RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 HSD17B12Q53GQ0 312 aa17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1-201ENST00000357436 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1-201ENST00000357436 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1-201ENST00000357436 PHYHIPQ92561 330 aa17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1-201ENST00000357436 RASD2Q96D21 266 aa17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1-201ENST00000357436 SHDQ96IW2 340 aa17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1-201ENST00000357436 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1-201ENST00000357436 TEKT2Q9UIF3 430 aa17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1-201ENST00000357436 MGAT4AQ9UM21 535 aa17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1-201ENST00000357436 CEP192Q8TEP8 1941 aa17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1-201ENST00000357436 BLACEA4D250 179 aa17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1-201ENST00000357436 C17orf51A8MQB3 221 aa17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1-201ENST00000357436 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1-201ENST00000357436 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1-201ENST00000357436 GIFP27352 417 aa17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1-201ENST00000357436 CSF2RBP32927 897 aa17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1-201ENST00000357436 RAG2P55895 527 aa17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1-201ENST00000357436 ARPC4P59998 168 aa17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1-201ENST00000357436 ERVK-25P63136 954 aa17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM209AQ5JX71 171 aa17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1-201ENST00000357436 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1-201ENST00000357436 OR51Q1Q8NH59 317 aa17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1-201ENST00000357436 TSLPQ969D9 159 aa17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1-201ENST00000357436 MED30Q96HR3 178 aa17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1-201ENST00000357436 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1-201ENST00000357436 OR10A5Q9H207 317 aa17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1-201ENST00000357436 PTTG3PQ9NZH4 202 aa17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1-201ENST00000357436 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1-201ENST00000357436 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1-201ENST00000357436 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1-201ENST00000357436 CDC14CA4D256 554 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1-201ENST00000357436 CTDSPLO15194 276 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1-201ENST00000357436 PIN1P1O15428 100 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1-201ENST00000357436 GPRIN2O60269 458 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1-201ENST00000357436 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1-201ENST00000357436 PER3P56645 1201 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1-201ENST00000357436 HSF2Q03933 536 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1-201ENST00000357436 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1-201ENST00000357436 KLHL26Q53HC5 615 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1-201ENST00000357436 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1-201ENST00000357436 CADM4Q8NFZ8 388 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1-201ENST00000357436 CMTM3Q96MX0 182 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1-201ENST00000357436 CACNG6Q9BXT2 260 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC19A3Q9BZV2 496 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1-201ENST00000357436 PDE7BQ9NP56 450 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1-201ENST00000357436 OR10H1Q9Y4A9 318 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1-201ENST00000357436 ANXA3P12429 323 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1-201ENST00000357436 FOLR1P15328 257 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1-201ENST00000357436 SRMP19623 302 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1-201ENST00000357436 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1-201ENST00000357436 SKP1P63208 163 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1-201ENST00000357436 IL10RAQ13651 578 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1-201ENST00000357436 ESCO2Q56NI9 601 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1-201ENST00000357436 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1-201ENST00000357436 VWA2Q5GFL6 755 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1-201ENST00000357436 LINC01590Q5TEZ4 76 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF615Q8N8J6 731 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1-201ENST00000357436 OR11H4Q8NGC9 324 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1-201ENST00000357436 OR6K6Q8NGW6 343 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1-201ENST00000357436 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1-201ENST00000357436 LGALS14Q8TCE9 139 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1-201ENST00000357436 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1-201ENST00000357436 TCTN2Q96GX1 697 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1-201ENST00000357436 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1-201ENST00000357436 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1-201ENST00000357436 ANKRD10Q9NXR5 420 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF222Q9UK12 451 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1-201ENST00000357436 CPED1A4D0V7 1026 aa17.08■□□□□ 0.33
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF879B4DU55 563 aa17.08■□□□□ 0.33
SH3BP1-201ENST00000357436 CLDN4O14493 209 aa17.08■□□□□ 0.33
SH3BP1-201ENST00000357436 CXCL3P19876 107 aa17.08■□□□□ 0.33
SH3BP1-201ENST00000357436 CD1CP29017 333 aa17.08■□□□□ 0.33
SH3BP1-201ENST00000357436 EFNA3P52797 238 aa17.08■□□□□ 0.33
SH3BP1-201ENST00000357436 PRPS1P60891 318 aa17.08■□□□□ 0.33
SH3BP1-201ENST00000357436 IKZF1Q13422 519 aa17.08■□□□□ 0.33
SH3BP1-201ENST00000357436 OR8H1Q8NGG4 311 aa17.08■□□□□ 0.33
SH3BP1-201ENST00000357436 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.33
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.33
SH3BP1-201ENST00000357436 GFI1Q99684 422 aa17.08■□□□□ 0.33
SH3BP1-201ENST00000357436 NRSN2Q9GZP1 204 aa17.08■□□□□ 0.33
SH3BP1-201ENST00000357436 NOX4Q9NPH5 578 aa17.08■□□□□ 0.33
SH3BP1-201ENST00000357436 LEUTXA8MZ59 168 aa17.08■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 GLCEO94923 617 aa17.08■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 ANKRD34CP0C6C1 535 aa17.08■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 LPAL2Q16609 132 aa17.08■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 GSG1Q2KHT4 349 aa17.08■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 UBE2NLQ5JXB2 153 aa17.08■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF684Q5T5D7 378 aa17.08■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 PRSS45Q7RTY3 260 aa17.08■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 TIGD4Q8IY51 512 aa17.08■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa17.08■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 MOSPD2Q8NHP6 518 aa17.08■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 DERL3Q96Q80 235 aa17.08■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM265A0A087WTH1 108 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 IDSB3KWA1 339 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 GDF9O60383 454 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 NSA2O95478 260 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 GIMD1P0DJR0 217 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 GABRA4P48169 554 aa17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms