RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489344.5

RBM3-208, Transcript of RNA binding motif protein 3, human

TSL 2

Gene RBM3, Length 724 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM3-208	ENST00000489344	ICAM5	Q9UMF0	924 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF443	Q9Y2A4	671 aa	Predicted RBP	12.09	□□□□□ -0.47
RBM3-208	ENST00000489344		A0A0A6YYJ9	748 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	BCAS1	O75363	584 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	RGS9	O75916	674 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	MFN2	O95140	757 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	NUDT14	O95848	222 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	IGHV3-9	P01782	118 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	GSK3B	P49841	420 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	SUMO3	P55854	103 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	SKP2	Q13309	424 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	ZSWIM7	Q19AV6	140 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	MRPL2	Q5T653	305 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF836	Q6ZNA1	936 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	CCDC80	Q76M96	950 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	PATL1	Q86TB9	770 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	DEFB107A	Q8IZN7	70 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	UBE2J2	Q8N2K1	259 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	TMCO5A	Q8N6Q1	288 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	FAM71C	Q8NEG0	241 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	TOR1AIP2	Q8NFQ8	470 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	OR5W2	Q8NH69	310 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	GPR119	Q8TDV5	335 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	CDRT15	Q96T59	188 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	FKRP	Q9H9S5	495 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	RLIM	Q9NVW2	624 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	GMPR2	Q9P2T1	348 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344		A0A1W2PNR3	127 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	CDHR4	A6H8M9	788 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	PRORSD1P	A6NEY8	169 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	DNAJA2	O60884	412 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	SLC7A1	P30825	629 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	PRKAR1B	P31321	381 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	IL2RG	P31785	369 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	CCR4	P51679	360 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	PLAUR	Q03405	335 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	CBFB	Q13951	182 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	MST1L	Q2TV78	715 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	RNF220	Q5VTB9	566 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	C6orf89	Q6UWU4	347 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	GALNT5	Q7Z7M9	940 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	ARMC8	Q8IUR7	673 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	LINC01356	Q8N9X3	169 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF540	Q8NDQ6	660 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	BHLHE22	Q8NFJ8	381 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	SLC26A7	Q8TE54	656 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	KCTD14	Q9BQ13	255 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	RSPO3	Q9BXY4	272 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	C1orf21	Q9H246	121 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	METTL17	Q9H7H0	456 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	MYOZ1	Q9NP98	299 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	EXOSC3	Q9NQT5	275 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	TAS2R1	Q9NYW7	299 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	CHST2	Q9Y4C5	530 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	TMEM89	A2RUT3	159 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	GSTA4	O15217	222 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	TPST1	O60507	370 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	CYTIP	O60759	359 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	GKN3P	P0CG01	181 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	PGC	P20142	388 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	APEX1	P27695	318 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	KDELR2	P33947	212 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	RYK	P34925	604 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	RAC3	P60763	192 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	SNRPD2	P62316	118 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	DEFA6	Q01524	100 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	TOMM34	Q15785	309 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	DHRS4L2	Q6PKH6	230 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	SLC46A3	Q7Z3Q1	461 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	RNF148	Q8N7C7	305 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	SMYD1	Q8NB12	490 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	CD300A	Q9UGN4	299 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	PRKDC	P78527	4128 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	CFAP73	A6NFT4	308 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF724	A8MTY0	619 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	FAM157A	C9JC47	383 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	ATP6V1G2-DDX39B	F2Z307	99 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	CXCR6	O00574	342 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	IFNA14	P01570	189 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	OPN1SW	P03999	348 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	HSD17B1	P14061	328 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	ACAA2	P42765	397 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	CHN2	P52757	468 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	BNIP1	Q12981	228 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	QPRT	Q15274	297 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	DUSP7	Q16829	419 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	SPATS1	Q496A3	300 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	GLIPR1L2	Q4G1C9	344 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	SAMD4B	Q5PRF9	694 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	FBXW9	Q5XUX1	488 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF563	Q8TA94	476 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	RASSF5	Q8WWW0	418 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	TMEM234	Q8WY98	164 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	TAMM41	Q96BW9	452 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF524	Q96C55	264 aa		12.05	□□□□□ -0.48

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