RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249504.6

HOXD11-201, Transcript of homeobox D11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD11, Length 1,533 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-201ENST00000249504 USP51Q70EK9 711 aa17.39■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 OAFQ86UD1 273 aa17.39■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 FAM26EQ8N5C1 309 aa17.39■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 OR5J2Q8NH18 312 aa17.39■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF417Q8TAU3 575 aa17.39■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 WNT2BQ93097 391 aa17.39■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 UCN2Q96RP3 112 aa17.39■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 TM9SF2Q99805 663 aa17.39■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 RIBC2Q9H4K1 309 aa17.39■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 SEC14L4Q9UDX3 406 aa17.39■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa17.38■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 MITFO75030 526 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 PTP4A3O75365 173 aa17.38■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 AKR7A3O95154 331 aa17.38■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 HIST1H2ABP04908 130 aa17.38■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 FCGR2AP12318 317 aa17.38■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 SMSP52788 366 aa17.38■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 ZBED5Q49AG3 693 aa17.38■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa17.38■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 UGT2A3Q6UWM9 527 aa17.38■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa17.38■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 SEM1Q6ZVN7 128 aa17.38■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa17.38■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa17.38■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 PARP8Q8N3A8 854 aa17.38■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 TMEM99Q8N816 258 aa17.38■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa17.38■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 FNDC9Q8TBE3 224 aa17.38■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 HIST1H2ACQ93077 130 aa17.38■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa17.38■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 GABARAPL3Q9BY60 117 aa17.38■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 CHST11Q9NPF2 352 aa17.38■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 UBAP1Q9NZ09 502 aa17.38■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 REV1Q9UBZ9 1251 aa17.38■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 SIGLEC7Q9Y286 467 aa17.38■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa17.38■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 HIF3AQ9Y2N7 669 aa17.38■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 TRAV27A0A087WT01 109 aa17.37■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 TP53P04637 393 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 KLK2P20151 261 aa17.37■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 ENPP1P22413 925 aa17.37■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 UQCRC1P31930 480 aa17.37■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 TIMP3P35625 211 aa17.37■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 P2RY4P51582 365 aa17.37■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 ADORA2A-AS1P86434 159 aa17.37■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 NPRL3Q12980 569 aa17.37■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 PMS2P3Q13401 168 aa17.37■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 KEAP1Q14145 624 aa17.37■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 KIF18BQ86Y91 864 aa17.37■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 C9orf106Q8NAJ2 232 aa17.37■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 OR51A7Q8NH64 312 aa17.37■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa17.37■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 GRIP2Q9C0E4 1043 aa17.37■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 MCCC2Q9HCC0 563 aa17.37■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 COQ3Q9NZJ6 369 aa17.37■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 AQP7P3A6NL99 342 aa17.37■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF814B7Z6K7 855 aa17.37■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 PLPP3O14495 311 aa17.37■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 ZG16O60844 167 aa17.37■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 TGM6O95932 706 aa17.37■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 GNAO1P09471 354 aa17.37■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 FXYD6P3P58550 94 aa17.37■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF620Q6ZNG0 422 aa17.37■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 CLDN22Q8N7P3 220 aa17.37■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 SETD9Q8NE22 299 aa17.37■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 TAS2R5Q9NYW4 299 aa17.37■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa17.36■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 TNFAIP8O95379 198 aa17.36■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 LYNP07948 512 aa17.36■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 OSMP13725 252 aa17.36■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP17.36■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 ZP4Q12836 540 aa17.36■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 SSC4DQ8WTU2 575 aa17.36■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 ZFP3Q96NJ6 502 aa17.36■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 OR52D1Q9H346 318 aa17.36■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 FANCFQ9NPI8 374 aa17.36■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 IL20Q9NYY1 176 aa17.36■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 CDH10Q9Y6N8 788 aa17.36■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa17.36■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa17.35■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 HSPB2A8KAH6 182 aa17.35■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 MS4A18H0YCH9 400 aa17.35■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 RAMP1O60894 148 aa17.35■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 TOXO94900 526 aa17.35■□□□□ 0.37
HOXD11-201ENST00000249504 RCBTB2O95199 551 aa17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.4 ms