RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467329.5

PRPF3-202, Transcript of pre-mRNA processing factor 3, humanhuman

TSL 5

Gene PRPF3, Length 2,595 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3-202ENST00000467329 RNF13O43567 381 aa8.5□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 GLCEO94923 617 aa8.5□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 SBK2P0C263 348 aa8.5□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 LIMS3P0CW19 117 aa8.5□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 LIMS4P0CW20 117 aa8.5□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 CD36P16671 472 aa8.5□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 BLVRAP53004 296 aa8.5□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 SLC35A1P78382 337 aa8.5□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 BDH1Q02338 343 aa8.5□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 HSF2Q03933 536 aa8.5□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 TGIF1Q15583 401 aa8.5□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 OR7A5Q15622 319 aa8.5□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa8.5□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 KLHL12Q53G59 568 aa8.5□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 MESTQ5EB52 335 aa8.5□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 ARMCX4Q5H9R4 360 aa8.5□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 LEG1Q6P5S2 330 aa8.5□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 ASB18Q6ZVZ8 466 aa8.5□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 HDDC2Q7Z4H3 204 aa8.5□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 PXKQ7Z7A4 578 aa8.5□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 KLHL36Q8N4N3 616 aa8.5□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 CYB561A3Q8NBI2 242 aa8.5□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 ZNF485Q8NCK3 441 aa8.5□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 OR2T4Q8NH00 348 aa8.5□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 MIB2Q96AX9 1013 aa8.5□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 OTULINQ96BN8 352 aa8.5□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 ARL5BQ96KC2 179 aa8.5□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 OPALINQ96PE5 141 aa8.5□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 OR5M11Q96RB7 305 aa8.5□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 MNTQ99583 582 aa8.5□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 ZNF649Q9BS31 505 aa8.5□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 OR51V1Q9H2C8 321 aa8.5□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 ZFP64Q9NPA5 681 aa8.5□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 ERVK13-1Q9NX77 482 aa8.5□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 CLEC2DQ9UHP7 191 aa8.5□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 NOX1Q9Y5S8 564 aa8.5□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 OR6C68A6NDL8 312 aa8.49□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 MS4A18H0YCH9 400 aa8.49□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 CCRL2O00421 344 aa8.49□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 XKRYO14609 159 aa8.49□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 NEURL1O76050 574 aa8.49□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 IL11P20809 199 aa8.49□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 ATP6V1E1P36543 226 aa8.49□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 LIPAP38571 399 aa8.49□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 DNASE1L1P49184 302 aa8.49□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 RGS6P49758 472 aa8.49□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 B3GALT5-AS1P59052 145 aa8.49□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 RPS7P62081 194 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 RAC1P63000 192 aa8.49□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 CLN3Q13286 438 aa8.49□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 MED22Q15528 200 aa8.49□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 CTF1Q16619 201 aa8.49□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 MS4A18Q3C1V0 323 aa8.49□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa8.49□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa8.49□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 MDS2Q8NDY4 140 aa8.49□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 OR2M7Q8NG81 312 aa8.49□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 OR4F15Q8NGB8 312 aa8.49□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 OR51G2Q8NGK0 314 aa8.49□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa8.49□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 AGAP4Q96P64 663 aa8.49□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 NMNAT3Q96T66 252 aa8.49□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 TSC22D3Q99576 134 aa8.49□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 YIPF3Q9GZM5 350 aa8.49□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 B4GALT7Q9UBV7 327 aa8.49□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 FKBP7Q9Y680 259 aa8.49□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 MUC3AQ02505 3323 aa8.49□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 A0A0G2JMM0 328 aa8.49□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 A0A1W2PPB8 328 aa8.49□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 A0A1W2PRS3 328 aa8.49□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 OR2M5A3KFT3 312 aa8.49□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 KIR3DP1A8MWS1 328 aa8.49□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 SHISA8B8ZZ34 492 aa8.49□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 F13BP05160 661 aa8.49□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 OR2T7P0C7T2 308 aa8.49□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 TLE3Q04726 772 aa8.49□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 FOXO1Q12778 655 aa8.49□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 TPBGQ13641 420 aa8.49□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 GALEQ14376 348 aa8.49□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 OR1C1Q15619 314 aa8.49□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 ACKR1Q16570 336 aa8.49□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa8.49□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa8.49□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 TMPPEQ6ZT21 453 aa8.49□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 OR2T27Q8NH04 317 aa8.49□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 GNRHR2Q96P88 292 aa8.49□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 MARCH7Q9H992 704 aa8.49□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 DEPPQ9NTK1 212 aa8.49□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 POLHQ9Y253 713 aa8.49□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 VCANP13611 3396 aa8.49□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 PCNX3Q9H6A9 2034 aa8.49□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 USP34Q70CQ2 3546 aa8.48□□□□□ -1.05
PRPF3-202ENST00000467329 PRSS37A4D1T9 235 aa8.48□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.8 ms