RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 IL1RL1Q01638 556 aa17.15■□□□□ 0.34
PTPRCAP-201ENST00000326294 TGFBR3Q03167 851 aa17.15■□□□□ 0.34
PTPRCAP-201ENST00000326294 PMS2P3Q13401 168 aa17.15■□□□□ 0.34
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF74Q16587 644 aa17.15■□□□□ 0.34
PTPRCAP-201ENST00000326294 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
PTPRCAP-201ENST00000326294 NHLRC1Q6VVB1 395 aa17.15■□□□□ 0.34
PTPRCAP-201ENST00000326294 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
PTPRCAP-201ENST00000326294 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa17.15■□□□□ 0.34
PTPRCAP-201ENST00000326294 UEVLDQ8IX04 471 aa17.15■□□□□ 0.34
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM123Q8N131 208 aa17.15■□□□□ 0.34
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF611Q8N823 705 aa17.15■□□□□ 0.34
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC19A3Q9BZV2 496 aa17.15■□□□□ 0.34
PTPRCAP-201ENST00000326294 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
PTPRCAP-201ENST00000326294 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
PTPRCAP-201ENST00000326294 ALG2Q9H553 416 aa17.15■□□□□ 0.34
PTPRCAP-201ENST00000326294 ABCD2Q9UBJ2 740 aa17.15■□□□□ 0.34
PTPRCAP-201ENST00000326294 MTORP42345 2549 aa17.14■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 VPS13CQ709C8 3753 aa17.14■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLPP3O14495 311 aa17.14■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 KRT33AO76009 404 aa17.14■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR5F1O95221 314 aa17.14■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP17.14■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF83P51522 516 aa17.14■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 TAS2R41P59536 307 aa17.14■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP17.14■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 PUDPQ08623 228 aa17.14■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 HIKESHIQ53FT3 197 aa17.14■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR1K1Q8NGR3 316 aa17.14■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR5J2Q8NH18 312 aa17.14■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 BOD1Q96IK1 185 aa17.14■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 TPD52L3Q96J77 140 aa17.14■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR2M2Q96R28 347 aa17.14■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 AMDHD2Q9Y303 409 aa17.14■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 USF3Q68DE3 2245 aa17.14■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 SHISA9B4DS77 424 aa17.13■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 CXCR6O00574 342 aa17.13■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 DYNC1I1O14576 645 aa17.13■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 ABCD4O14678 606 aa17.13■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP17.13■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 SMPD2O60906 423 aa17.13■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC43A1O75387 559 aa17.13■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 CH25HO95992 272 aa17.13■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 PSME3P61289 254 aa17.13■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 SELENOWP63302 87 aa17.13■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADAM8P78325 824 aa17.13■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPOCK1Q08629 439 aa17.13■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP17.13■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 TBRG1Q3YBR2 411 aa17.13■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP17.13■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa17.13■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 PIGWQ7Z7B1 504 aa17.13■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 NKAIN4Q8IVV8 208 aa17.13■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 WDFY1Q8IWB7 410 aa17.13■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa17.13■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 WFDC11Q8NEX6 87 aa17.13■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 FBXW5Q969U6 566 aa17.13■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 NELFAQ9H3P2 528 aa17.13■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 FKRPQ9H9S5 495 aa17.13■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP17.13■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 MED29Q9NX70 200 aa17.13■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 NOX1Q9Y5S8 564 aa17.13■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa17.12■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 HOXC12P31275 282 aa17.12■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 UGT2B15P54855 530 aa17.12■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 KLHL17Q6TDP4 642 aa17.12■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM108Q6UXF1 575 aa17.12■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 VTCN1Q7Z7D3 282 aa17.12■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 LRRC17Q8N6Y2 441 aa17.12■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM255BQ8WV15 326 aa17.12■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 TXNDC15Q96J42 360 aa17.12■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMUB1Q9BVT8 246 aa17.12■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa17.12■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 RIMS3Q9UJD0 308 aa17.12■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF229Q9UJW7 825 aa17.12■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa17.12■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 M0R1B8 84 aa17.11■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 NDUFAB1O14561 156 aa17.11■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 GSTA4O15217 222 aa17.11■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADORA3P0DMS8 318 aa17.11■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 THRBP10828 461 aa17.11■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 PTAFRP25105 342 aa17.11■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 CD40P25942 277 aa17.11■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 RBM34P42696 430 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDH11P55287 796 aa17.11■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 PHYHD1Q5SRE7 291 aa17.11■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa17.11■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 HMBOX1Q6NT76 420 aa17.11■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 KLHL24Q6TFL4 600 aa17.11■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 PXKQ7Z7A4 578 aa17.11■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 PIK3C3Q8NEB9 887 aa17.11■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANKK1Q8NFD2 765 aa17.11■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 PFN4Q8NHR9 129 aa17.11■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 LZICQ8WZA0 190 aa17.11■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRRC1Q96M27 445 aa17.11■□□□□ 0.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.9 ms