RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415409.5

HDAC8-211, Transcript of histone deacetylase 8, humanhuman

TSL 5

Gene HDAC8, Length 913 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8-211ENST00000415409 XKRYO14609 159 aa5.99□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 GABARAPO95166 117 aa5.99□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 ATE1O95260 518 aa5.99□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 TXNDC12O95881 172 aa5.99□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 BCL10O95999 233 aa5.99□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 RENP00797 406 aa5.99□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 SCG5P05408 212 aa5.99□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 CCL3P10147 92 aa5.99□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 TFPIP10646 304 aa5.99□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 CEACAM1P13688 526 aa5.99□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 F8A1P23610 371 aa5.99□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 GRNP28799 593 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 GRPRP30550 384 aa5.99□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 SDHAP31040 664 aa5.99□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 UQCRC1P31930 480 aa5.99□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 IDUAP35475 653 aa5.99□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 LIPAP38571 399 aa5.99□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 CASRP41180 1078 aa5.99□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 CAPZA2P47755 286 aa5.99□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 RGS6P49758 472 aa5.99□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 CLK1P49759 484 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 LTBQ06643 244 aa5.99□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 Q0VFX4 171 aa5.99□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 FOXF1Q12946 379 aa5.99□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 LSAMPQ13449 338 aa5.99□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 IL10RAQ13651 578 aa5.99□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 ATP1A4Q13733 1029 aa5.99□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 PON3Q15166 354 aa5.99□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 SGCBQ16585 318 aa5.99□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 PLPPR5Q32ZL2 321 aa5.99□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 GXYLT1Q4G148 440 aa5.99□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 SLC35D3Q5M8T2 416 aa5.99□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 ABHD17BQ5VST6 288 aa5.99□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 PRAMEF20Q5VT98 475 aa5.99□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 H3F3CQ6NXT2 135 aa5.99□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 LEG1Q6P5S2 330 aa5.99□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 ARSKQ6UWY0 536 aa5.99□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa5.99□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 KLHL36Q8N4N3 616 aa5.99□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 ACBD7Q8N6N7 88 aa5.99□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 SIRT6Q8N6T7 355 aa5.99□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 FADS6Q8N9I5 356 aa5.99□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 CYB561A3Q8NBI2 242 aa5.99□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 SDR9C7Q8NEX9 313 aa5.99□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa5.99□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 OR51G2Q8NGK0 314 aa5.99□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 OR1J4Q8NGS1 313 aa5.99□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 MFSD8Q8NHS3 518 aa5.99□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 PTP4A1Q93096 173 aa5.99□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 NKD1Q969G9 470 aa5.99□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 FRMD6Q96NE9 622 aa5.99□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 TEAD3Q99594 435 aa5.99□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa5.99□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 PTDSS2Q9BVG9 487 aa5.99□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 JAM3Q9BX67 310 aa5.99□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 ISYNA1Q9NPH2 558 aa5.99□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 KLHL1Q9NR64 748 aa5.99□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 INIPQ9NRY2 104 aa5.99□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 HAO2Q9NYQ3 351 aa5.99□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 TAS2R16Q9NYV7 291 aa5.99□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 STMN3Q9NZ72 180 aa5.99□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 CLEC2DQ9UHP7 191 aa5.99□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 DKKL1Q9UK85 242 aa5.99□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa5.99□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa5.99□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa5.98□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 DAPL1A0PJW8 107 aa5.98□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 CCDC182A6NF36 153 aa5.98□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 TRIM64BA6NI03 449 aa5.98□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 MASP2O00187 686 aa5.98□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 PLPP3O14495 311 aa5.98□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 RNF13O43567 381 aa5.98□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 AHCYL1O43865 530 aa5.98□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 AIREO43918 545 aa5.98□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 CBR3O75828 277 aa5.98□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 SERPINI2O75830 405 aa5.98□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 APOL3O95236 402 aa5.98□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 GHRHP01286 108 aa5.98□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 F13BP05160 661 aa5.98□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 TSPAN19P0C672 248 aa5.98□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 LIFP15018 202 aa5.98□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 AHCYP23526 432 aa5.98□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 ITGA3P26006 1051 aa5.98□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 DPP4P27487 766 aa5.98□□□□□ -1.45
HDAC8-211ENST00000415409 TGFBR2P37173 567 aa5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms