RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000023154.2

Cldn1-201, Transcript of Claudin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Cldn1, Length 3,247 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Tight Junction .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn1-201ENSMUST00000023154 PmpcaQ9DC61 524 aa8.36□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Moap1Q9ERH6 352 aa8.36□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Slco1b2Q9JJL3 689 aa8.36□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Asic5Q9R0Y1 495 aa8.36□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Bod1lE9Q6J5 3032 aa8.36□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Pcnx3Q8VI59 2028 aa8.35□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Tmem229aB9EJI9 371 aa8.35□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Rnf217D3YYI7 515 aa8.35□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Clcn7O70496 803 aa8.35□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 GzmeP08884 248 aa8.35□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Cers1P27545 350 aa8.35□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Cab39Q06138 341 aa8.35□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 UradQ283N4 178 aa8.35□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Dnaaf3Q3UYV8 586 aa8.35□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Gm732Q3V0P9 516 aa8.35□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Sgk494Q5SYL1 278 aa8.35□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Art1Q60935 325 aa8.35□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Dag1Q62165 893 aa8.35□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Doxl2Q6IMK7 723 aa8.35□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Exosc3Q7TQK4 274 aa8.35□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Serpinb9fQ80UK5 377 aa8.35□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Lpar4Q8BLG2 370 aa8.35□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Mettl6Q8BVH9 282 aa8.35□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Mterf4Q8BVN4 346 aa8.35□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Colec10Q8CF98 277 aa8.35□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 RfkQ8CFV9 155 aa8.35□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Prb1Q91X93 504 aa8.35□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Mgst3Q9CPU4 153 aa8.35□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Lpar2Q9JL06 348 aa8.35□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Dok3Q9QZK7 444 aa8.35□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Gm9008E9PVG0 424 aa8.35□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Rnf148G3X9R7 316 aa8.35□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 FxnO35943 207 aa8.35□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Tead3P70210 439 aa8.35□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 VwceQ3U515 929 aa8.35□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Slc39a12Q5FWH7 689 aa8.35□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Olfr1229Q7TQZ9 311 aa8.35□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Wdr92Q8BGF3 357 aa8.35□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Rnf26Q8BUH7 424 aa8.35□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Nudt9Q8BVU5 350 aa8.35□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 RybpQ8CCI5 228 aa8.35□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Rfwd3Q8CIK8 774 aa8.35□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Srpx2Q8R054 468 aa8.35□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Slc35a3Q8R1T4 326 aa8.35□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Mrpl24Q9CQ06 216 aa8.35□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Wdr45bQ9CR39 344 aa8.35□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Actl11Q9D5V1 1207 aa8.35□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Ift22Q9DAI2 185 aa8.35□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Ropn1lQ9EQ00 218 aa8.35□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Slc9a3r2Q9JHL1 337 aa8.35□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Gpc6Q9R087 555 aa8.35□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Acox1Q9R0H0 661 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 ClcnkaQ9WUB7 687 aa8.35□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 4930595D18RikD3Z642 64 aa8.35□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 MfngO09008 321 aa8.35□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Slc6a18O88576 615 aa8.35□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Tcn2O88968 430 aa8.35□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Pcyt1aP49586 367 aa8.35□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Copz1P61924 177 aa8.35□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Gm10644Q3TZG3 87 aa8.35□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Zfp235Q499D5 702 aa8.35□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 CrhbpQ60571 322 aa8.35□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Nr0b1Q61066 472 aa8.35□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Cxcl3Q6W5C0 100 aa8.35□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Gpatch2Q7TQC7 527 aa8.35□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Arhgap22Q8BL80 702 aa8.35□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Gm10283Q8C3L5 117 aa8.35□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 CipcQ8R0W1 432 aa8.35□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Olfr1346Q8VGH6 313 aa8.35□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Fmo4Q8VHG0 560 aa8.35□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Cacng6Q8VHW3 260 aa8.35□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Prmt3Q922H1 532 aa8.35□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Pycr1Q922W5 309 aa8.35□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Acy1Q99JW2 408 aa8.35□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Srfbp1Q9CZ91 441 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 UqcrbQ9D855 111 aa8.35□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Olfr937Q9EQB4 311 aa8.35□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 ClpxQ9JHS4 634 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Cyp11a1Q9QZ82 526 aa8.35□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Tbl2Q9R099 442 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Wnk2Q3UH66 2149 aa8.35□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Ighv6-6A0A075B5T3 119 aa8.34□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Olfr1025-ps1A0A140T8K3 312 aa8.34□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Sac3d1A6H687 427 aa8.34□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Smpd5D6MZJ6 483 aa8.34□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 NnmtO55239 264 aa8.34□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Gna13P27601 377 aa8.34□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 TesP47226 423 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Clec10aP49300 304 aa8.34□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Apoc2Q05020 97 aa8.34□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Fzd7Q61090 572 aa8.34□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Rpa2Q62193 270 aa8.34□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 St8sia4Q64692 359 aa8.34□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Kyat3Q71RI9 455 aa8.34□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Q80Y39 304 aa8.34□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Faim2Q8K097 317 aa8.34□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Mrgpra1Q91WW5 304 aa8.34□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 OgfrQ99PG2 633 aa8.34□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Ptp4a3Q9D658 173 aa8.34□□□□□ -1.07
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Ca13Q9D6N1 262 aa8.34□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 51.8 ms