RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411092.1

RNU6-55P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 55, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-55P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-55P-201ENST00000411092 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
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RNU6-55P-201ENST00000411092 ZNF558Q96NG5 402 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 MS4A4EQ96PG1 132 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 BBS4Q96RK4 519 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 SLC22A12Q96S37 553 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 CD180Q99467 661 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
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RNU6-55P-201ENST00000411092 VN1R3Q9BXE9 311 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 CACNG6Q9BXT2 260 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 OR52A5Q9H2C5 316 aa3.23□□□□□ -1.89
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RNU6-55P-201ENST00000411092 EGLN3Q9H6Z9 239 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 MVB12BQ9H7P6 319 aa3.23□□□□□ -1.89
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RNU6-55P-201ENST00000411092 POLE3Q9NRF9 147 aa3.23□□□□□ -1.89
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RNU6-55P-201ENST00000411092 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 TAS2R8Q9NYW2 309 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 TRPC4Q9UBN4 977 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 CD84Q9UIB8 345 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZNF222Q9UK12 451 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 FBXL3Q9UKT7 428 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 POMT2Q9UKY4 750 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 ACSL5Q9ULC5 683 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 SPATA2Q9UM82 520 aa3.23□□□□□ -1.89
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RNU6-55P-201ENST00000411092 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 ETV7Q9Y603 341 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 LTBP2Q14767 1821 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa3.23□□□□□ -1.89
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RNU6-55P-201ENST00000411092 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 A0A0G2JK05 382 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 A0A1W2PRG6 482 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 TRAPPC13A5PLN9 417 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 TBC1D3BA6NDS4 549 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 MFSD2BA6NFX1 497 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 CD8B2A6NJW9 211 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 HSPB2A8KAH6 182 aa3.22□□□□□ -1.89
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RNU6-55P-201ENST00000411092 AQP8O94778 261 aa3.22□□□□□ -1.89
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RNU6-55P-201ENST00000411092 OPRD1P41143 372 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 RBM34P42696 430 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 SSR2P43308 183 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP3.22□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 CASP9P55211 416 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 GMFBP60983 142 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 FUT5Q11128 374 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 GGTLC2Q14390 218 aa3.22□□□□□ -1.89
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