDQ1	290 aa		2.75	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	PYROXD1	Q8WU10	500 aa		2.75	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	EMG1	Q92979	244 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	BMF	Q96LC9	184 aa		2.75	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	TTC25	Q96NG3	672 aa		2.75	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	NPAS2	Q99743	824 aa		2.75	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	ZFP14	Q9HCL3	533 aa		2.75	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	CTPS2	Q9NRF8	586 aa		2.75	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	SH3BGRL2	Q9UJC5	107 aa		2.75	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	SLIT3	O75094	1523 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	OR5B21	A6NL26	309 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	PRKAB2	O43741	272 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	TOM1	O60784	492 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	SLC2A5	P22732	501 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	PMEL	P40967	661 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	GRIA1	P42261	906 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	ACVR1	Q04771	509 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	PLD1	Q13393	1074 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	SGCA	Q16586	387 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	SFT2D3	Q587I9	215 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	ATAD3B	Q5T9A4	648 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	LCN12	Q6JVE5	192 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615		Q6ZPB1	254 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	PEX26	Q7Z412	305 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	OR2T34	Q8NGX1	318 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	CTRC	Q99895	268 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	SCRT1	Q9BWW7	348 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	DNTTIP1	Q9H147	329 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	RAB18	Q9NP72	206 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	SMOX	Q9NWM0	555 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CBWD5-231	ENST00000495615	CALY	Q9NYX4	217 aa		2.74	□□□□□ -1.97

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