RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479397.2

CNOT10-215, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 10, human

TSL 5

Gene CNOT10, Length 474 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT10-215	ENST00000479397	RPL36A-HNRNPH2	H7BZ11	118 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397		K7EIL1	84 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	MANBA	O00462	879 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	EREG	O14944	169 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	ZNF208	O43345	1280 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	GPR137B	O60478	399 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	SMIM24	O75264	130 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	RSL1D1	O76021	490 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	OR4F21	O95013	312 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	VAMP5	O95183	116 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	KLHL2	O95198	593 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	TGDS	O95455	350 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	CSTA	P01040	98 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	GPI	P06744	558 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	MELTF	P08582	738 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	KRT16	P08779	473 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	UBTFL6	P0CB48	400 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	CD79A	P11912	226 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	ZNF35	P13682	527 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	HMOX2	P30519	316 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	CD80	P33681	288 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	SLC6A9	P48067	706 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	SELENOP	P49908	381 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	MAP2K6	P52564	334 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	BTK	Q06187	659 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	HERPUD1	Q15011	391 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	RASA2	Q15283	850 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	PRSS53	Q2L4Q9	553 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	TTMP	Q5BVD1	217 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	SPDYA	Q5MJ70	313 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	DCST2	Q5T1A1	773 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	PDZK1	Q5T2W1	519 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	PRAMEF8	Q5VWM4	474 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	PRAMEF7	Q5VXH5	474 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	FAM71E1	Q6IPT2	247 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	NIPAL3	Q6P499	406 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	GDPGP1	Q6ZNW5	385 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	LINGO2	Q7L985	606 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	CTAGE3P	Q8IX95	158 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	C1orf174	Q8IYL3	243 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	ZIC4	Q8N9L1	334 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	SYNPR	Q8TBG9	265 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	ADAMTS15	Q8TE58	950 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	PYROXD1	Q8WU10	500 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	LRTOMT	Q8WZ04	291 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	OTUB1	Q96FW1	271 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	C16orf58	Q96GQ5	468 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	KRTAP4-8	Q9BYQ9	185 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	ACPT	Q9BZG2	426 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	CENPH	Q9H3R5	247 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	DENND2D	Q9H6A0	471 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	NANOG	Q9H9S0	305 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	GRPEL1	Q9HAV7	217 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	PATZ1	Q9HBE1	687 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	ZCCHC3	Q9NUD5	404 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	SIRT5	Q9NXA8	310 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	KIF17	Q9P2E2	1029 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	NIPSNAP3A	Q9UFN0	247 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	EPB41L3	Q9Y2J2	1087 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	PCDHGB5	Q9Y5G0	923 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	SOX21	Q9Y651	276 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	CACNG2	Q9Y698	323 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	DNAH9	Q9NYC9	4486 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	IGLV3-9	A0A075B6K5	115 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	LCE6A	A0A183	80 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	TCRBV9S1A1T	A0A576	114 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	PLSCR5	A0PG75	271 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	ZNF503-AS2	A6NEH8	195 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	FAM159B	A6NKW6	160 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	AQP7P3	A6NL99	342 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	ZNF99	A8MXY4	864 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397		E7ESA3	106 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397		E9PQ18	207 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	POC1B-GALNT4	F8VUJ3	575 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397		H0YL77	283 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	PGRMC1	O00264	195 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	UPK3A	O75631	287 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	AKR7A3	O95154	331 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	RAB36	O95755	333 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	HMGN2	P05204	90 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	C2	P06681	752 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	RPS17	P08708	135 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	RBP1	P09455	135 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	IMPDH2	P12268	514 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	ZNF250	P15622	560 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	CHN1	P15882	459 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	ZNF14	P17017	642 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	DRD4	P21917	467 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	SSTR1	P30872	391 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-215	ENST00000479397	EGR3	Q06889	387 aa		4.56	□□□□□ -1.68

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