RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297537.4

GBX1-201, Transcript of gastrulation brain homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GBX1, Length 1,092 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1-201ENST00000297537 SEMG1P04279 462 aa20.61■□□□□ 0.89
GBX1-201ENST00000297537 ITGA5P08648 1049 aa20.61■□□□□ 0.89
GBX1-201ENST00000297537 IFNA8P32881 189 aa20.61■□□□□ 0.89
GBX1-201ENST00000297537 CLDN17P56750 224 aa20.61■□□□□ 0.89
GBX1-201ENST00000297537 ZP4Q12836 540 aa20.61■□□□□ 0.89
GBX1-201ENST00000297537 TAB1Q15750 504 aa20.61■□□□□ 0.89
GBX1-201ENST00000297537 IQCCQ4KMZ1 466 aa20.61■□□□□ 0.89
GBX1-201ENST00000297537 PFN4Q8NHR9 129 aa20.61■□□□□ 0.89
GBX1-201ENST00000297537 MUS81Q96NY9 551 aa20.61■□□□□ 0.89
GBX1-201ENST00000297537 NDUFAF4Q9P032 175 aa20.61■□□□□ 0.89
GBX1-201ENST00000297537 RHCGQ9UBD6 479 aa20.61■□□□□ 0.89
GBX1-201ENST00000297537 UPB1Q9UBR1 384 aa20.61■□□□□ 0.89
GBX1-201ENST00000297537 ENPP4Q9Y6X5 453 aa20.61■□□□□ 0.89
GBX1-201ENST00000297537 OR6C65A6NJZ3 312 aa20.6■□□□□ 0.89
GBX1-201ENST00000297537 ENO4A6NNW6 628 aa20.6■□□□□ 0.89
GBX1-201ENST00000297537 C1DQ13901 141 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
GBX1-201ENST00000297537 NIPAL3Q6P499 406 aa20.6■□□□□ 0.89
GBX1-201ENST00000297537 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa20.6■□□□□ 0.89
GBX1-201ENST00000297537 P2RY8Q86VZ1 359 aa20.6■□□□□ 0.89
GBX1-201ENST00000297537 UEVLDQ8IX04 471 aa20.6■□□□□ 0.89
GBX1-201ENST00000297537 PYURFQ96I23 114 aa20.6■□□□□ 0.89
GBX1-201ENST00000297537 BOD1Q96IK1 185 aa20.6■□□□□ 0.89
GBX1-201ENST00000297537 FNDC11Q9BVV2 318 aa20.6■□□□□ 0.89
GBX1-201ENST00000297537 LINC00470Q9BZP3 86 aa20.6■□□□□ 0.89
GBX1-201ENST00000297537 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa20.6■□□□□ 0.89
GBX1-201ENST00000297537 MED31Q9Y3C7 131 aa20.6■□□□□ 0.89
GBX1-201ENST00000297537 NOX1Q9Y5S8 564 aa20.6■□□□□ 0.89
GBX1-201ENST00000297537 TSPAN19P0C672 248 aa20.59■□□□□ 0.89
GBX1-201ENST00000297537 MPGP29372 298 aa20.59■□□□□ 0.89
GBX1-201ENST00000297537 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
GBX1-201ENST00000297537 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP20.59■□□□□ 0.89
GBX1-201ENST00000297537 TRAM2Q15035 370 aa20.59■□□□□ 0.89
GBX1-201ENST00000297537 GABRA6Q16445 453 aa20.59■□□□□ 0.89
GBX1-201ENST00000297537 TIMM23BQ5SRD1 257 aa20.59■□□□□ 0.89
GBX1-201ENST00000297537 PIK3C3Q8NEB9 887 aa20.59■□□□□ 0.89
GBX1-201ENST00000297537 NSMCE2Q96MF7 247 aa20.59■□□□□ 0.89
GBX1-201ENST00000297537 ALPK2Q86TB3 2170 aa20.59■□□□□ 0.89
GBX1-201ENST00000297537 HTR3EA5X5Y0 456 aa20.58■□□□□ 0.89
GBX1-201ENST00000297537 OR5H1A6NKK0 313 aa20.58■□□□□ 0.89
GBX1-201ENST00000297537 UPK3AO75631 287 aa20.58■□□□□ 0.89
GBX1-201ENST00000297537 UBOX5O94941 541 aa20.58■□□□□ 0.89
GBX1-201ENST00000297537 ADORA3P0DMS8 318 aa20.58■□□□□ 0.89
GBX1-201ENST00000297537 FUT1P19526 365 aa20.58■□□□□ 0.89
GBX1-201ENST00000297537 VLDLRP98155 873 aa20.58■□□□□ 0.89
GBX1-201ENST00000297537 LGALS3BPQ08380 585 aa20.58■□□□□ 0.89
GBX1-201ENST00000297537 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
GBX1-201ENST00000297537 OR7E24Q6IFN5 339 aa20.58■□□□□ 0.89
GBX1-201ENST00000297537 LINGO2Q7L985 606 aa20.58■□□□□ 0.89
GBX1-201ENST00000297537 TMEM123Q8N131 208 aa20.58■□□□□ 0.89
GBX1-201ENST00000297537 SGTBQ96EQ0 304 aa20.58■□□□□ 0.89
GBX1-201ENST00000297537 TXNDC15Q96J42 360 aa20.58■□□□□ 0.89
GBX1-201ENST00000297537 OR2M2Q96R28 347 aa20.58■□□□□ 0.89
GBX1-201ENST00000297537 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
GBX1-201ENST00000297537 ACTR3BQ9P1U1 418 aa20.58■□□□□ 0.89
GBX1-201ENST00000297537 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
GBX1-201ENST00000297537 A0A087WUU8 490 aa20.57■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 RAD51DO75771 328 aa20.57■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 OR7A10O76100 309 aa20.57■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 RHCEP18577 417 aa20.57■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 AHCYP23526 432 aa20.57■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 IL1RL1Q01638 556 aa20.57■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 BEX5Q5H9J7 111 aa20.57■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 WFDC8Q8IUA0 241 aa20.57■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 WDFY1Q8IWB7 410 aa20.57■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 ANKK1Q8NFD2 765 aa20.57■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 NRGNQ92686 78 aa20.57■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 PIK3IP1Q96FE7 263 aa20.57■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 HS3ST6Q96QI5 342 aa20.57■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 ANKRD19PQ9H560 264 aa20.57■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 A0A1W2PRQ8 180 aa20.56■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 CIB4A0PJX0 185 aa20.56■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa20.56■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 PIP5K1CO60331 668 aa20.56■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 SLC43A1O75387 559 aa20.56■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 HIST1H2ABP04908 130 aa20.56■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 DGCR6Q14129 220 aa20.56■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 FBXW10Q5XX13 1052 aa20.56■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa20.56■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 SSX8Q7RTT4 187 aa20.56■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 CYP4Z1Q86W10 505 aa20.56■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 HIST1H2ACQ93077 130 aa20.56■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 BPIFA2Q96DR5 249 aa20.56■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 LRR1Q96L50 414 aa20.56■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 EMC6Q9BV81 110 aa20.56■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 LIME1Q9H400 295 aa20.56■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 MED29Q9NX70 200 aa20.56■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 SLC35F4A4IF30 521 aa20.55■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 C11orf98E9PRG8 122 aa20.55■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 OR6A2O95222 327 aa20.55■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 UMPSP11172 480 aa20.55■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 MS4A2Q01362 244 aa20.55■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 TGFBR3Q03167 851 aa20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms