RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410856.1

RNU2-38P-201, Transcript of RNA, U2 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU2-38P, Length 79 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU2-38P-201ENST00000410856 FSIP2Q5CZC0 6907 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU2-38P-201ENST00000410856 A0A0U1RRA0 63 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU2-38P-201ENST00000410856 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU2-38P-201ENST00000410856 ARHGEF35A5YM69 484 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU2-38P-201ENST00000410856 SDHAF1A6NFY7 115 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU2-38P-201ENST00000410856 ZNF716A6NP11 495 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU2-38P-201ENST00000410856 CCER2I3L3R5 266 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU2-38P-201ENST00000410856 STAMBPO95630 424 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU2-38P-201ENST00000410856 CBR1P16152 277 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU2-38P-201ENST00000410856 BDNFP23560 247 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU2-38P-201ENST00000410856 CALCRP30988 508 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU2-38P-201ENST00000410856 GPM6AP51674 278 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU2-38P-201ENST00000410856 CDH4P55283 916 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU2-38P-201ENST00000410856 C12orf60Q5U649 245 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU2-38P-201ENST00000410856 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU2-38P-201ENST00000410856 TCF24Q7RTU0 167 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU2-38P-201ENST00000410856 SERPINA12Q8IW75 414 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU2-38P-201ENST00000410856 CCDC89Q8N998 374 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU2-38P-201ENST00000410856 LRRC75AQ8NAA5 344 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU2-38P-201ENST00000410856 LPCAT1Q8NF37 534 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU2-38P-201ENST00000410856 OR51G2Q8NGK0 314 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU2-38P-201ENST00000410856 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU2-38P-201ENST00000410856 ABHD3Q8WU67 409 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU2-38P-201ENST00000410856 FGF11Q92914 225 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU2-38P-201ENST00000410856 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU2-38P-201ENST00000410856 TBL1YQ9BQ87 522 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU2-38P-201ENST00000410856 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP-0.08□□□□□ -2.42
RNU2-38P-201ENST00000410856 TAS2R1Q9NYW7 299 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU2-38P-201ENST00000410856 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU2-38P-201ENST00000410856 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU2-38P-201ENST00000410856 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU2-38P-201ENST00000410856 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU2-38P-201ENST00000410856 A4D1N5 150 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU2-38P-201ENST00000410856 WASH3PC4AMC7 463 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU2-38P-201ENST00000410856 RP2O75695 350 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU2-38P-201ENST00000410856 YIF1AO95070 293 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU2-38P-201ENST00000410856 F10P00742 488 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU2-38P-201ENST00000410856 LGALS2P05162 132 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU2-38P-201ENST00000410856 CSNK1A1P48729 337 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU2-38P-201ENST00000410856 DAP3P51398 398 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU2-38P-201ENST00000410856 BFSP1Q12934 665 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU2-38P-201ENST00000410856 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU2-38P-201ENST00000410856 FZD2Q14332 565 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU2-38P-201ENST00000410856 TRIM16LQ309B1 348 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU2-38P-201ENST00000410856 AFTPHQ6ULP2 937 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU2-38P-201ENST00000410856 WASH2PQ6VEQ5 465 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU2-38P-201ENST00000410856 TMEM135Q86UB9 458 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU2-38P-201ENST00000410856 ZNF502Q8TBZ5 544 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU2-38P-201ENST00000410856 C15orf40Q8WUR7 153 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU2-38P-201ENST00000410856 SHC3Q92529 594 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU2-38P-201ENST00000410856 RNF145Q96MT1 663 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU2-38P-201ENST00000410856 SLC35A5Q9BS91 424 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU2-38P-201ENST00000410856 CENPOQ9BU64 300 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU2-38P-201ENST00000410856 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU2-38P-201ENST00000410856 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU2-38P-201ENST00000410856 KCNIP1Q9NZI2 227 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU2-38P-201ENST00000410856 P2RX2Q9UBL9 471 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU2-38P-201ENST00000410856 STAP1Q9ULZ2 295 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU2-38P-201ENST00000410856 NPIPA1Q9UND3 350 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU2-38P-201ENST00000410856 AP4B1Q9Y6B7 739 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU2-38P-201ENST00000410856 ZBED9Q6R2W3 1325 aa-0.1□□□□□ -2.42
RNU2-38P-201ENST00000410856 TRAV6A0A075B6T7 132 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU2-38P-201ENST00000410856 A0A0U1RQV1 116 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU2-38P-201ENST00000410856 CIB4A0PJX0 185 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU2-38P-201ENST00000410856 BTNL10A8MVZ5 291 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU2-38P-201ENST00000410856 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP-0.1□□□□□ -2.43
RNU2-38P-201ENST00000410856 DUX1O43812 170 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU2-38P-201ENST00000410856 HLA-DPB1P04440 258 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU2-38P-201ENST00000410856 ASGR1P07306 291 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU2-38P-201ENST00000410856 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP-0.1□□□□□ -2.43
RNU2-38P-201ENST00000410856 HSD17B7P56937 341 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU2-38P-201ENST00000410856 MICBQ29980 383 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU2-38P-201ENST00000410856 PYDC2Q56P42 97 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU2-38P-201ENST00000410856 OR2A2Q6IF42 318 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU2-38P-201ENST00000410856 C16orf54Q6UWD8 224 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU2-38P-201ENST00000410856 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP-0.1□□□□□ -2.43
RNU2-38P-201ENST00000410856 TMEM17Q86X19 198 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU2-38P-201ENST00000410856 STPG2Q8N412 459 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU2-38P-201ENST00000410856 MREGQ8N565 214 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU2-38P-201ENST00000410856 LY6G5BQ8NDX9 201 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU2-38P-201ENST00000410856 VN1R2Q8NFZ6 395 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU2-38P-201ENST00000410856 OR4K5Q8NGD3 323 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU2-38P-201ENST00000410856 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU2-38P-201ENST00000410856 HTR3CQ8WXA8 447 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU2-38P-201ENST00000410856 HPDLQ96IR7 371 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU2-38P-201ENST00000410856 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP-0.1□□□□□ -2.43
RNU2-38P-201ENST00000410856 SIRPDQ9H106 197 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU2-38P-201ENST00000410856 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP-0.1□□□□□ -2.43
RNU2-38P-201ENST00000410856 AIPL1Q9NZN9 384 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU2-38P-201ENST00000410856 XCL2Q9UBD3 114 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU2-38P-201ENST00000410856 ATP6V1HQ9UI12 483 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU2-38P-201ENST00000410856 CBY1Q9Y3M2 126 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU2-38P-201ENST00000410856 ANKRD12Q6UB98 2062 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU2-38P-201ENST00000410856 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa-0.11□□□□□ -2.43
RNU2-38P-201ENST00000410856 A0A1B0GUS0 222 aa-0.11□□□□□ -2.43
RNU2-38P-201ENST00000410856 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP-0.11□□□□□ -2.43
RNU2-38P-201ENST00000410856 RASGRF2O14827 1237 aa-0.11□□□□□ -2.43
RNU2-38P-201ENST00000410856 STX7O15400 261 aaKnown RBP-0.11□□□□□ -2.43
RNU2-38P-201ENST00000410856 CCDC22O60826 627 aa-0.11□□□□□ -2.43
RNU2-38P-201ENST00000410856 HSF2BPO75031 334 aa-0.11□□□□□ -2.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms