RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880		A0A096LPE4	126 aa		13	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880		A0A1W2PPZ6	126 aa		13	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	OR6C65	A6NJZ3	312 aa		13	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF726	A6NNF4	738 aa		13	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880		M0R3G1	203 aa		13	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	WNT11	O96014	354 aa		13	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	HIST1H2AB	P04908	130 aa		13	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	DRD4	P21917	467 aa		13	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	KDELR2	P33947	212 aa		13	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	CAPZA2	P47755	286 aa		13	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	PRPS1	P60891	318 aa		13	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	ADAM8	P78325	824 aa		13	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	13	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880		Q5PR19	223 aa		13	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	WDR88	Q6ZMY6	472 aa		13	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	HIST3H2A	Q7L7L0	130 aa		13	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	SSX8	Q7RTT4	187 aa		13	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	DEPDC4	Q8N2C3	294 aa		13	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	PIK3C3	Q8NEB9	887 aa		13	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	WFDC11	Q8NEX6	87 aa		13	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	HIST1H2AC	Q93077	130 aa		13	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	FAM162A	Q96A26	154 aa		13	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	MUS81	Q96NY9	551 aa		13	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	HOPX	Q9BPY8	73 aa	Predicted RBP	13	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	CXXC4	Q9H2H0	198 aa		13	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	ALG2	Q9H553	416 aa		13	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		13	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	SLC17A5	Q9NRA2	495 aa		13	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	ADA2	Q9NZK5	511 aa		13	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	AP3M1	Q9Y2T2	418 aa		13	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	SLC25A15	Q9Y619	301 aa		13	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	ALPK2	Q86TB3	2170 aa		13	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	HEATR1	Q9H583	2144 aa	Known RBP	13	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	NME4	O00746	187 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	RNF13	O43567	381 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	HPR	P00739	348 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	HLA-DOB	P13765	273 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	IFNA8	P32881	189 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	CRYBA2	P53672	197 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	TUBA1B	P68363	451 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	TUBA4A	P68366	448 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	LTB	Q06643	244 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	PUDP	Q08623	228 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	SPOCK1	Q08629	439 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	12.99	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	CAMK2D	Q13557	499 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	12.99	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	TUBA1A	Q71U36	451 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	SLC15A3	Q8IY34	581 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF611	Q8N823	705 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	12.99	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	OR6N1	Q8NGY5	312 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	OR5J2	Q8NH18	312 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	SMAP2	Q8WU79	429 aa	Predicted RBP	12.99	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	KCTD14	Q9BQ13	255 aa	Predicted RBP	12.99	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	KCNS3	Q9BQ31	491 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM204	Q9BSN7	226 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	NANS	Q9NR45	359 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	MED29	Q9NX70	200 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	MRPL39	Q9NYK5	338 aa	Known RBP	12.99	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	CISD1	Q9NZ45	108 aa	Known RBP	12.99	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	B3GAT1	Q9P2W7	334 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	RCE1	Q9Y256	329 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	MAGED1	Q9Y5V3	778 aa	Predicted RBP	12.99	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	ATP23	Q9Y6H3	246 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	MS4A18	H0YCH9	400 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	PDLIM1	O00151	329 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	CXCR6	O00574	342 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	TRAF3IP2	O43734	574 aa	Predicted RBP	12.98	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	SNX3	O60493	162 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	GMNN	O75496	209 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	SEC14L2	O76054	403 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	MT-ATP6	P00846	226 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	THY1	P04216	161 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	NCK1	P16333	377 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	PTAFR	P25105	342 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	YAP1	P46937	504 aa	Known RBP	12.98	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	GSK3B	P49841	420 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	PSME3	P61289	254 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	RPS4X	P62701	263 aa	Known RBP	12.98	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	MXRA7	P84157	204 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	SLC25A3	Q00325	362 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	MS4A18	Q3C1V0	323 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	TBRG1	Q3YBR2	411 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	FKBP9P1	Q75LS8	142 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	LINGO2	Q7L985	606 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	NANOGNB	Q7Z5D8	188 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	TSPYL5	Q86VY4	417 aa	Predicted RBP	12.98	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	KRTAP1-3	Q8IUG1	177 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	C17orf78	Q8N4C9	275 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	SCAI	Q8N9R8	606 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	ADPRHL1	Q8NDY3	354 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	OR1K1	Q8NGR3	316 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	OR6S1	Q8NH40	331 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	MPP4	Q96JB8	637 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	PIP5K1A	Q99755	562 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	CRLF2	Q9HC73	371 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	B3GAT2	Q9NPZ5	323 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	FAIM	Q9NVQ4	179 aa		12.98	□□□□□ -0.33

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