RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000336128.11

ZNF548-201, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene ZNF548, Length 2,115 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-201ENST00000336128 OR12D2P58182 307 aa11.24□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 GPR50Q13585 617 aa11.24□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 SLC25A53Q5H9E4 307 aa11.24□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 SLC6A19Q695T7 634 aa11.24□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 MARCH9Q86YJ5 346 aa11.24□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 SYT14Q8NB59 555 aa11.24□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 SUMF1Q8NBK3 374 aa11.24□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 POC1BQ8TC44 478 aa11.24□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 MRGPRX4Q96LA9 322 aa11.24□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 TSSK2Q96PF2 358 aa11.24□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 COQ7Q99807 217 aa11.24□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 KCNS3Q9BQ31 491 aa11.24□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 BARHL1Q9BZE3 327 aa11.24□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 SPRY4Q9C004 299 aa11.24□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 NUAK2Q9H093 628 aa11.24□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 FOXJ2Q9P0K8 574 aa11.24□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 FBXL2Q9UKC9 423 aa11.24□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 MOKQ9UQ07 419 aa11.24□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa11.24□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa11.24□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 A0A075B6Q4 140 aa11.23□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa11.23□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 PLGP00747 810 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 HLA-DPB1P04440 258 aa11.23□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 AHCYP23526 432 aa11.23□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 CAPZA2P47755 286 aa11.23□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 RORCP51449 518 aa11.23□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 SSR4P51571 173 aa11.23□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 MLF1P58340 268 aa11.23□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 TAS2R43P59537 309 aa11.23□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 MXD1Q05195 221 aa11.23□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 TP53I3Q53FA7 332 aa11.23□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 PRAMEF20Q5VT98 475 aa11.23□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 FADS6Q8N9I5 356 aa11.23□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 OR4K17Q8NGC6 315 aa11.23□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 DDIT4LQ96D03 193 aa11.23□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 MED18Q9BUE0 208 aa11.23□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 HDHD5Q9BXW7 423 aa11.23□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 SMURF1Q9HCE7 757 aa11.23□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 GALNT8Q9NY28 637 aa11.23□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 COPS3Q9UNS2 423 aa11.23□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa11.23□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 PEX16Q9Y5Y5 336 aa11.23□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 CD8B2A6NJW9 211 aa11.23□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 GABRPO00591 440 aa11.23□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 ARHGEF9O43307 516 aa11.23□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 IGHMP01871 453 aa11.23□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 TFPIP10646 304 aa11.23□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 CD8BP10966 210 aa11.23□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 S100A5P33763 92 aa11.23□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 SDC2P34741 201 aa11.23□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 ACVR1BP36896 505 aa11.23□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 RPL27P61353 136 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 ACTA2P62736 377 aa11.23□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 ACTG2P63267 376 aa11.23□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 SNTA1Q13424 505 aa11.23□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 OR7A5Q15622 319 aa11.23□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 ACKR1Q16570 336 aa11.23□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 CDONQ4KMG0 1287 aa11.23□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 TMEM81Q6P7N7 255 aa11.23□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 ARL9Q6T311 187 aa11.23□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 DHRS13Q6UX07 377 aa11.23□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 SYS1Q8N2H4 156 aa11.23□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 ZNF511Q8NB15 262 aa11.23□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 OR2T4Q8NH00 348 aa11.23□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 MFSD8Q8NHS3 518 aa11.23□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 ZNF519Q8TB69 540 aa11.23□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 ARL5BQ96KC2 179 aa11.23□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 NCDNQ9UBB6 729 aa11.23□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa11.23□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 BDP1A6H8Y1 2624 aa11.23□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 DCTN6O00399 190 aa11.22□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 XKRYO14609 159 aa11.22□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 EFNA2O43921 213 aa11.22□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 HPP00738 406 aa11.22□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 IMPDH2P12268 514 aa11.22□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 SSPNQ14714 243 aa11.22□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 MFSD13AQ14CX5 517 aa11.22□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 HES3Q5TGS1 186 aa11.22□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 SLC16A9Q7RTY1 509 aa11.22□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 PM20D2Q8IYS1 436 aa11.22□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 WDSUB1Q8N9V3 476 aa11.22□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 SLC25A46Q96AG3 418 aa11.22□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 POTEKPQ9BYX7 375 aa11.22□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 SYT4Q9H2B2 425 aa11.22□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 TXNIPQ9H3M7 391 aa11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.2 ms