RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249440.4

HOXD3-201, Transcript of homeobox D3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD3, Length 2,303 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD3-201ENST00000249440 FCRLAQ7L513 359 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXD3-201ENST00000249440 FAM122BQ7Z309 247 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXD3-201ENST00000249440 ZNF511Q8NB15 262 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXD3-201ENST00000249440 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXD3-201ENST00000249440 OIT3Q8WWZ8 545 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXD3-201ENST00000249440 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
HOXD3-201ENST00000249440 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
HOXD3-201ENST00000249440 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
HOXD3-201ENST00000249440 SLITRK2Q9H156 845 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXD3-201ENST00000249440 C20orf85Q9H1P6 137 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXD3-201ENST00000249440 KLHL9Q9P2J3 617 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXD3-201ENST00000249440 CD207Q9UJ71 328 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXD3-201ENST00000249440 RNF215Q9Y6U7 377 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXD3-201ENST00000249440 MEIKINA0A087WXM9 373 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXD3-201ENST00000249440 NAP1L6A6NFF2 107 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXD3-201ENST00000249440 TNFRSF10AO00220 468 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXD3-201ENST00000249440 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
HOXD3-201ENST00000249440 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
HOXD3-201ENST00000249440 PEX14O75381 377 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXD3-201ENST00000249440 SULT1A3P0DMM9 295 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXD3-201ENST00000249440 SULT1A4P0DMN0 295 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXD3-201ENST00000249440 UBL4AP11441 157 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXD3-201ENST00000249440 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
HOXD3-201ENST00000249440 CCR4P51679 360 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXD3-201ENST00000249440 CTXN1P60606 82 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXD3-201ENST00000249440 SERTAD2Q14140 314 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXD3-201ENST00000249440 BEST4Q8NFU0 473 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXD3-201ENST00000249440 HGDQ93099 445 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXD3-201ENST00000249440 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
HOXD3-201ENST00000249440 TCF7L1Q9HCS4 588 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXD3-201ENST00000249440 MMP25Q9NPA2 562 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXD3-201ENST00000249440 GPR27Q9NS67 375 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXD3-201ENST00000249440 RCE1Q9Y256 329 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXD3-201ENST00000249440 TMEM72A0PK05 275 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 PRR32B1ATL7 298 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 SCDO00767 359 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 SULT1B1O43704 296 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 RPP14O95059 124 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 RAB40ALP0C0E4 278 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 CCR9P51686 369 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 PER3P56645 1201 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 BIKQ13323 160 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 Q499Y3 187 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 FNDC7Q5VTL7 733 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 LRRC75AQ8NAA5 344 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 OR5AK2Q8NH90 309 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 FCAMRQ8WWV6 532 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 RAB40AQ8WXH6 277 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 TTC9Q92623 222 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 SLC25A38Q96DW6 304 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 MOGAT1Q96PD6 335 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 TSSK2Q96PF2 358 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 B3GNT2Q9NY97 397 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 CYP8B1Q9UNU6 501 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 C17orf105B2RV13 164 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 KRT33AO76009 404 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 ASAH2BP0C7U1 165 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 CALCBP10092 127 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 MAGEB1P43366 347 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 OR3A3P47888 321 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 MAZP56270 477 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 SKP2Q13309 424 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 CD226Q15762 336 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 TEX261Q6UWH6 196 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 OR11H4Q8NGC9 324 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 KLHDC7BQ96G42 594 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 LMF1Q96S06 567 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 LRRC61Q9BV99 259 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 HRASLSQ9HDD0 168 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 GRHPRQ9UBQ7 328 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 U3KQ87 197 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 GON4LQ3T8J9 2241 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 ZNF264O43296 627 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 PRAF2O60831 178 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 CLPSP04118 112 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 SYPP08247 313 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 OR8G3PP0DMU2 310 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 CAPZBP47756 277 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 LIPNQ5VXI9 398 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 CBLN3Q6UW01 205 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 STAC2Q6ZMT1 411 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 EXD3Q8N9H8 876 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 C7orf57Q8NEG2 295 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 OR52I2Q8NH67 350 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 SYNPRQ8TBG9 265 aa14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms