RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395322.3

CTXN3-202, Transcript of cortexin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTXN3, Length 1,458 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3-202ENST00000395322 CDRT1O95170 752 aa10.08□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 LALBAP00709 142 aa10.08□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 JMJD7P0C870 316 aa10.08□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 BLVRAP53004 296 aa10.08□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 LTBQ06643 244 aa10.08□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 TBC1D25Q3MII6 688 aa10.08□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 C4orf48Q5BLP8 95 aa10.08□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 TMEM81Q6P7N7 255 aa10.08□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 NDUFAF7Q7L592 441 aa10.08□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 RAB11FIP2Q7L804 512 aa10.08□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 SCAIQ8N9R8 606 aa10.08□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 PLPP7Q8NBV4 271 aa10.08□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 ZNF248Q8NDW4 579 aa10.08□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 SLC25A36Q96CQ1 311 aa10.08□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 C4orf36Q96KX1 117 aa10.08□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 IMMP1LQ96LU5 166 aa10.08□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 TSPAN32Q96QS1 320 aa10.08□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 MESP1Q9BRJ9 268 aa10.08□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 ALG12Q9BV10 488 aa10.08□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 PTDSS2Q9BVG9 487 aa10.08□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 TMED9Q9BVK6 235 aa10.08□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 PTGES2Q9H7Z7 377 aa10.08□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 SMURF1Q9HCE7 757 aa10.08□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 SERINC1Q9NRX5 453 aa10.08□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 SNTG1Q9NSN8 517 aa10.08□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 FBXL4Q9UKA2 621 aa10.08□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 PADI1Q9ULC6 663 aa10.08□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa10.08□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa10.08□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa10.08□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 BDP1A6H8Y1 2624 aa10.08□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 COL6A3P12111 3177 aa10.07□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 GABRPO00591 440 aa10.07□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 PLPP2O43688 288 aa10.07□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 ITGA10O75578 1167 aa10.07□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 SERPINA3P01011 423 aa10.07□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 IGHMP01871 453 aa10.07□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 F13BP05160 661 aa10.07□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 RAB40ALP0C0E4 278 aa10.07□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 ZNF806P0C7X5 589 aa10.07□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 ICAM2P13598 275 aa10.07□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 CD59P13987 128 aa10.07□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 GRPRP30550 384 aa10.07□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 RPS19P39019 145 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 ETV6P41212 452 aa10.07□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 FABP5Q01469 135 aa10.07□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 ZNF85Q03923 595 aa10.07□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 CDONQ4KMG0 1287 aa10.07□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 CCDC58Q4VC31 144 aa10.07□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 MESTQ5EB52 335 aa10.07□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 SLC25A53Q5H9E4 307 aa10.07□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 TMEM164Q5U3C3 297 aa10.07□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 PAMR1Q6UXH9 720 aa10.07□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 MS4A15Q8N5U1 240 aa10.07□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa10.07□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 ZFP41Q8N8Y5 198 aa10.07□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 MINDY2Q8NBR6 621 aa10.07□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 OR10G3Q8NGC4 313 aa10.07□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 MFSD8Q8NHS3 518 aa10.07□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 NEIL3Q8TAT5 605 aa10.07□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 SNX33Q8WV41 574 aa10.07□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 ASB15Q8WXK1 588 aa10.07□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 PMEPA1Q969W9 287 aa10.07□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 ZNF524Q96C55 264 aa10.07□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 TM9SF2Q99805 663 aa10.07□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 KLHDC3Q9BQ90 382 aa10.07□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 GALNT9Q9HCQ5 603 aa10.07□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 TMEM9BQ9NQ34 198 aa10.07□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 R4GN57 208 aa10.07□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 A0A1W2PRG6 482 aa10.06□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 NPIPB13A6NJU9 1138 aa10.06□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 C17orf51A8MQB3 221 aa10.06□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 NPIPB4C9JG80 1138 aa10.06□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa10.06□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 J3QLW9 94 aa10.06□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 PHYHO14832 338 aa10.06□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 CASKO14936 926 aa10.06□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 DKK1O94907 266 aa10.06□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 TFP02787 698 aa10.06□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 ZNF19P17023 458 aa10.06□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 EIF1P41567 113 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 CASP3P42574 277 aa10.06□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 SSR4P51571 173 aa10.06□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 RPL27P61353 136 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 FAM205BPQ63HN1 556 aa10.06□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 SLC6A19Q695T7 634 aa10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.5 ms